48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0176 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0176  SRC kinase associated phosphoprotein 2  100 
 
 
129 aa  249  9.000000000000001e-66  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.479419  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0183  DoxX family protein  57.36 
 
 
127 aa  147  5e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.313264  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1661  DoxX  48.44 
 
 
132 aa  105  1e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.430613  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0476  DoxX family protein  43.08 
 
 
134 aa  93.6  8e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0125441  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3090  DoxX family protein  39.06 
 
 
144 aa  87.4  6e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.434652  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1503  DoxX family protein  39.1 
 
 
130 aa  85.9  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1627  DoxX  38.81 
 
 
134 aa  85.1  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.109453  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1187  DoxX family protein  37.6 
 
 
144 aa  84.3  5e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1621  DoxX family protein  38.76 
 
 
138 aa  84.3  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000382951  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0096  DoxX  38.4 
 
 
131 aa  82.8  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0059  DoxX family protein  36.72 
 
 
128 aa  82.4  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41597  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0829  DoxX family protein  38.28 
 
 
140 aa  80.9  0.000000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1765  DoxX  41.98 
 
 
127 aa  79.7  0.00000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4416  DoxX family protein  36.8 
 
 
157 aa  77.4  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.386618  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2799  DoxX family protein  38.1 
 
 
144 aa  77  0.00000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1056  hypothetical protein  33.86 
 
 
130 aa  75.9  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.461065  normal  0.259648 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1443  DoxX  35.14 
 
 
137 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269044  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1388  DoxX family protein  33.85 
 
 
144 aa  73.6  0.0000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3308  DoxX family protein  37.01 
 
 
128 aa  73.6  0.0000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1594  DoxX  40.74 
 
 
137 aa  72.8  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570785  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0945  DoxX family protein  34.65 
 
 
136 aa  70.5  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1247  DoxX family protein  30.23 
 
 
143 aa  69.7  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000114768  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2947  DoxX family protein  35.65 
 
 
131 aa  68.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.209298  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0687  DoxX  33.83 
 
 
134 aa  67  0.00000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115923  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0830  DoxX family protein  33.87 
 
 
149 aa  66.6  0.00000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2934  DoxX family protein  29.46 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173243  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1344  DoxX family protein  27.91 
 
 
143 aa  66.2  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.197764  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2974  DoxX  36.64 
 
 
134 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00548742  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2661  DoxX family protein  27.13 
 
 
140 aa  65.5  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.204335  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0728  hypothetical protein  32.82 
 
 
138 aa  63.5  0.0000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3963  DoxX family protein  32.46 
 
 
114 aa  60.8  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804647  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  34.13 
 
 
134 aa  57.4  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1889  DoxX family protein  34.88 
 
 
150 aa  55.8  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.306767  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0915  DoxX  30.77 
 
 
131 aa  56.2  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2122  DoxX family protein  27.05 
 
 
129 aa  53.9  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0269415 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15211  hypothetical protein  34.65 
 
 
188 aa  51.2  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.869968  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1058  membrane protein  31.5 
 
 
172 aa  50.4  0.000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.533713  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0526  DoxX family protein  30.83 
 
 
154 aa  50.4  0.000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6367  DoxX family protein  41.98 
 
 
139 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1457  hypothetical protein  32.28 
 
 
182 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7034  DoxX family protein  41.98 
 
 
139 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.182123  normal  0.352709 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1461  DoxX  41.98 
 
 
139 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2955  Surfeit locus 4-related  32.5 
 
 
133 aa  47  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287316  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15611  hypothetical protein  31.5 
 
 
183 aa  47  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0237618  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15461  hypothetical protein  31.5 
 
 
183 aa  43.5  0.0009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.414315  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0456  DoxX family protein  30.23 
 
 
153 aa  42.7  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0957  membrane protein  34.94 
 
 
172 aa  40.4  0.008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.699944  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1964  DoxX  40.85 
 
 
138 aa  40.4  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>