14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0347 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_0347  DoxX  100 
 
 
130 aa  255  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000430544  normal  0.0908673 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1376  DoxX family protein  31.54 
 
 
143 aa  52  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.813801 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2048  DoxX family protein  33.59 
 
 
139 aa  47.4  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000018933  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0693  DoxX family protein  29.06 
 
 
138 aa  47  0.00008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1765  DoxX  29.23 
 
 
127 aa  46.2  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0849  DoxX family protein  35.11 
 
 
137 aa  45.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4310  DoxX family protein  28.57 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0614  DoxD-like family  30.37 
 
 
281 aa  43.1  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2328  DoxX family protein  28.12 
 
 
137 aa  43.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.380358 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6128  hypothetical protein  29.47 
 
 
144 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.134606 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1539  DoxD family protein  31.11 
 
 
281 aa  42.7  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.636212  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0845  DoxD-like family protein  38.89 
 
 
170 aa  41.2  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.811875  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6484  DoxX family protein  31.3 
 
 
175 aa  40.8  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0570836  normal  0.12907 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1372  DoxX family protein  34.52 
 
 
152 aa  40  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>