31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1210 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1210  DoxX family protein  100 
 
 		 176 aa  339  1e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0688869 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2855  DoxX family protein  45.14 
 
 		 379 aa  127  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00921996  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1701  DoxX family protein  38.12 
 
 		 174 aa  119  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00286745  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2517  DoxX  38.19 
 
 		 321 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.114204  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2562  DoxX family protein  38.19 
 
 		 321 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2554  DoxX family protein  38.19 
 
 		 321 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225464  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3403  DoxX family protein  39.86 
 
 		 276 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351564  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3130  DoxX family protein  37.16 
 
 		 315 aa  105  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.470972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2385  DoxX family protein  41.72 
 
 		 182 aa  104  7e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000239673 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2652  DoxX family protein  42.38 
 
 		 182 aa  103  9e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000120854  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0449  DoxX family protein  40.44 
 
 		 182 aa  103  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4544  DoxX family protein  42.44 
 
 		 181 aa  96.3  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.573172 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5054  DoxX family protein  43.14 
 
 		 181 aa  91.7  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0296  DoxX family protein  35.71 
 
 		 271 aa  87.4  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2087  DoxX  40.65 
 
 		 119 aa  86.3  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1264  DoxX family protein  44.83 
 
 		 223 aa  84.3  7e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157094  normal  0.163775 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18970  predicted membrane protein  34.12 
 
 		 236 aa  84  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.129095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39020  predicted membrane protein  34.64 
 
 		 238 aa  76.6  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1811  hypothetical protein  37.84 
 
 		 161 aa  72.8  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18830  predicted membrane protein  32.5 
 
 		 226 aa  70.9  0.000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19460  hypothetical protein  39.16 
 
 		 188 aa  68.2  0.00000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.635094  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2493  DoxX family protein  38.1 
 
 		 158 aa  64.3  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.3994  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1208  DoxX family protein  33.53 
 
 		 182 aa  61.2  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09480  hypothetical protein  40.83 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0868  DoxX family protein  38.74 
 
 		 130 aa  53.9  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.879404  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0556  DoxX family protein  26.47 
 
 		 145 aa  49.3  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3712  DoxX family protein  41.51 
 
 		 190 aa  47  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.803576  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0081  DoxX family protein  45.95 
 
 		 175 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.614954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0545  hypothetical protein  33.33 
 
 		 175 aa  45.4  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1365  DoxX family protein  27.64 
 
 		 139 aa  43.1  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0662293  normal  0.0953632 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4554  DoxX family protein  26.32 
 
 		 143 aa  41.2  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>