56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3329 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3329  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  253  6e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.517461  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1517  DoxX family protein  73.98 
 
 		 138 aa  186  9e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000129276  hitchhiker  0.00151008 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1387  hypothetical protein  70 
 
 		 128 aa  175  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2327  DoxX  46.67 
 
 		 135 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0405527  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2498  DoxX  28.24 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2385  DoxX family protein  31.86 
 
 		 131 aa  54.3  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0905931  normal  0.641291 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1200  DoxX  31.25 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5841  DoxX  29.82 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3057  DoxX family protein  32.46 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3706  DoxX family protein  30 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0014  hypothetical protein  28.21 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.133834  normal  0.506679 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3877  hypothetical protein  28.57 
 
 		 151 aa  51.6  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52615  normal  0.304969 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2341  DoxX  26.92 
 
 		 152 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201028  normal  0.120907 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1934  DoxX family protein  32.48 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.467271  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2500  hypothetical protein  32.74 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.831259  normal  0.0755951 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2945  DoxX  25.19 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0867  membrane protein yphA  27.73 
 
 		 152 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.271535 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4554  DoxX family protein  27.73 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3837  SURF4 domain-containing protein  31.62 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1454  DoxX family protein  34.75 
 
 		 136 aa  47.8  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3035  DoxX family protein  25.86 
 
 		 140 aa  47.4  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.156785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5848  DoxX family protein  29.6 
 
 		 137 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0860  DoxX  31.9 
 
 		 136 aa  47.4  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.2035  normal  0.169459 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3451  DoxX family protein  29.13 
 
 		 145 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.182426  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4935  DoxX family protein  30.09 
 
 		 136 aa  47  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000319097 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2817  DoxX family protein  25.96 
 
 		 138 aa  47  0.00009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6086  DoxX family protein  29.2 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0786046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5400  DoxX family protein  30.91 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358694  normal  0.0708806 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1932  DoxX family protein  31.48 
 
 		 137 aa  46.2  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.486729 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3205  DoxX family protein  31.9 
 
 		 137 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2360  DoxX family protein  33.63 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.233009 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3348  DoxX  28.81 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0716703  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02435  predicted inner membrane protein  25.86 
 
 		 164 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02399  hypothetical protein  25.86 
 
 		 164 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3522  DoxX family protein  29.21 
 
 		 125 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0254213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3552  DoxX family protein  30.69 
 
 		 137 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.583897  normal  0.164311 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1125  DoxX family protein  25.86 
 
 		 140 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3775  putative inner membrane protein YphA  25.86 
 
 		 140 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2696  putative inner membrane protein YphA  25.86 
 
 		 140 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1134  DoxX family protein  25.86 
 
 		 140 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2828  hypothetical protein  25.86 
 
 		 140 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2695  hypothetical protein  25.86 
 
 		 155 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4295  hypothetical protein  30.65 
 
 		 140 aa  44.3  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.023682 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1209  hypothetical protein  28.7 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0177047  normal  0.393618 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1637  DoxX  30.63 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00123238  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4045  DoxX family protein  27.68 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0512358 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5054  DoxX family protein  30.58 
 
 		 181 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2087  DoxX  24.77 
 
 		 119 aa  42  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4121  DoxX  26.15 
 
 		 129 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.575367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4661  DoxX family protein  26.8 
 
 		 145 aa  41.2  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526141  normal  0.512029 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3132  DoxX family protein  29.91 
 
 		 143 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4810  DoxX  27.64 
 
 		 147 aa  41.2  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2109  DoxX  22.9 
 
 		 150 aa  41.2  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0701  DoxX family protein  32.2 
 
 		 128 aa  40.4  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1542  DoxX  27.97 
 
 		 129 aa  40.8  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.294668  normal  0.482647 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2221  DoxX family protein  24.07 
 
 		 135 aa  40.4  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.631105 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>