100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1372 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1372  DoxX family protein  100 
 
 
152 aa  294  3e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2955  Surfeit locus 4-related  52.31 
 
 
133 aa  137  6e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287316  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4177  DoxX  52.59 
 
 
140 aa  131  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0849  DoxX family protein  46.76 
 
 
137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2202  DoxX family protein  45.11 
 
 
144 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273877  normal  0.79103 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2360  DoxX family protein  49.61 
 
 
137 aa  104  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.462375  normal  0.595687 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2492  DoxX family protein  49.61 
 
 
137 aa  103  8e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.212338  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6128  hypothetical protein  48.44 
 
 
144 aa  102  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.134606 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0845  DoxD-like family protein  42.86 
 
 
170 aa  101  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.811875  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4310  DoxX family protein  42.31 
 
 
147 aa  100  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5776  DoxX family membrane protein  47.24 
 
 
137 aa  100  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.377997 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2445  DoxX family protein  47.24 
 
 
137 aa  100  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.104283  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1834  DoxX  47.24 
 
 
137 aa  100  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4059  DoxX family protein  48.85 
 
 
131 aa  99  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.528978  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2450  DoxX family protein  46.46 
 
 
137 aa  98.2  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0306678  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4427  DoxX family protein  48.09 
 
 
131 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4541  DoxX family protein  47.33 
 
 
131 aa  97.1  8e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0910404  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4512  DoxX family protein  49.24 
 
 
132 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.794637 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0431  DoxX family protein  41.46 
 
 
136 aa  94.4  5e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.143975 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1442  DoxX family protein  43.84 
 
 
152 aa  94  6e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5142  DoxX family protein  51.16 
 
 
132 aa  94  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1627  DoxD-like family protein  46.22 
 
 
138 aa  93.6  8e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00417873  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1046  DoxX family protein  46.22 
 
 
138 aa  93.6  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291192  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1040  DoxX family membrane protein  46.22 
 
 
138 aa  93.6  8e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.404409  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2972  DoxD-like family protein  46.22 
 
 
138 aa  93.6  8e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.390379  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2315  DoxD-like family protein  46.22 
 
 
138 aa  93.6  8e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0132725  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0698  DoxD-like family protein  46.22 
 
 
138 aa  93.6  8e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.303263  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1201  hypothetical protein  46.22 
 
 
138 aa  93.6  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1006  DoxX family protein  47.32 
 
 
138 aa  91.7  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0693  DoxX family protein  40.17 
 
 
138 aa  67.4  0.00000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  36.59 
 
 
148 aa  66.2  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2953  DoxX  40.16 
 
 
147 aa  65.5  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4623  DoxX family protein  32.06 
 
 
139 aa  55.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000208807  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1503  DoxX family protein  35.66 
 
 
130 aa  53.5  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  27.08 
 
 
147 aa  51.2  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1922  DoxX  31.25 
 
 
149 aa  50.8  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.439341  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0096  DoxX  29.23 
 
 
131 aa  50.8  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1056  hypothetical protein  31.78 
 
 
130 aa  50.4  0.000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.461065  normal  0.259648 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6404  DoxX  32.81 
 
 
143 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256266  normal  0.0305648 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0591  DoxX family protein  36.59 
 
 
147 aa  49.7  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1627  DoxX  29.77 
 
 
134 aa  49.3  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.109453  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5120  DoxX family protein  34.88 
 
 
205 aa  47.8  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.996543 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2081  DoxX family protein  37.1 
 
 
130 aa  47.8  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0953416  normal  0.292835 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  34.92 
 
 
134 aa  47.4  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3881  DoxX family protein  36.19 
 
 
144 aa  47  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000792478 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1765  DoxX  32.23 
 
 
127 aa  47  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0476  DoxX family protein  30 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0125441  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  30.99 
 
 
144 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1388  DoxX family protein  32.85 
 
