102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1056 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1056  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  248  2e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.461065  normal  0.259648 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1503  DoxX family protein  65.12 
 
 		 130 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0096  DoxX  61.6 
 
 		 131 aa  157  6e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2974  DoxX  68 
 
 		 134 aa  154  5.0000000000000005e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00548742  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0059  DoxX family protein  55.28 
 
 		 128 aa  137  4.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41597  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4416  DoxX family protein  53.28 
 
 		 157 aa  130  7.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.386618  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2947  DoxX family protein  57.89 
 
 		 131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.209298  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1627  DoxX  48.87 
 
 		 134 aa  124  6e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.109453  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0687  DoxX  52 
 
 		 134 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115923  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0945  DoxX family protein  50.81 
 
 		 136 aa  118  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3090  DoxX family protein  49.59 
 
 		 144 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.434652  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1187  DoxX family protein  47.93 
 
 		 144 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1443  DoxX  49.55 
 
 		 137 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269044  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0915  DoxX  50.86 
 
 		 131 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0728  hypothetical protein  45.16 
 
 		 138 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1247  DoxX family protein  46.56 
 
 		 143 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000114768  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1621  DoxX family protein  48.39 
 
 		 138 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000382951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0830  DoxX family protein  44.26 
 
 		 149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2661  DoxX family protein  41.35 
 
 		 140 aa  110  8.000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.204335  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3963  DoxX family protein  50 
 
 		 114 aa  108  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804647  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2799  DoxX family protein  45.45 
 
 		 144 aa  107  5e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1344  DoxX family protein  44.8 
 
 		 143 aa  106  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.197764  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0829  DoxX family protein  45.08 
 
 		 140 aa  104  4e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1594  DoxX  47.62 
 
 		 137 aa  101  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570785  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2934  DoxX family protein  43.2 
 
 		 143 aa  101  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173243  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1889  DoxX family protein  44.64 
 
 		 150 aa  100  5e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.306767  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0183  DoxX family protein  41.6 
 
 		 127 aa  99.4  1e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.313264  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0476  DoxX family protein  39.53 
 
 		 134 aa  98.6  3e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0125441  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1765  DoxX  35.2 
 
 		 127 aa  93.6  8e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2122  DoxX family protein  48.57 
 
 		 129 aa  92  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269415 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3308  DoxX family protein  36.43 
 
 		 128 aa  90.9  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1388  DoxX family protein  41.94 
 
 		 144 aa  90.1  9e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1661  DoxX  34.88 
 
 		 132 aa  84  6e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.430613  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  38.28 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0176  SRC kinase associated phosphoprotein 2  30.43 
 
 		 129 aa  63.5  0.0000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.479419  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2955  Surfeit locus 4-related  32.82 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  31.82 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0022  hypothetical protein  33.83 
 
 		 146 aa  52.4  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1744499999999998e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0693  DoxX family protein  32.8 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3051  DoxX family protein  36.72 
 
 		 136 aa  51.2  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.127697 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4310  DoxX family protein  31.06 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0849  DoxX family protein  33.59 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4492  hypothetical protein  39.47 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4257  hypothetical protein  39.47 
 
 		 134 aa  47.8  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4095  hypothetical protein  39.47 
 
 		 134 aa  47.8  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.267519  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4106  hypothetical protein  39.47 
 
 		 134 aa  47.8  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4589  hypothetical protein  39.47 
 
 		 134 aa  47.8  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4208  DoxX family protein  39.47 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.550603  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4480  hypothetical protein  39.47 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0756  hypothetical protein  39.47 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4441  hypothetical protein  39.47 
 
 		 134 aa  47.8  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02921  hypothetical protein  31.39 
 
 		 190 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4442  hypothetical protein  39.29 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1964  DoxX  34.59 
 
 		 138 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3079  DoxX family protein  39.47 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.738781  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3268  DoxX family protein  33.33 
 
 		 198 aa  45.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1588  DoxX family protein  32.35 
 
 		 239 aa  45.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.014966  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  33.59 
 
 		 149 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1058  membrane protein  31.2 
 
 		 172 aa  44.7  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.533713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4189  DoxX family protein  29.17 
 
 		 164 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0456  DoxX family protein  29.03 
 
 		 153 aa  44.7  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0786  hypothetical protein  43.48 
 
 		 134 aa  44.7  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000245891  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0722  hypothetical protein  43.48 
 
 		 134 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000540501  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0825  hypothetical protein  43.48 
 
 		 134 aa  44.7  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116306  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0735  DoxX family protein  43.48 
 
 		 134 aa  44.7  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0648582  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0990  hypothetical protein  43.48 
 
 		 134 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0667403  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0879  hypothetical protein  43.48 
 
 		 134 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4456  hypothetical protein  43.48 
 
 		 134 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0296685  normal  0.654993 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3881  DoxX family protein  33.59 
 
 		 144 aa  44.3  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000792478 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0540  DoxX family protein  26.12 
 
 		 154 aa  44.7  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  33.33 
 
 		 151 aa  44.3  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0735  hypothetical protein  43.48 
 
 		 134 aa  43.5  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.7492600000000004e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0845  DoxD-like family protein  30.39 
 
 		 170 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.811875  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1461  DoxX  32.17 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1834  DoxX  34.62 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2445  DoxX family protein  34.62 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.104283  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6367  DoxX family protein  32.17 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2450  DoxX family protein  35.38 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0306678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7034  DoxX family protein  32.17 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.182123  normal  0.352709 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0921  hypothetical protein  43.48 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.77995e-43 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1922  DoxX  29.32 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.439341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2492  DoxX family protein  38.24 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.212338  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2360  DoxX family protein  38.24 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.462375  normal  0.595687 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0526  DoxX family protein  28.91 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4177  DoxX  30.08 
 
 		 140 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3021  DoxX family protein  30.22 
 
 		 133 aa  41.6  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.867125  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01610  hypothetical protein  28.57 
 
 		 123 aa  42  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.186029  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03431  hypothetical protein  26.06 
 
 		 177 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1426  hypothetical protein  33.33 
 
 		 149 aa  41.2  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.165574 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1631  hypothetical protein  26.15 
 
 		 177 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5722  DoxX family protein  37.04 
 
 		 137 aa  40.4  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.486124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4416  putative inner membrane protein YqjF  31.54 
 
 		 160 aa  40.4  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.260448 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0698  DoxD-like family protein  41.18 
 
 		 138 aa  40  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.303263  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1201  hypothetical protein  41.18 
 
 		 138 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3375  DoxX  32.31 
 
 		 153 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2120  DoxX family protein  28.17 
 
 		 296 aa  40  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.484795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2315  DoxD-like family protein  41.18 
 
 		 138 aa  40  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0132725  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2972  DoxD-like family protein  41.18 
 
 		 138 aa  40  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.390379  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1040  DoxX family membrane protein  41.18 
 
 		 138 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.404409  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1046  DoxX family protein  41.18 
 
 		 138 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291192  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>