139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1097 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1097  DoxX family protein  100 
 
 
148 aa  291  3e-78  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0693  DoxX family protein  48.55 
 
 
138 aa  147  7e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  38.21 
 
 
144 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  34.75 
 
 
149 aa  79  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  33.61 
 
 
148 aa  76.3  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  31.93 
 
 
148 aa  76.6  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  34.19 
 
 
149 aa  70.9  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  30.08 
 
 
149 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  34.69 
 
 
151 aa  67.8  0.00000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  33.04 
 
 
144 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1915  DoxX family protein  35.54 
 
 
145 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0302074  hitchhiker  0.0000000000182197 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1755  DoxX family protein  34.71 
 
 
144 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000356426 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  32.17 
 
 
144 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  29.93 
 
 
148 aa  63.9  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2313  DoxX family protein  34.71 
 
 
145 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  hitchhiker  0.000213237 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3456  DoxX family protein  34.71 
 
 
145 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000181472 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1426  hypothetical protein  37.19 
 
 
149 aa  61.6  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.165574 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0022  hypothetical protein  34.74 
 
 
146 aa  60.5  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1744499999999998e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0221  hypothetical protein  31.4 
 
 
148 aa  60.1  0.000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4019  DoxX  31.93 
 
 
144 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394883  normal  0.482629 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3881  DoxX family protein  32.74 
 
 
144 aa  58.9  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000792478 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2112  DoxX family protein  32.17 
 
 
171 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.733626 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1372  DoxX family protein  39.18 
 
 
152 aa  58.9  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  32.61 
 
 
147 aa  58.5  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6128  hypothetical protein  44 
 
 
144 aa  57.4  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.134606 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0138  DoxX family protein  38.78 
 
 
147 aa  57  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1221  DoxX family protein  33.05 
 
 
147 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.806219  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1292  DoxX family protein  33.05 
 
 
147 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0246117  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4592  DoxX family protein  32.46 
 
 
174 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3319  hypothetical protein  33.05 
 
 
147 aa  55.8  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2953  DoxX  30.89 
 
 
147 aa  55.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1222  DoxX family protein  33.05 
 
 
147 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4623  DoxX family protein  35.59 
 
 
139 aa  56.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000208807  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000957  hypothetical protein  31.4 
 
 
147 aa  55.5  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000422925  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1803  integral membrane protein  34.26 
 
 
144 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000242993  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4083  DoxX  35.96 
 
 
173 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4159  DoxX family protein  35.96 
 
 
173 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.273208  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4313  DoxX family protein  35.96 
 
 
173 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.514901 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6404  DoxX  32.48 
 
 
143 aa  54.3  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256266  normal  0.0305648 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1133  hypothetical protein  38.95 
 
 
150 aa  53.9  0.0000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0161516 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4226  DoxX family protein  34.21 
 
 
173 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2743  DoxX family protein  35.34 
 
 
177 aa  53.9  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000157572  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0190  DoxX  30.25 
 
 
145 aa  53.5  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000463146  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4059  DoxX family protein  35.56 
 
 
131 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.528978  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2565  DoxX family protein  30.77 
 
 
147 aa  52.8  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.66193  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3155  DoxX family protein  33.05 
 
 
147 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00658945 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1273  DoxX  33.06 
 
 
150 aa  52  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.346263  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2997  DoxX family protein  33.05 
 
 
147 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4427  DoxX family protein  34.44 
 
 
131 aa  52  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3012  DoxX family protein  33.05 
 
 
147 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3457  DoxX family protein  38.1 
 
 
153 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3521  DoxX family protein  37.65 
 
 
153 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34274  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1366  DoxX family protein  33.05 
 
 
147 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00676152 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0782  DoxX  32 
 
 
149 aa  51.6  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0845  DoxD-like family protein  29.46 
 
 
170 aa  51.2  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.811875  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5499  hypothetical protein  28.44 
 
 
128 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000803352  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5446  hypothetical protein  28.44 
 
 
128 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140198  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5170  hypothetical protein  28.44 
 
 
128 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000171714  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5004  hypothetical protein  28.44 
 
 
128 aa  50.8  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.91746e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5020  hypothetical protein  28.44 
 
 
128 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000381098  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5412  hypothetical protein  28.44 
 
 
128 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.745190000000001e-63 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5564  hypothetical protein  28.44 
 
 
128 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1389  hypothetical protein  29.17 
 
 
146 aa  50.8  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0236091 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1096  DoxX family protein  29 
 
 
118 aa  50.8  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000704586  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1118  DoxX family protein  29 
 
 
118 aa  50.8  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000073687  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0540  DoxX family protein  28.79 
 
 
154 aa  50.4  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0883  DoxX family protein  33.33 
 
 
147 aa  50.4  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4541  DoxX family protein  33.33 
 
 
131 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0910404  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3022  DoxX family protein  28.19 
 
 
153 aa  50.4  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.43506  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2955  Surfeit locus 4-related  30.63 
 
 
133 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287316  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  32.11 
 
 
134 aa  50.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4107  DoxX family protein  41.43 
 
 
144 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3842  DoxX family protein  30.68 
 
 
128 aa  49.7  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000608334  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2202  DoxX family protein  33.04 
 
 
144 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273877  normal  0.79103 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2820  DoxX family protein  26.61 
 
 
148 aa  49.7  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0206  DoxX family protein  29.66 
 
 
148 aa  49.3  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0829  DoxX family protein  26.23 
 
 
140 aa  48.9  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4310  DoxX family protein  35.4 
 
 
147 aa  49.3  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3233  DoxX family protein  31.07 
 
 
405 aa  49.3  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5119  DoxX family protein  27.52 
 
 
128 aa  48.9  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000103447  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1006  DoxX family protein  36.63 
 
 
138 aa  49.7  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1588  DoxX family protein  28.17 
 
 
239 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.014966  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0347  DoxX  26.61 
 
 
130 aa  48.5  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000430544  normal  0.0908673 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0849  DoxX family protein  30.84 
 
 
137 aa  48.9  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3079  DoxX family protein  35.92 
 
 
134 aa  48.1  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.738781  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5443  hypothetical protein  27.52 
 
 
128 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000785742  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5508  hypothetical protein  27.52 
 
 
128 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000015109  unclonable  3.38736e-26 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0559  DoxX family protein  29.2 
 
 
159 aa  47  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212401  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0136  hypothetical protein  30.08 
 
 
145 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.636829  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0566  hypothetical protein  32.67 
 
 
145 aa  46.2  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00681752  normal  0.504746 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1272  DoxX family protein  34.88 
 
 
160 aa  46.2  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.938699  hitchhiker  0.000000103302 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1503  DoxX family protein  28.57 
 
 
130 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6351  DoxX family protein  33.33 
 
 
141 aa  46.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4492  hypothetical protein  28.57 
 
 
134 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4257  hypothetical protein  33.68 
 
 
134 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4095  hypothetical protein  33.68 
 
 
134 aa  45.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.267519  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4106  hypothetical protein  33.68 
 
 
134 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4589  hypothetical protein  33.68 
 
 
134 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3375  DoxX  32.65 
 
 
153 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4441  hypothetical protein  33.68 
 
 
134 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>