116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1503 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_1503  DoxX family protein  100 
 
 
130 aa  247  4e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1056  hypothetical protein  65.12 
 
 
130 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.461065  normal  0.259648 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0096  DoxX  61.11 
 
 
131 aa  156  8e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2974  DoxX  63.71 
 
 
134 aa  143  9e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00548742  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0059  DoxX family protein  54.69 
 
 
128 aa  136  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41597  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4416  DoxX family protein  54.92 
 
 
157 aa  134  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.386618  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2947  DoxX family protein  59.29 
 
 
131 aa  130  6e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.209298  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1627  DoxX  49.62 
 
 
134 aa  128  3e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.109453  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1443  DoxX  54.05 
 
 
137 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269044  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1247  DoxX family protein  45.74 
 
 
143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000114768  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0687  DoxX  52.8 
 
 
134 aa  117  4.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115923  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0829  DoxX family protein  45.08 
 
 
140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1621  DoxX family protein  45.97 
 
 
138 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000382951  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1344  DoxX family protein  44.19 
 
 
143 aa  114  6e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.197764  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3963  DoxX family protein  54.13 
 
 
114 aa  114  6e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804647  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1594  DoxX  53.33 
 
 
137 aa  114  6.9999999999999995e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570785  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3090  DoxX family protein  46.28 
 
 
144 aa  113  7.999999999999999e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.434652  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2661  DoxX family protein  42.64 
 
 
140 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.204335  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2934  DoxX family protein  43.41 
 
 
143 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173243  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0728  hypothetical protein  41.13 
 
 
138 aa  111  3e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0945  DoxX family protein  44.35 
 
 
136 aa  111  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1187  DoxX family protein  42.62 
 
 
144 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2799  DoxX family protein  46.28 
 
 
144 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0183  DoxX family protein  43.75 
 
 
127 aa  109  1.0000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.313264  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0830  DoxX family protein  40.98 
 
 
149 aa  105  3e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1889  DoxX family protein  43.75 
 
 
150 aa  104  3e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.306767  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1765  DoxX  41.27 
 
 
127 aa  104  4e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0915  DoxX  41.88 
 
 
131 aa  102  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0476  DoxX family protein  39.23 
 
 
134 aa  100  8e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0125441  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1388  DoxX family protein  43.55 
 
 
144 aa  99  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1661  DoxX  41.8 
 
 
132 aa  95.1  3e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.430613  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2122  DoxX family protein  45.61 
 
 
129 aa  94.7  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0269415 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3308  DoxX family protein  37.9 
 
 
128 aa  90.9  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0176  SRC kinase associated phosphoprotein 2  36.52 
 
 
129 aa  73.6  0.0000000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.479419  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  39.06 
 
 
134 aa  66.2  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2955  Surfeit locus 4-related  34.07 
 
 
133 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287316  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0526  DoxX family protein  30.37 
 
 
154 aa  55.5  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02921  hypothetical protein  27.74 
 
 
190 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  30.83 
 
 
148 aa  52.4  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0456  DoxX family protein  34.33 
 
 
153 aa  52  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0267  hypothetical protein  28.06 
 
 
186 aa  51.2  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0693  DoxX family protein  30.71 
 
 
138 aa  50.8  0.000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02871  hypothetical protein  27.34 
 
 
186 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.714602  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3051  DoxX family protein  30.89 
 
 
136 aa  49.7  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.127697 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02981  hypothetical protein  26.28 
 
 
186 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.925648  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02881  hypothetical protein  26.62 
 
 
186 aa  48.9  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3457  DoxX family protein  32.33 
 
 
153 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03431  hypothetical protein  24.09 
 
 
177 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3521  DoxX family protein  32.33 
 
 
153 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34274  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4811  DoxX family protein  33.9 
 
 
161 aa  47  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1631  hypothetical protein  24.09 
 
 
177 aa  47.4  0.00008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4177  DoxX  31.25 
 
 
140 aa  46.2  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0384  DoxX family protein  28.69 
 
 
150 aa  46.2  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.762474  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0104  putative integral membrane protein  25.21 
 
 
147 aa  46.2  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.489951  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1922  DoxX  30.6 
 
 
149 aa  45.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.439341  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4310  DoxX family protein  28.91 
 
 
147 aa  45.4  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4442  hypothetical protein  44.9 
 
 
134 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4257  hypothetical protein  44.9 
 
 
134 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4095  hypothetical protein  44.9 
 
 
134 aa  44.7  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.267519  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4106  hypothetical protein  44.9 
 
 
134 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4589  hypothetical protein  44.9 
 
 
134 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4208  DoxX family protein  44.9 
 
 
134 aa  45.1  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.550603  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4492  hypothetical protein  44.9 
 
 
134 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4480  hypothetical protein  44.9 
 
 
134 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0756  hypothetical protein  44.9 
 
 
134 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4441  hypothetical protein  44.9 
 
 
134 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0540  DoxX family protein  27.82 
 
 
154 aa  44.7  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3035  DoxX family protein  31.75 
 
 
140 aa  44.3  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.156785  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  28.68 
 
 
147 aa  44.7  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4189  DoxX family protein  31.18 
 
 
164 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0701  DoxX family protein  40.45 
 
 
128 aa  43.9  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01610  hypothetical protein  27.56 
 
 
123 aa  43.9  0.0008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.186029  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3375  DoxX  32.33 
 
 
153 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3606  DoxX family protein  28.35 
 
 
143 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142156  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2032  hypothetical protein  31.34 
 
 
167 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13020  hypothetical protein  33.59 
 
 
279 aa  43.5  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.923899  normal  0.136283 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3079  DoxX family protein  42.68 
 
 
134 aa  43.5  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.738781  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3881  DoxX family protein  34.35 
 
 
144 aa  43.5  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000792478 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1058  membrane protein  28 
 
 
172 aa  42.7  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.533713  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1461  DoxX  32.79 
 
 
139 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3233  DoxX family protein  27.94 
 
 
405 aa  42.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6367  DoxX family protein  32.79 
 
 
139 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2120  DoxX family protein  31.34 
 
 
296 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.484795  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  30.28 
 
 
144 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1442  DoxX family protein  34.07 
 
 
152 aa  42.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0849  DoxX family protein  32.31 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5146  DoxX family protein  30.6 
 
 
154 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.535914  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0786  hypothetical protein  45.45 
 
 
134 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000245891  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0722  hypothetical protein  45.45 
 
 
134 aa  42  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000540501  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0825  hypothetical protein  45.45 
 
 
134 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116306  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15211  hypothetical protein  30.71 
 
 
188 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.869968  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15461  hypothetical protein  30.16 
 
 
183 aa  41.6  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.414315  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0735  DoxX family protein  45.45 
 
 
134 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0648582  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0990  hypothetical protein  45.45 
 
 
134 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0667403  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0879  hypothetical protein  45.45 
 
 
134 aa  42  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4456  hypothetical protein  45.45 
 
 
134 aa  42  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0296685  normal  0.654993 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1964  DoxX  34.85 
 
 
138 aa  41.6  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15611  hypothetical protein  29.37 
 
 
183 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0237618  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7034  DoxX family protein  32.79 
 
 
139 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.182123  normal  0.352709 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0667  DoxX family protein  31.82 
 
 
180 aa  41.6  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>