42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2221 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2221  DoxX family protein  100 
 
 		 135 aa  268  2e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.631105 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3707  DoxX family protein  38.32 
 
 		 149 aa  80.1  0.000000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2817  DoxX family protein  35.64 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2564  DoxX family protein  37.27 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2382  DoxX family protein  37.76 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2087  DoxX  30.84 
 
 		 119 aa  59.3  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1701  DoxX family protein  35.23 
 
 		 174 aa  58.2  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00286745  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2251  DoxX family protein  32 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.431284  normal  0.139813 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2379  DoxX family protein  30.69 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.618537  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3122  DoxX family protein  31.62 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461418  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4121  DoxX  32.18 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.575367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0868  DoxX family protein  32.11 
 
 		 130 aa  47.8  0.00005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.879404  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0449  DoxX family protein  40.91 
 
 		 182 aa  47.8  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2930  DoxX family protein  31.82 
 
 		 137 aa  47  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3403  DoxX family protein  37.5 
 
 		 276 aa  47  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351564  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4045  DoxX family protein  25.93 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0512358 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2500  hypothetical protein  28.32 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.831259  normal  0.0755951 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2554  DoxX family protein  35.53 
 
 		 321 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225464  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2517  DoxX  35.53 
 
 		 321 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.114204  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3057  DoxX family protein  28.04 
 
 		 149 aa  45.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2562  DoxX family protein  35.53 
 
 		 321 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2900  DoxX  31.19 
 
 		 136 aa  45.1  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290679  normal  0.557329 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1209  hypothetical protein  25.69 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0177047  normal  0.393618 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6046  DoxX family protein  28.04 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.392213 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5400  DoxX family protein  25.86 
 
 		 137 aa  44.3  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358694  normal  0.0708806 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0302  DoxX family protein  33.75 
 
 		 136 aa  43.9  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0320339 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5848  DoxX family protein  26.61 
 
 		 137 aa  43.5  0.0009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6086  DoxX family protein  26.61 
 
 		 137 aa  43.5  0.0009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0786046  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3837  SURF4 domain-containing protein  30.63 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2855  DoxX family protein  30.86 
 
 		 379 aa  43.5  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00921996  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1365  DoxX family protein  27.1 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0662293  normal  0.0953632 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2360  DoxX family protein  30.09 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.233009 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1934  DoxX family protein  28.44 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.467271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18830  predicted membrane protein  36.07 
 
 		 226 aa  42.4  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18970  predicted membrane protein  36.07 
 
 		 236 aa  42.7  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.129095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5841  DoxX  30.83 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0014  hypothetical protein  27.83 
 
 		 142 aa  41.6  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.133834  normal  0.506679 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3132  DoxX family protein  30.84 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1387  hypothetical protein  27.27 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2498  DoxX  26.98 
 
 		 149 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3130  DoxX family protein  29.41 
 
 		 315 aa  40.8  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.470972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1454  DoxX family protein  25.69 
 
 		 136 aa  40.4  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>