175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4671 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4671  DoxX family protein  100 
 
 		 145 aa  286  5.0000000000000004e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.547503 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5199  DoxX family protein  98.62 
 
 		 145 aa  284  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.342492  normal  0.27185 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3412  DoxX family protein  87.59 
 
 		 145 aa  235  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.401045  normal  0.464952 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0336  DoxX family membrane protein  90.34 
 
 		 145 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2074  DoxD-like family protein  75.17 
 
 		 145 aa  229  8.000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.480184  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3056  DoxX  90.34 
 
 		 145 aa  229  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5311  DoxX family protein  90.34 
 
 		 145 aa  229  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.482098 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4958  DoxX family protein  90.34 
 
 		 145 aa  229  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00723227 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1426  DoxD-like family protein  75.17 
 
 		 145 aa  210  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.639544  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2188  DoxD-like family protein  75.17 
 
 		 145 aa  210  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39427  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0561  DoxX family membrane protein  75.17 
 
 		 145 aa  210  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0464  DoxX family protein  75.17 
 
 		 145 aa  210  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.412831  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0873  DoxD-like family protein  75.17 
 
 		 145 aa  210  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.660844  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1877  hypothetical protein  74.48 
 
 		 145 aa  207  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0867  membrane protein yphA  72.59 
 
 		 152 aa  203  8e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.271535 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4554  DoxX family protein  67.61 
 
 		 143 aa  201  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4661  DoxX family protein  65.03 
 
 		 145 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526141  normal  0.512029 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5400  DoxX family protein  46.27 
 
 		 137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358694  normal  0.0708806 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1209  hypothetical protein  46.56 
 
 		 137 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0177047  normal  0.393618 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3035  DoxX family protein  42.31 
 
 		 140 aa  105  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.156785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2695  hypothetical protein  42.74 
 
 		 155 aa  103  8e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1125  DoxX family protein  42.74 
 
 		 140 aa  103  9e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2696  putative inner membrane protein YphA  42.74 
 
 		 140 aa  103  9e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1134  DoxX family protein  42.74 
 
 		 140 aa  103  9e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3775  putative inner membrane protein YphA  42.74 
 
 		 140 aa  103  9e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2828  hypothetical protein  42.74 
 
 		 140 aa  103  9e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02435  predicted inner membrane protein  41.13 
 
 		 164 aa  103  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02399  hypothetical protein  41.13 
 
 		 164 aa  103  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6086  DoxX family protein  42.02 
 
 		 137 aa  92.8  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0786046  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3837  SURF4 domain-containing protein  40.32 
 
 		 137 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6046  DoxX family protein  36.92 
 
 		 137 aa  92  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.392213 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5848  DoxX family protein  41.18 
 
 		 137 aa  91.7  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1934  DoxX family protein  39.52 
 
 		 155 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.467271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1454  DoxX family protein  42.54 
 
 		 136 aa  90.5  7e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1413  DoxD-like family protein  41.9 
 
 		 182 aa  90.1  8e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.197847  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4440  DoxX family protein  41.07 
 
 		 139 aa  89.4  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.461632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3057  DoxX family protein  40.5 
 
 		 149 aa  89.7  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3976  DoxX family protein  41.67 
 
 		 174 aa  89  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.603426  decreased coverage  0.00896237 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4096  DoxX family protein  41.96 
 
 		 174 aa  89.4  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0554855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3706  DoxX family protein  37.88 
 
 		 137 aa  87.4  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2500  hypothetical protein  38.66 
 
 		 136 aa  87  8e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.831259  normal  0.0755951 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3122  DoxX family protein  37.82 
 
 		 139 aa  85.5  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461418  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3552  DoxX family protein  40.18 
 
 		 137 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.583897  normal  0.164311 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1542  DoxX  37.82 
 
 		 129 aa  84.3  5e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.294668  normal  0.482647 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1283  DoxX family protein  40.31 
 
