46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0915 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0915  DoxX  100 
 
 		 131 aa  257  3e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0829  DoxX family protein  52.8 
 
 		 140 aa  122  1e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0059  DoxX family protein  49.17 
 
 		 128 aa  119  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41597  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1056  hypothetical protein  50.86 
 
 		 130 aa  116  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.461065  normal  0.259648 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1247  DoxX family protein  51.69 
 
 		 143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000114768  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0096  DoxX  52.14 
 
 		 131 aa  113  6.9999999999999995e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2122  DoxX family protein  50 
 
 		 129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269415 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0687  DoxX  50.83 
 
 		 134 aa  108  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115923  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0830  DoxX family protein  43.7 
 
 		 149 aa  107  8.000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1388  DoxX family protein  48.33 
 
 		 144 aa  106  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0728  hypothetical protein  47.37 
 
 		 138 aa  106  1e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2661  DoxX family protein  44.92 
 
 		 140 aa  105  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.204335  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1187  DoxX family protein  45.74 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3090  DoxX family protein  46.51 
 
 		 144 aa  104  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.434652  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0945  DoxX family protein  46.49 
 
 		 136 aa  104  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1344  DoxX family protein  45.76 
 
 		 143 aa  103  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.197764  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1621  DoxX family protein  44.92 
 
 		 138 aa  102  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000382951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1503  DoxX family protein  41.88 
 
 		 130 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2947  DoxX family protein  46.09 
 
 		 131 aa  101  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.209298  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4416  DoxX family protein  46.55 
 
 		 157 aa  100  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.386618  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2934  DoxX family protein  44.07 
 
 		 143 aa  100  8e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173243  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1889  DoxX family protein  47 
 
 		 150 aa  100  8e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.306767  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2799  DoxX family protein  44 
 
 		 144 aa  97.1  7e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3963  DoxX family protein  52.58 
 
 		 114 aa  96.7  9e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804647  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1443  DoxX  46.36 
 
 		 137 aa  96.7  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269044  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1627  DoxX  47.86 
 
 		 134 aa  96.3  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.109453  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2974  DoxX  46.09 
 
 		 134 aa  89.4  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00548742  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1765  DoxX  42.45 
 
 		 127 aa  87.8  4e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0476  DoxX family protein  40.17 
 
 		 134 aa  85.5  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0125441  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1594  DoxX  41.35 
 
 		 137 aa  84.3  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570785  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3308  DoxX family protein  38.05 
 
 		 128 aa  76.6  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1661  DoxX  38.24 
 
 		 132 aa  72  0.000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.430613  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0183  DoxX family protein  34.26 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.313264  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0176  SRC kinase associated phosphoprotein 2  32.32 
 
 		 129 aa  50.8  0.000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.479419  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4492  hypothetical protein  34.51 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  29.55 
 
 		 148 aa  41.6  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0756  hypothetical protein  34.95 
 
 		 134 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4480  hypothetical protein  34.95 
 
 		 134 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3079  DoxX family protein  32.74 
 
 		 134 aa  42  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.738781  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4441  hypothetical protein  34.95 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4208  DoxX family protein  34.95 
 
 		 134 aa  41.2  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.550603  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4442  hypothetical protein  34.95 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4589  hypothetical protein  34.95 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4106  hypothetical protein  34.95 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4095  hypothetical protein  34.95 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.267519  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4257  hypothetical protein  34.95 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>