28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2652 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2652  DoxX family protein  100 
 
 
182 aa  353  8.999999999999999e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000120854  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2385  DoxX family protein  80.77 
 
 
182 aa  294  5e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000239673 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1701  DoxX family protein  38.29 
 
 
174 aa  109  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00286745  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2855  DoxX family protein  43.54 
 
 
379 aa  103  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00921996  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18970  predicted membrane protein  37.97 
 
 
236 aa  93.2  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.129095  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2517  DoxX  37.75 
 
 
321 aa  87  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.114204  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2562  DoxX family protein  37.75 
 
 
321 aa  87  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2554  DoxX family protein  37.75 
 
 
321 aa  87  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225464  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0449  DoxX family protein  35.91 
 
 
182 aa  85.9  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3130  DoxX family protein  34.25 
 
 
315 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.470972  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3403  DoxX family protein  36.3 
 
 
276 aa  78.6  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351564  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18830  predicted membrane protein  36.91 
 
 
226 aa  77.8  0.00000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1210  DoxX family protein  42.38 
 
 
176 aa  77  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0688869 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0296  DoxX family protein  31.94 
 
 
271 aa  72.8  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5054  DoxX family protein  41.72 
 
 
181 aa  70.5  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1264  DoxX family protein  34.55 
 
 
223 aa  68.9  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157094  normal  0.163775 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39020  predicted membrane protein  33.75 
 
 
238 aa  66.6  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4544  DoxX family protein  35 
 
 
181 aa  60.8  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.573172 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0545  hypothetical protein  31.39 
 
 
175 aa  58.5  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1811  hypothetical protein  30 
 
 
161 aa  55.5  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2087  DoxX  34.13 
 
 
119 aa  52.8  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1208  DoxX family protein  30.3 
 
 
182 aa  52.8  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19460  hypothetical protein  29.57 
 
 
188 aa  50.1  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.635094  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4497  DoxX family protein  31.03 
 
 
129 aa  43.1  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09480  hypothetical protein  31.72 
 
 
192 aa  43.1  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322851  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2945  DoxX  25.87 
 
 
150 aa  42.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1934  DoxX family protein  29.1 
 
 
155 aa  41.6  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.467271  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3837  SURF4 domain-containing protein  29.1 
 
 
137 aa  40.8  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  0.973533 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>