55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1394 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1394  protein of unknown function DUF883, ElaB  100 
 
 		 142 aa  271  2.0000000000000002e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.188746 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24770  hypothetical protein  34.83 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2098  hypothetical protein  34.83 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2517  DoxX  41.03 
 
 		 321 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.114204  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2554  DoxX family protein  41.03 
 
 		 321 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225464  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3130  DoxX family protein  51.61 
 
 		 315 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.470972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2562  DoxX family protein  41.03 
 
 		 321 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3969  vesicle-fusing ATPase  35.24 
 
 		 104 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.938878  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0523  hypothetical protein  34.48 
 
 		 101 aa  48.1  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1624  protein of unknown function DUF883 ElaB  38.82 
 
 		 104 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.119458 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0162  protein of unknown function DUF883 ElaB  31.58 
 
 		 108 aa  46.2  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.28952 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28490  hypothetical protein  36.73 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000161534 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0741  protein of unknown function DUF883 ElaB  33.33 
 
 		 101 aa  45.4  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1647  protein of unknown function DUF883 ElaB  34.23 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.266219  normal  0.620994 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3634  protein of unknown function DUF883, ElaB  37.65 
 
 		 104 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.889919 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3516  protein of unknown function DUF883 ElaB  39.13 
 
 		 101 aa  43.9  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.215037  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2485  hypothetical protein  35.21 
 
 		 109 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2105  hypothetical protein  37.65 
 
 		 104 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.178666  normal  0.0591454 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0878  protein of unknown function DUF883, ElaB  50 
 
 		 118 aa  43.9  0.0008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000255055  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2224  hypothetical protein  30.83 
 
 		 196 aa  43.5  0.0009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3552  protein of unknown function DUF883, ElaB  31.52 
 
 		 101 aa  43.5  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.674047 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47694  predicted protein  27.05 
 
 		 355 aa  43.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0222477  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3000  protein of unknown function DUF883, ElaB  36.76 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.876855  hitchhiker  0.0000209502 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2334  hypothetical protein  60.71 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.666966  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2118  hypothetical protein  60.71 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.365861  normal  0.361431 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0015  putative transmembrane protein  39.82 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0870168  normal  0.721209 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0780  protein of unknown function DUF883 ElaB  29.29 
 
 		 100 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.558861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3904  protein of unknown function DUF883, ElaB  29.29 
 
 		 100 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2572  protein of unknown function DUF883 ElaB  30 
 
 		 100 aa  41.6  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.459799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0328  protein of unknown function DUF883, ElaB  29.29 
 
 		 100 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0811  protein of unknown function DUF883, ElaB  29.29 
 
 		 100 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.865476  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3586  hypothetical protein  32.61 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.216587 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3417  hypothetical protein  32.61 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3420  hypothetical protein  32.61 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.971949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2150  protein of unknown function DUF883 ElaB  68 
 
 		 105 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000145562 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3524  hypothetical protein  32.61 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0255655 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3490  hypothetical protein  32.61 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0675  protein of unknown function DUF883 ElaB  57.14 
 
 		 103 aa  41.2  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0651  hypothetical protein  25 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1387  hypothetical protein  27.66 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3430  protein of unknown function DUF883 ElaB  32.81 
 
 		 106 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.468728  normal  0.845748 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1933  hypothetical protein  27.66 
 
 		 100 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.650648  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2067  hypothetical protein  27.66 
 
 		 100 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.58062  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3240  transmembrane protein  27.66 
 
 		 100 aa  40.4  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0843  hypothetical protein  27.66 
 
 		 100 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.892742  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3225  hypothetical protein  28.7 
 
 		 139 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.363799  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1806  protein of unknown function DUF883, ElaB  38.16 
 
 		 97 aa  40.4  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.55805  normal  0.0781076 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4328  protein of unknown function DUF883 ElaB  36.07 
 
 		 101 aa  40.4  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.133585 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3187  hypothetical protein  28.7 
 
 		 139 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2676  hypothetical protein  28.7 
 
 		 139 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.470235  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18990  hypothetical protein  40.74 
 
 		 104 aa  40.4  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.607849  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3718  protein of unknown function DUF883 ElaB  27.38 
 
 		 102 aa  40.4  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2440  protein of unknown function DUF883 ElaB  34.62 
 
 		 100 aa  40  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0175946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0709  protein of unknown function DUF883 ElaB  33.33 
 
 		 100 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0991967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0692  protein of unknown function DUF883, ElaB  33.33 
 
 		 100 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143345  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>