28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1264 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1264  DoxX family protein  100 
 
 
223 aa  429  1e-119  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157094  normal  0.163775 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2855  DoxX family protein  44.97 
 
 
379 aa  114  8.999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00921996  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18970  predicted membrane protein  37.82 
 
 
236 aa  99  5e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.129095  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3130  DoxX family protein  41.26 
 
 
315 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.470972  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3403  DoxX family protein  41.13 
 
 
276 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351564  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39020  predicted membrane protein  43.04 
 
 
238 aa  90.9  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2517  DoxX  40.43 
 
 
321 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.114204  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2562  DoxX family protein  40.43 
 
 
321 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2554  DoxX family protein  40.43 
 
 
321 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225464  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1701  DoxX family protein  35.76 
 
 
174 aa  89.4  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00286745  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0449  DoxX family protein  39.72 
 
 
182 aa  88.6  7e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18830  predicted membrane protein  36.99 
 
 
226 aa  88.2  9e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2493  DoxX family protein  42.86 
 
 
158 aa  87.8  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.3994  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2385  DoxX family protein  36.17 
 
 
182 aa  87.4  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000239673 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2652  DoxX family protein  36.36 
 
 
182 aa  86.3  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000120854  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1210  DoxX family protein  44.83 
 
 
176 aa  79  0.00000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0688869 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09480  hypothetical protein  35.42 
 
 
192 aa  77.8  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322851  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1208  DoxX family protein  36.75 
 
 
182 aa  77.4  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19460  hypothetical protein  37.28 
 
 
188 aa  73.6  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.635094  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1811  hypothetical protein  33.78 
 
 
161 aa  73.6  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2087  DoxX  32.54 
 
 
119 aa  63.9  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5054  DoxX family protein  39.04 
 
 
181 aa  63.9  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4544  DoxX family protein  36.67 
 
 
181 aa  58.2  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.573172 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0296  DoxX family protein  32.65 
 
 
271 aa  57.8  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0545  hypothetical protein  30.88 
 
 
175 aa  52.4  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3712  DoxX family protein  38.6 
 
 
190 aa  47.8  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.803576  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1718  DoxX family protein  30.47 
 
 
141 aa  47.4  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2385  DoxX family protein  32.58 
 
 
131 aa  42.4  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0905931  normal  0.641291 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>