 
144 aa  45.4  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3233  DoxX family protein  31.01 
 
 
405 aa  44.7  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0059  DoxX family protein  31.06 
 
 
128 aa  44.7  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41597  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  26.76 
 
 
149 aa  44.7  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0022  hypothetical protein  31.82 
 
 
146 aa  44.3  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1744499999999998e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0687  DoxX  28.8 
 
 
134 aa  44.3  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115923  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13020  hypothetical protein  31.39 
 
 
279 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.923899  normal  0.136283 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0206  DoxX family protein  32.35 
 
 
148 aa  43.9  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4416  DoxX family protein  33.88 
 
 
157 aa  43.9  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.386618  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2120  DoxX family protein  33.08 
 
 
296 aa  43.9  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.484795  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  28.87 
 
 
144 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1247  DoxX family protein  29.41 
 
 
143 aa  43.5  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000114768  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0347  DoxX  32.31 
 
 
130 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000430544  normal  0.0908673 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3790  DoxX family protein  34.34 
 
 
181 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.459957 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0830  DoxX family protein  32.12 
 
 
149 aa  43.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0526  DoxX family protein  29.77 
 
 
154 aa  43.5  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0945  DoxX family protein  31.39 
 
 
136 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  30.15 
 
 
144 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3842  DoxX family protein  40.28 
 
 
128 aa  43.5  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000608334  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4019  DoxX  32.06 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394883  normal  0.482629 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1775  DoxX family protein  29.29 
 
 
152 aa  42.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.019545 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1097  DoxX family protein  35.34 
 
 
148 aa  42.4  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  27.27 
 
 
149 aa  42.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1273  DoxX  34.03 
 
 
150 aa  42.7  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.346263  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34190  predicted membrane protein  36.89 
 
 
167 aa  42  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08840  predicted membrane protein  29.45 
 
 
211 aa  42  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.258983  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2799  DoxX family protein  33.88 
 
 
144 aa  42  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2974  DoxX  36.89 
 
 
134 aa  42  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00548742  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1118  DoxX family protein  28.93 
 
 
118 aa  42  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000073687  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2947  DoxX family protein  29.91 
 
 
131 aa  41.6  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.209298  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1096  DoxX family protein  28.93 
 
 
118 aa  42  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000704586  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4592  DoxX family protein  33.6 
 
 
174 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0462  DoxX family protein  31.5 
 
 
133 aa  41.6  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0742916 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0728  hypothetical protein  29.5 
 
 
138 aa  41.6  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0428  DoxX family protein  31.5 
 
 
133 aa  41.6  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0401173  normal  0.859055 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2754  DoxX family protein  36.71 
 
 
131 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0175423  hitchhiker  0.00133286 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2401  hypothetical protein  30.88 
 
 
156 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.717688  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03045  DoxX subfamily  29.17 
 
 
87 aa  41.2  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1344  DoxX family protein  27.87 
 
 
143 aa  40.8  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.197764  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0829  DoxX family protein  30.4 
 
 
140 aa  40.8  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1616  DoxX  38.2 
 
 
216 aa  40.4  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  28.26 
 
 
148 aa  40.4  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5004  hypothetical protein  33.33 
 
 
128 aa  40.4  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.91746e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5020  hypothetical protein  33.33 
 
 
128 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000381098  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5170  hypothetical protein  33.33 
 
 
128 aa  40.4  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000171714  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2661  DoxX family protein  27.61 
 
 
140 aa  40.4  0.009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.204335  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5564  hypothetical protein  33.33 
 
 
128 aa  40.4  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5446  hypothetical protein  33.33 
 
 
128 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140198  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5412  hypothetical protein  33.33 
 
 
128 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.745190000000001e-63 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5499  hypothetical protein  33.33 
 
 
128 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000803352  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4083  DoxX  33.6 
 
 
173 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4159  DoxX family protein  33.6 
 
 
173 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.273208  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>