67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0449 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0449  DoxX family protein  100 
 
 		 182 aa  363  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2855  DoxX family protein  52.05 
 
 		 379 aa  162  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00921996  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1701  DoxX family protein  57.43 
 
 		 174 aa  157  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00286745  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2554  DoxX family protein  42.67 
 
 		 321 aa  138  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225464  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2562  DoxX family protein  42.67 
 
 		 321 aa  138  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2517  DoxX  42.67 
 
 		 321 aa  138  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.114204  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3130  DoxX family protein  40.51 
 
 		 315 aa  134  5e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.470972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3403  DoxX family protein  41.18 
 
 		 276 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351564  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39020  predicted membrane protein  42.7 
 
 		 238 aa  132  3e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0296  DoxX family protein  45.52 
 
 		 271 aa  122  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18970  predicted membrane protein  41.61 
 
 		 236 aa  106  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.129095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4544  DoxX family protein  40 
 
 		 181 aa  104  7e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.573172 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5054  DoxX family protein  43.66 
 
 		 181 aa  97.8  7e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2385  DoxX family protein  35.71 
 
 		 182 aa  96.3  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000239673 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18830  predicted membrane protein  39.44 
 
 		 226 aa  92  4e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2652  DoxX family protein  37.91 
 
 		 182 aa  87.4  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000120854  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2087  DoxX  43.09 
 
 		 119 aa  86.7  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1210  DoxX family protein  40 
 
 		 176 aa  84.3  8e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0688869 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19460  hypothetical protein  34.62 
 
 		 188 aa  76.3  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.635094  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2493  DoxX family protein  35.54 
 
 		 158 aa  74.3  0.0000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.3994  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1264  DoxX family protein  37.79 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157094  normal  0.163775 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09480  hypothetical protein  41.26 
 
 		 192 aa  73.2  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1811  hypothetical protein  33.33 
 
 		 161 aa  71.2  0.000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1208  DoxX family protein  31.1 
 
 		 182 aa  70.9  0.000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0545  hypothetical protein  30.15 
 
 		 175 aa  63.9  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3712  DoxX family protein  43.24 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.803576  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0868  DoxX family protein  37.82 
 
 		 130 aa  59.3  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.879404  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3837  SURF4 domain-containing protein  44.12 
 
 		 137 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1934  DoxX family protein  44.12 
 
 		 155 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.467271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3552  DoxX family protein  41.18 
 
 		 137 aa  50.8  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.583897  normal  0.164311 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0302  DoxX family protein  38.1 
 
 		 136 aa  50.4  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0320339 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6086  DoxX family protein  33.33 
 
 		 137 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0786046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5848  DoxX family protein  33.33 
 
 		 137 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3205  DoxX family protein  41.18 
 
 		 137 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4554  DoxX family protein  28.97 
 
 		 143 aa  49.3  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1209  hypothetical protein  33.78 
 
 		 137 aa  48.9  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0177047  normal  0.393618 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2074  DoxD-like family protein  28.26 
 
 		 145 aa  48.5  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.480184  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5841  DoxX  41.27 
 
 		 134 aa  48.5  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1200  DoxX  39.68 
 
 		 139 aa  48.1  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0867  membrane protein yphA  28.99 
 
 		 152 aa  48.5  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.271535 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0860  DoxX  29.63 
 
 		 136 aa  47.8  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.2035  normal  0.169459 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2221  DoxX family protein  40.91 
 
 		 135 aa  47.8  0.00009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.631105 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5400  DoxX family protein  32.43 
 
 		 137 aa  47.8  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358694  normal  0.0708806 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4671  DoxX family protein  32.94 
 
 		 145 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.547503 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6046  DoxX family protein  30.38 
 
 		 137 aa  46.6  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.392213 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3706  DoxX family protein  33.33 
 
 		 137 aa  47  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5199  DoxX family protein  32.94 
 
 		 145 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.342492  normal  0.27185 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3877  hypothetical protein  30.83 
 
 		 151 aa  45.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52615  normal  0.304969 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3412  DoxX family protein  32.39 
 
 		 145 aa  45.4  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.401045  normal  0.464952 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3057  DoxX family protein  36.49 
 
 		 149 aa  45.4  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0862  DoxX family membrane protein  35.37 
 
 		 136 aa  44.7  0.0008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4661  DoxX family protein  32 
 
 		 145 aa  44.3  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526141  normal  0.512029 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2327  DoxX  31.65 
 
 		 135 aa  44.3  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0405527  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0336  DoxX family membrane protein  33.33 
 
 		 145 aa  43.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7619  DoxX  34.92 
 
 		 137 aa  43.5  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1172  hypothetical membrane spanning protein  32.43 
 
 		 142 aa  43.1  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2109  DoxX  25.58 
 
 		 150 aa  42.7  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1386  DoxX family protein  31.11 
 
 		 137 aa  42.7  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.42391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0556  DoxX family protein  30.12 
 
 		 145 aa  42.7  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0630  DoxX family protein  31.51 
 
 		 140 aa  42  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.470761  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3056  DoxX  29.82 
 
 		 145 aa  41.6  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2498  DoxX  34.67 
 
 		 149 aa  41.6  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4958  DoxX family protein  29.82 
 
 		 145 aa  41.6  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00723227 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5311  DoxX family protein  29.82 
 
 		 145 aa  41.6  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.482098 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4096  DoxX family protein  31.08 
 
 		 174 aa  41.2  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0554855  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2360  DoxX family protein  31.08 
 
 		 136 aa  41.2  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.233009 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1365  DoxX family protein  36.21 
 
 		 139 aa  41.2  0.009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0662293  normal  0.0953632 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>