80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4101 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_4101  DoxX family protein  100 
 
 
143 aa  275  1e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2328  DoxX family protein  45.24 
 
 
137 aa  103  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.380358 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3051  DoxX family protein  42.34 
 
 
136 aa  90.1  9e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.127697 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1376  DoxX family protein  42.66 
 
 
143 aa  85.9  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.813801 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3635  DoxX family protein  44.26 
 
 
131 aa  80.5  0.000000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176177  hitchhiker  0.000433315 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01610  hypothetical protein  40.98 
 
 
123 aa  79.3  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.186029  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0456  DoxX family protein  44.26 
 
 
153 aa  76.3  0.0000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7034  DoxX family protein  37.3 
 
 
139 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.182123  normal  0.352709 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6367  DoxX family protein  37.3 
 
 
139 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1461  DoxX  37.3 
 
 
139 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1964  DoxX  40 
 
 
138 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0824  DoxX family protein  35.25 
 
 
147 aa  69.7  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0639123  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5722  DoxX family protein  34.17 
 
 
137 aa  62  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.486124  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1058  membrane protein  35.34 
 
 
172 aa  58.2  0.00000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.533713  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0240  hypothetical protein  38.89 
 
 
145 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  35.82 
 
 
134 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15611  hypothetical protein  33.6 
 
 
183 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0237618  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1457  hypothetical protein  32.8 
 
 
182 aa  52  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2878  DoxX  38.71 
 
 
132 aa  51.6  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15461  hypothetical protein  33.6 
 
 
183 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.414315  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15211  hypothetical protein  33.6 
 
 
188 aa  50.4  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.869968  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0693  DoxX family protein  32 
 
 
138 aa  49.7  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3308  DoxX family protein  34.85 
 
 
128 aa  49.7  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0059  DoxX family protein  35.16 
 
 
128 aa  49.3  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41597  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1443  DoxX  37.72 
 
 
137 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269044  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1137  hypothetical protein  29.77 
 
 
152 aa  48.1  0.00004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2754  DoxX family protein  34.51 
 
 
131 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0175423  hitchhiker  0.00133286 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2081  DoxX family protein  34.92 
 
 
130 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0953416  normal  0.292835 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0934  DoxX  37.5 
 
 
140 aa  47.4  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0131  hypothetical protein  32.79 
 
 
185 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07631  hypothetical protein  32.79 
 
 
185 aa  47  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0159355 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0957  membrane protein  37.8 
 
 
172 aa  47  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.699944  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8175  DoxX family protein  36.15 
 
 
135 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700179  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0183  DoxX family protein  33.59 
 
 
127 aa  46.6  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.313264  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1621  DoxX family protein  35.51 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000382951  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2820  hypothetical protein  36.59 
 
 
130 aa  45.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.161166  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0038  DoxX family protein  35.48 
 
 
131 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00373258 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4811  DoxX family protein  37.61 
 
 
161 aa  45.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0499  DoxX family protein  33.64 
 
 
134 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0660687 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6046  DoxX family protein  31.91 
 
 
137 aa  45.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.392213 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0010  DoxX family protein  31.62 
 
 
143 aa  45.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5400  DoxX family protein  28.26 
 
 
137 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358694  normal  0.0708806 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2947  DoxX family protein  39.05 
 
 
131 aa  45.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.209298  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0526  DoxX family protein  36.92 
 
 
154 aa  45.4  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0384  DoxX family protein  34.92 
 
 
150 aa  45.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.762474  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2995  DoxX family protein  32.04 
 
 
143 aa  44.7  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00203576  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1934  DoxX family protein  32.81 
 
 
155 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.467271  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5453  DoxX family protein  30.71 
 
 
136 aa  43.9  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.403659  normal  0.232116 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0104  putative integral membrane protein  34.68 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.489951  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3837  SURF4 domain-containing protein  31.54 
 
 
137 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3268  DoxX family protein  35.2 
 
 
198 aa  43.5  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0320  DoxX family protein  25.21 
 
 
144 aa  43.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2934  DoxX family protein  35.07 
 
 
143 aa  43.5  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173243  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1056  hypothetical protein  35.11 
 
 
130 aa  43.5  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.461065  normal  0.259648 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5848  DoxX family protein  33.33 
 
 
137 aa  42.7  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0830  DoxX family protein  32.54 
 
 
149 aa  42.7  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1531  DoxX family protein  38.14 
 
 
197 aa  42.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6086  DoxX family protein  33.33 
 
 
137 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0786046  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3593  DoxX family protein  34.4 
 
 
148 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.306915 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2914  DoxX family protein  34.88 
 
 
185 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0156425  normal  0.195478 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3375  DoxX  30.66 
 
 
171 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.239229  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1879  DoxX family protein  34.92 
 
 
130 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0371947 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0428  DoxX family protein  32.41 
 
 
133 aa  42  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0401173  normal  0.859055 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0462  DoxX family protein  31.71 
 
 
133 aa  41.6  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0742916 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0839  DoxX family protein  36.99 
 
 
144 aa  41.2  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.496413 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  30.71 
 
 
148 aa  41.6  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0684  DoxX  39.2 
 
 
137 aa  41.2  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.000000000773987  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1627  DoxX  30.37 
 
 
134 aa  41.2  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.109453  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2661  DoxX family protein  31.16 
 
 
140 aa  41.2  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.204335  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0728  hypothetical protein  30.23 
 
 
138 aa  41.2  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0230  DoxX  33.33 
 
 
136 aa  40.4  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  unclonable  3.19876e-23 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1344  DoxX family protein  31.58 
 
 
143 aa  40.4  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.197764  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3841  DoxX family protein  31.36 
 
 
136 aa  40.4  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1283  DoxX family protein  25.44 
 
 
143 aa  40.4  0.009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3423  hypothetical protein  29.1 
 
 
161 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.318649  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0347  DoxX  30.4 
 
 
130 aa  40.4  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000430544  normal  0.0908673 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1594  DoxX  38.46 
 
 
137 aa  40.4  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570785  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2637  DoxX family protein  33.96 
 
 
153 aa  40  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.920826  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3420  putative inner membrane protein YqjF  29.1 
 
 
161 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3493  hypothetical protein  29.1 
 
 
161 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>