43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3130 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3130  DoxX family protein  100 
 
 		 315 aa  602  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.470972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2554  DoxX family protein  70.03 
 
 		 321 aa  398  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225464  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2517  DoxX  70.03 
 
 		 321 aa  398  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.114204  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2562  DoxX family protein  70.03 
 
 		 321 aa  398  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3403  DoxX family protein  72.7 
 
 		 276 aa  348  6e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351564  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2855  DoxX family protein  46.5 
 
 		 379 aa  224  1e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00921996  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0449  DoxX family protein  40.69 
 
 		 182 aa  125  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1701  DoxX family protein  40.14 
 
 		 174 aa  119  6e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00286745  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39020  predicted membrane protein  38.89 
 
 		 238 aa  105  8e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0296  DoxX family protein  29.67 
 
 		 271 aa  92  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18970  predicted membrane protein  34.01 
 
 		 236 aa  89  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.129095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4544  DoxX family protein  39.86 
 
 		 181 aa  88.2  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.573172 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5054  DoxX family protein  39.16 
 
 		 181 aa  85.9  8e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1210  DoxX family protein  37.16 
 
 		 176 aa  84.7  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0688869 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2652  DoxX family protein  33.77 
 
 		 182 aa  82.8  0.000000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000120854  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1264  DoxX family protein  39.46 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157094  normal  0.163775 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18830  predicted membrane protein  32.86 
 
 		 226 aa  77.8  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2385  DoxX family protein  34.25 
 
 		 182 aa  77.4  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000239673 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2087  DoxX  33.87 
 
 		 119 aa  75.5  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1811  hypothetical protein  32.7 
 
 		 161 aa  72  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19460  hypothetical protein  31.21 
 
 		 188 aa  70.5  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.635094  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1208  DoxX family protein  30 
 
 		 182 aa  62.8  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2493  DoxX family protein  34.39 
 
 		 158 aa  61.2  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.3994  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09480  hypothetical protein  29.17 
 
 		 192 aa  58.2  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0545  hypothetical protein  31.88 
 
 		 175 aa  57.8  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3712  DoxX family protein  41.74 
 
 		 190 aa  57  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.803576  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1934  DoxX family protein  30.22 
 
 		 155 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.467271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1394  protein of unknown function DUF883, ElaB  51.61 
 
 		 142 aa  52.8  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.188746 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3837  SURF4 domain-containing protein  29.5 
 
 		 137 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3552  DoxX family protein  34.83 
 
 		 137 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.583897  normal  0.164311 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3205  DoxX family protein  39.13 
 
 		 137 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0081  DoxX family protein  34.62 
 
 		 175 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.614954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5841  DoxX  33.33 
 
 		 134 aa  47.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0556  DoxX family protein  26.71 
 
 		 145 aa  47.4  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2109  DoxX  28.47 
 
 		 150 aa  46.6  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1365  DoxX family protein  37.66 
 
 		 139 aa  45.4  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0662293  normal  0.0953632 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3412  DoxX family protein  27.66 
 
 		 145 aa  43.9  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.401045  normal  0.464952 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2498  DoxX  26.12 
 
 		 149 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47694  predicted protein  29.81 
 
 		 355 aa  43.5  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0222477  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2385  DoxX family protein  29.93 
 
 		 131 aa  43.5  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0905931  normal  0.641291 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3706  DoxX family protein  30.85 
 
 		 137 aa  42.7  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0868  DoxX family protein  28.81 
 
 		 130 aa  42.7  0.008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.879404  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2500  hypothetical protein  31.11 
 
 		 136 aa  42.7  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.831259  normal  0.0755951 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>