65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2934 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2934  DoxX family protein  100 
 
 		 143 aa  280  3.0000000000000004e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173243  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1344  DoxX family protein  87.41 
 
 		 143 aa  246  6e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.197764  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1247  DoxX family protein  69.23 
 
 		 143 aa  199  9.999999999999999e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000114768  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2661  DoxX family protein  69.29 
 
 		 140 aa  196  1.0000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.204335  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1388  DoxX family protein  51.43 
 
 		 144 aa  148  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3090  DoxX family protein  53.33 
 
 		 144 aa  146  8e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.434652  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1187  DoxX family protein  51.85 
 
 		 144 aa  146  8e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0829  DoxX family protein  52.38 
 
 		 140 aa  136  7.999999999999999e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1621  DoxX family protein  51.94 
 
 		 138 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000382951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0059  DoxX family protein  50.78 
 
 		 128 aa  125  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41597  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2799  DoxX family protein  48.87 
 
 		 144 aa  124  4.0000000000000003e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0830  DoxX family protein  47.01 
 
 		 149 aa  122  2e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0096  DoxX  50.41 
 
 		 131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0945  DoxX family protein  42.54 
 
 		 136 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0728  hypothetical protein  42.97 
 
 		 138 aa  113  7.999999999999999e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1503  DoxX family protein  43.41 
 
 		 130 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4416  DoxX family protein  43.09 
 
 		 157 aa  107  8.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.386618  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1627  DoxX  41.04 
 
 		 134 aa  105  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.109453  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1443  DoxX  47.75 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269044  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2947  DoxX family protein  48.21 
 
 		 131 aa  104  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.209298  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3963  DoxX family protein  45.54 
 
 		 114 aa  101  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804647  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1056  hypothetical protein  43.2 
 
 		 130 aa  101  4e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.461065  normal  0.259648 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0915  DoxX  44.07 
 
 		 131 aa  100  8e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1889  DoxX family protein  42.64 
 
 		 150 aa  100  8e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.306767  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2122  DoxX family protein  42.98 
 
 		 129 aa  99.4  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269415 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1765  DoxX  43.55 
 
 		 127 aa  99  2e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0687  DoxX  41.79 
 
 		 134 aa  98.2  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115923  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0183  DoxX family protein  38.28 
 
 		 127 aa  94  6e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.313264  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0476  DoxX family protein  37.88 
 
 		 134 aa  91.3  4e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0125441  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1594  DoxX  46.46 
 
 		 137 aa  89  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570785  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2974  DoxX  41.54 
 
 		 134 aa  87  7e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00548742  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3308  DoxX family protein  37.98 
 
 		 128 aa  81.3  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1661  DoxX  35.54 
 
 		 132 aa  80.5  0.000000000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.430613  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  35.71 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0176  SRC kinase associated phosphoprotein 2  28.32 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.479419  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  39.56 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3635  DoxX family protein  35.77 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176177  hitchhiker  0.000433315 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3051  DoxX family protein  34.4 
 
 		 136 aa  51.2  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.127697 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0456  DoxX family protein  34.35 
 
 		 153 aa  47.4  0.00006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  31.85 
 
 		 149 aa  45.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1221  DoxX family protein  34.07 
 
 		 147 aa  44.3  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.806219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1292  DoxX family protein  34.07 
 
 		 147 aa  44.3  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0246117  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01610  hypothetical protein  31.71 
 
 		 123 aa  43.9  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.186029  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  30.28 
 
 		 148 aa  43.9  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0138  DoxX family protein  35.56 
 
 		 147 aa  43.9  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1222  DoxX family protein  34.07 
 
 		 147 aa  43.9  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5722  DoxX family protein  36.09 
 
 		 137 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.486124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3012  DoxX family protein  30.88 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  29.37 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1934  DoxX family protein  39.08 
 
 		 155 aa  42.7  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.467271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2997  DoxX family protein  31.16 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3837  SURF4 domain-containing protein  39.08 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1461  DoxX  34.13 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6367  DoxX family protein  34.13 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2328  DoxX family protein  31.75 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.380358 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1366  DoxX family protein  31.16 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00676152 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  34.09 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  29.77 
 
 		 144 aa  41.6  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3319  hypothetical protein  33.33 
 
 		 147 aa  42  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7034  DoxX family protein  34.13 
 
 		 139 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.182123  normal  0.352709 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3457  DoxX family protein  33.33 
 
 		 153 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  30.37 
 
 		 148 aa  40.8  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3155  DoxX family protein  30.43 
 
 		 147 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00658945 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3521  DoxX family protein  33.33 
 
 		 153 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34274  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4310  DoxX family protein  29.37 
 
 		 147 aa  40  0.01  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>