55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1422 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1422  DoxX family protein  100 
 
 		 149 aa  289  1e-77  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3707  DoxX family protein  61.33 
 
 		 149 aa  177  4e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2251  DoxX family protein  64.14 
 
 		 146 aa  156  8e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.431284  normal  0.139813 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2817  DoxX family protein  62.88 
 
 		 138 aa  153  9e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2564  DoxX family protein  57.66 
 
 		 137 aa  138  3e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1365  DoxX family protein  46.02 
 
 		 139 aa  95.1  3e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0662293  normal  0.0953632 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2379  DoxX family protein  42.31 
 
 		 121 aa  93.2  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.618537  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2081  DoxX family protein  37.86 
 
 		 135 aa  71.2  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2221  DoxX family protein  38.39 
 
 		 135 aa  70.1  0.000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.631105 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2877  DoxX family protein  36.89 
 
 		 136 aa  67  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2382  DoxX family protein  45 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3329  DoxX family protein  38.46 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3348  DoxX  34.43 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0716703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2087  DoxX  36.52 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0630  DoxX family protein  32.32 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.470761  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0014  hypothetical protein  33.06 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.133834  normal  0.506679 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2855  DoxX family protein  38.27 
 
 		 379 aa  50.1  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00921996  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4104  DoxX family protein  40.16 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.434829  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0868  DoxX family protein  34.65 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.879404  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4121  DoxX  30.97 
 
 		 129 aa  48.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.575367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1934  DoxX family protein  31.54 
 
 		 155 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.467271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4661  DoxX family protein  37.78 
 
 		 145 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526141  normal  0.512029 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3837  SURF4 domain-containing protein  36.07 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1701  DoxX family protein  39.22 
 
 		 174 aa  44.7  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00286745  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3122  DoxX family protein  29.91 
 
 		 139 aa  45.1  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461418  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1718  DoxX family protein  32.26 
 
 		 141 aa  45.1  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0354  DoxX  35.04 
 
 		 127 aa  44.7  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388731  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2151  transporter  31.58 
 
 		 132 aa  44.3  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.447191  normal  0.895246 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1542  DoxX  29.66 
 
 		 129 aa  43.9  0.0007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.294668  normal  0.482647 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0867  membrane protein yphA  28.23 
 
 		 152 aa  43.9  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.271535 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4045  DoxX family protein  28.93 
 
 		 135 aa  43.9  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0512358 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4554  DoxX family protein  26.61 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5841  DoxX  29.77 
 
 		 134 aa  42  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0449  DoxX family protein  34.48 
 
 		 182 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1172  hypothetical membrane spanning protein  30.43 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3057  DoxX family protein  29.27 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5848  DoxX family protein  28.57 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3132  DoxX family protein  29.57 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0302  DoxX family protein  33.04 
 
 		 136 aa  42  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0320339 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2385  DoxX family protein  31.78 
 
 		 131 aa  42  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0905931  normal  0.641291 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6086  DoxX family protein  28.57 
 
 		 137 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0786046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2730  DoxX family protein  30.58 
 
 		 126 aa  42  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.368422  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2930  DoxX family protein  27.91 
 
 		 137 aa  41.2  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1200  DoxX  26.87 
 
 		 139 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18970  predicted membrane protein  31.36 
 
 		 236 aa  41.6  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.129095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4094  hypothetical protein  30.25 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.887917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6117  DoxX family protein  27.62 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.111641 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6600  DoxX family protein  27.62 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.563715 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5753  DoxX  27.62 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3552  DoxX family protein  38.78 
 
 		 137 aa  40.4  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.583897  normal  0.164311 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2517  DoxX  39.29 
 
 		 321 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.114204  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2562  DoxX family protein  39.29 
 
 		 321 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2554  DoxX family protein  39.29 
 
 		 321 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225464  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39020  predicted membrane protein  30.3 
 
 		 238 aa  40.4  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1386  DoxX family protein  30.58 
 
 		 137 aa  40.4  0.009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.42391  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>