27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3712 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3712  DoxX family protein  100 
 
 
190 aa  356  9.999999999999999e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.803576  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2855  DoxX family protein  44.27 
 
 
379 aa  108  6e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00921996  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2517  DoxX  40.77 
 
 
321 aa  101  7e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.114204  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2562  DoxX family protein  40.77 
 
 
321 aa  101  7e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2554  DoxX family protein  40.77 
 
 
321 aa  101  7e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225464  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0449  DoxX family protein  40.46 
 
 
182 aa  95.9  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3403  DoxX family protein  39.23 
 
 
276 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351564  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3130  DoxX family protein  38.64 
 
 
315 aa  92  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.470972  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0545  hypothetical protein  42.55 
 
 
175 aa  91.7  6e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1701  DoxX family protein  37.04 
 
 
174 aa  82  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00286745  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4544  DoxX family protein  38.52 
 
 
181 aa  77  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.573172 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39020  predicted membrane protein  39.52 
 
 
238 aa  76.6  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2087  DoxX  36.43 
 
 
119 aa  74.7  0.0000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18970  predicted membrane protein  36.96 
 
 
236 aa  74.3  0.0000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.129095  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5054  DoxX family protein  36.89 
 
 
181 aa  74.3  0.0000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2385  DoxX family protein  33.16 
 
 
182 aa  70.9  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000239673 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2652  DoxX family protein  35.29 
 
 
182 aa  68.9  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000120854  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0296  DoxX family protein  38.1 
 
 
271 aa  68.2  0.00000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1264  DoxX family protein  38.6 
 
 
223 aa  67.8  0.00000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157094  normal  0.163775 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1210  DoxX family protein  41.51 
 
 
176 aa  67  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0688869 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0868  DoxX family protein  38.17 
 
 
130 aa  58.9  0.00000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.879404  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18830  predicted membrane protein  35.16 
 
 
226 aa  58.2  0.00000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2081  DoxX family protein  30.97 
 
 
135 aa  44.3  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1208  DoxX family protein  34.86 
 
 
182 aa  44.3  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3877  hypothetical protein  30.91 
 
 
151 aa  42  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52615  normal  0.304969 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1811  hypothetical protein  32.84 
 
 
161 aa  41.6  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2109  DoxX  28.15 
 
 
150 aa  41.2  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>