36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5722 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_5722  DoxX family protein  100 
 
 
137 aa  273  6e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.486124  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7034  DoxX family protein  67.24 
 
 
139 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.182123  normal  0.352709 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1461  DoxX  67.24 
 
 
139 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6367  DoxX family protein  67.24 
 
 
139 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1964  DoxX  57.76 
 
 
138 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0240  hypothetical protein  52.03 
 
 
145 aa  121  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3635  DoxX family protein  35.38 
 
 
131 aa  77  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176177  hitchhiker  0.000433315 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1376  DoxX family protein  38.58 
 
 
143 aa  76.6  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.813801 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01610  hypothetical protein  32.48 
 
 
123 aa  67.8  0.00000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.186029  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2328  DoxX family protein  27.97 
 
 
137 aa  65.5  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.380358 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3051  DoxX family protein  29.23 
 
 
136 aa  58.5  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.127697 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0456  DoxX family protein  31.71 
 
 
153 aa  57.4  0.00000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0320  DoxX family protein  33.94 
 
 
144 aa  55.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4101  DoxX family protein  35 
 
 
143 aa  53.1  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1247  DoxX family protein  35.29 
 
 
143 aa  49.7  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000114768  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1344  DoxX family protein  37.59 
 
 
143 aa  48.1  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.197764  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0824  DoxX family protein  31.93 
 
 
147 aa  47.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0639123  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2661  DoxX family protein  34.56 
 
 
140 aa  47.8  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.204335  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4416  DoxX family protein  38.85 
 
 
157 aa  47  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.386618  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0829  DoxX family protein  36.15 
 
 
140 aa  46.6  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0830  DoxX family protein  34.27 
 
 
149 aa  46.2  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5453  DoxX family protein  33.08 
 
 
136 aa  44.3  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.403659  normal  0.232116 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2934  DoxX family protein  36.09 
 
 
143 aa  43.9  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173243  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0728  hypothetical protein  31.58 
 
 
138 aa  43.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2947  DoxX family protein  34.19 
 
 
131 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.209298  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3308  DoxX family protein  26.92 
 
 
128 aa  42.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0945  DoxX family protein  35.07 
 
 
136 aa  41.6  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0502  DoxX family membrane protein  38.78 
 
 
146 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0687  DoxX  33.59 
 
 
134 aa  41.2  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115923  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1621  DoxX family protein  34.62 
 
 
138 aa  40.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000382951  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0059  DoxX family protein  33.08 
 
 
128 aa  40.8  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41597  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3090  DoxX family protein  37.01 
 
 
144 aa  40.8  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.434652  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1056  hypothetical protein  37.04 
 
 
130 aa  40.4  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.461065  normal  0.259648 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1627  DoxX  34 
 
 
134 aa  40.4  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.109453  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1187  DoxX family protein  33.83 
 
 
144 aa  40  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15211  hypothetical protein  36.36 
 
 
188 aa  40  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.869968  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>