30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1560 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1560  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  295  1e-79  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.243689  normal  0.115506 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1686  hypothetical protein  66.93 
 
 		 136 aa  155  2e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.961674  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16061  hypothetical protein  55.86 
 
 		 123 aa  112  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12531  hypothetical protein  45.53 
 
 		 143 aa  108  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16051  hypothetical protein  47.71 
 
 		 126 aa  106  9.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1486  hypothetical protein  46.9 
 
 		 126 aa  105  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0281989  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15881  hypothetical protein  47.22 
 
 		 126 aa  101  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.111902  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0936  hypothetical protein  43.01 
 
 		 133 aa  79.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.279314  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17931  hypothetical protein  41.94 
 
 		 133 aa  77.8  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.870563  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0630  DoxX family protein  35.43 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.470761  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1200  DoxX  42.86 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0860  DoxX  35.09 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.2035  normal  0.169459 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5841  DoxX  47.56 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2930  DoxX family protein  37.9 
 
 		 137 aa  51.6  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3973  DoxX family protein  41.27 
 
 		 135 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.72349 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2900  DoxX  35.66 
 
 		 136 aa  47  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290679  normal  0.557329 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3132  DoxX family protein  35.09 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5222  DoxX family protein  37.29 
 
 		 144 aa  47  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4045  DoxX family protein  35.19 
 
 		 135 aa  44.7  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0512358 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0354  DoxX  34.48 
 
 		 127 aa  44.7  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388731  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0014  hypothetical protein  35.11 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.133834  normal  0.506679 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2500  hypothetical protein  36.36 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.831259  normal  0.0755951 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3122  DoxX family protein  37.78 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461418  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09540  hypothetical protein  34.69 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4295  hypothetical protein  35.09 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.023682 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0893  hypothetical protein  33.67 
 
 		 148 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.825078  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3348  DoxX  36.14 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0716703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0099  DoxX family protein  34.88 
 
 		 145 aa  40.4  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00508391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0502  DoxX family membrane protein  34.65 
 
 		 146 aa  40.4  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2645  DoxX  33.33 
 
 		 130 aa  40.4  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.731985 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>