 		 143 aa  84.3  5e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2360  DoxX family protein  39.5 
 
 		 136 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.233009 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3132  DoxX family protein  36.59 
 
 		 143 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4045  DoxX family protein  36.29 
 
 		 135 aa  83.2  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0512358 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2298  DoxX family protein  39.5 
 
 		 135 aa  81.3  0.000000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000018841  hitchhiker  0.00171371 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7619  DoxX  38.39 
 
 		 137 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6600  DoxX family protein  37.5 
 
 		 137 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.563715 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5753  DoxX  37.5 
 
 		 137 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6117  DoxX family protein  37.5 
 
 		 137 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.111641 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4094  hypothetical protein  39.55 
 
 		 140 aa  80.1  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.887917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3205  DoxX family protein  40.32 
 
 		 137 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4121  DoxX  35.34 
 
 		 129 aa  78.6  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.575367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1386  DoxX family protein  39.17 
 
 		 137 aa  78.2  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.42391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5222  DoxX family protein  38.33 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0354  DoxX  39.84 
 
 		 127 aa  75.9  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388731  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3021  DoxX family protein  35.77 
 
 		 133 aa  75.9  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.867125  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2385  DoxX family protein  35.25 
 
 		 131 aa  75.9  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0905931  normal  0.641291 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1243  DoxD-like family protein  42.59 
 
 		 167 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0214  DoxD-like family protein  42.59 
 
 		 167 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2902  DoxX family protein  40.2 
 
 		 142 aa  74.3  0.0000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0568871  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2151  transporter  36.97 
 
 		 132 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.447191  normal  0.895246 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2591  DoxD-like family protein  44.44 
 
 		 167 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1351  DoxX family protein  44.44 
 
 		 167 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0214907  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0487  DoxD-like family protein  42.59 
 
 		 137 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.328888  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1085  DoxX family protein  42.59 
 
 		 137 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4295  hypothetical protein  36.22 
 
 		 140 aa  73.6  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.023682 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1436  DoxX family protein  43.52 
 
 		 181 aa  72  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.921466  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1295  DoxX family membrane protein  38.39 
 
 		 178 aa  72  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174807  normal  0.980217 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4935  DoxX family protein  35.83 
 
 		 136 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000319097 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1966  DoxX family protein  41.74 
 
 		 140 aa  72  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0197798 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5753  DoxX family protein  39.29 
 
 		 139 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3817  DoxX  39.29 
 
 		 139 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4551  DoxX family protein  39.29 
 
 		 139 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.529147 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3348  DoxX  35.11 
 
 		 146 aa  70.9  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0716703  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02970  predicted quinol oxidase subunit  37.78 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0600  DoxX family protein  37.78 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4416  putative inner membrane protein YqjF  37.78 
 
 		 160 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.260448 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2633  DoxX  39.02 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02921  hypothetical protein  37.78 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0595  DoxX family protein  37.78 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3399  putative inner membrane protein YqjF  37.78 
 
 		 160 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3289  putative inner membrane protein YqjF  37.78 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1200  DoxX  36.7 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3420  putative inner membrane protein YqjF  36.3 
 
 		 161 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3493  hypothetical protein  36.3 
 
 		 161 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3527  hypothetical protein  36.3 
 
 		 161 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0510711 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3574  putative inner membrane protein YqjF  37.78 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3423  hypothetical protein  36.3 
 
 		 161 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.318649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1637  DoxX  36.29 
 
 		 137 aa  68.6  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00123238  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3904  DoxX family protein  45.37 
 
 		 136 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.501063  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0191  hypothetical protein  34.81 
 
 		 133 aa  67.8  0.00000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2930  DoxX family protein  32.12 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0701  DoxX family protein  40.65 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5841  DoxX  37.61 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0630  DoxX family protein  32.28 
 
 		 140 aa  67.8  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.470761  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3555  DoxX family protein  36.09 
 
 		 130 aa  67  0.00000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.453371 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>