46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2382 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2382  DoxX family protein  100 
 
 
155 aa  309  1e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3707  DoxX family protein  46.77 
 
 
149 aa  99  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2221  DoxX family protein  40.18 
 
 
135 aa  88.2  4e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.631105 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2251  DoxX family protein  39.81 
 
 
146 aa  75.9  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.431284  normal  0.139813 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2817  DoxX family protein  40.2 
 
 
138 aa  75.1  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2564  DoxX family protein  41.46 
 
 
137 aa  74.7  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1365  DoxX family protein  37.04 
 
 
139 aa  71.2  0.000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0662293  normal  0.0953632 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2379  DoxX family protein  35.58 
 
 
121 aa  70.1  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.618537  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2081  DoxX family protein  36.79 
 
 
135 aa  64.7  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2087  DoxX  35.04 
 
 
119 aa  63.5  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2855  DoxX family protein  31.71 
 
 
379 aa  61.6  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00921996  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1200  DoxX  28.91 
 
 
139 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1701  DoxX family protein  33.33 
 
 
174 aa  53.5  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00286745  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0449  DoxX family protein  30.4 
 
 
182 aa  52.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4661  DoxX family protein  28 
 
 
145 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526141  normal  0.512029 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0630  DoxX family protein  30.28 
 
 
140 aa  49.3  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.470761  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5841  DoxX  30.63 
 
 
134 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0296  DoxX family protein  29.75 
 
 
271 aa  48.9  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39020  predicted membrane protein  28.23 
 
 
238 aa  47.8  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4671  DoxX family protein  32.22 
 
 
145 aa  47.4  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.547503 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5199  DoxX family protein  32.22 
 
 
145 aa  47  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.342492  normal  0.27185 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3348  DoxX  30.91 
 
 
146 aa  47  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0716703  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4554  DoxX family protein  28 
 
 
143 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0867  membrane protein yphA  28 
 
 
152 aa  46.2  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.271535 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4121  DoxX  30.16 
 
 
129 aa  46.6  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.575367  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3403  DoxX family protein  27.87 
 
 
276 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351564  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1422  DoxX family protein  40.22 
 
 
149 aa  46.2  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4104  DoxX family protein  48.89 
 
 
138 aa  45.4  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.434829  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3412  DoxX family protein  27.78 
 
 
145 aa  43.9  0.0009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.401045  normal  0.464952 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3130  DoxX family protein  33.33 
 
 
315 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.470972  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2360  DoxX family protein  28.81 
 
 
136 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.233009 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2500  hypothetical protein  25.89 
 
 
136 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.831259  normal  0.0755951 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3122  DoxX family protein  28.33 
 
 
139 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461418  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3552  DoxX family protein  31.63 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.583897  normal  0.164311 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0354  DoxX  32.73 
 
 
127 aa  42.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388731  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2074  DoxD-like family protein  27.78 
 
 
145 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.480184  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1934  DoxX family protein  28.07 
 
 
155 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.467271  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0860  DoxX  27.27 
 
 
136 aa  42.4  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.2035  normal  0.169459 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1209  hypothetical protein  28.71 
 
 
137 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0177047  normal  0.393618 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2554  DoxX family protein  27.05 
 
 
321 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225464  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2562  DoxX family protein  27.05 
 
 
321 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2517  DoxX  27.05 
 
 
321 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.114204  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1413  DoxD-like family protein  24.24 
 
 
182 aa  41.2  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.197847  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3837  SURF4 domain-containing protein  26.36 
 
 
137 aa  41.2  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5400  DoxX family protein  26.52 
 
 
137 aa  40.8  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358694  normal  0.0708806 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2341  DoxX  25.76 
 
 
152 aa  40.8  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201028  normal  0.120907 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>