81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1272 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1272  DoxX family protein  100 
 
 		 160 aa  309  1e-83  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.938699  hitchhiker  0.000000103302 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  36.08 
 
 		 149 aa  62  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4189  DoxX family protein  32.62 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  35.1 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  33.81 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  37.25 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  34.56 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  34.72 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0263  DoxX family protein  30.77 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0153873  normal  0.498274 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  33.11 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4331  DoxX family protein  33.09 
 
 		 131 aa  52.4  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.151422 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2328  DoxX family protein  32.62 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.380358 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4310  DoxX family protein  36.5 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4623  DoxX family protein  30.6 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000208807  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3555  DoxX family protein  30 
 
 		 130 aa  49.7  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.453371 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  28.89 
 
 		 134 aa  48.9  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2955  Surfeit locus 4-related  28.99 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2112  DoxX family protein  29.93 
 
 		 171 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.733626 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0540  DoxX family protein  30.99 
 
 		 154 aa  48.1  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  32.39 
 
 		 148 aa  48.1  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3423  hypothetical protein  30 
 
 		 161 aa  47.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.318649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1503  DoxX family protein  30.3 
 
 		 130 aa  47.8  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1922  DoxX  31.39 
 
 		 149 aa  47.4  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.439341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3527  hypothetical protein  30 
 
 		 161 aa  47.4  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0510711 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3289  putative inner membrane protein YqjF  28.78 
 
 		 130 aa  47.4  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0595  DoxX family protein  28.78 
 
 		 130 aa  47.4  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3493  hypothetical protein  30 
 
 		 161 aa  47.4  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3420  putative inner membrane protein YqjF  30 
 
 		 161 aa  47.4  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02921  hypothetical protein  28.78 
 
 		 130 aa  47.4  0.00009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  30.99 
 
 		 148 aa  47.4  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02970  predicted quinol oxidase subunit  28.78 
 
 		 130 aa  47.4  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0600  DoxX family protein  28.78 
 
 		 130 aa  47.4  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0544  DoxX family protein  28.89 
 
 		 131 aa  47  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1115  hypothetical protein  28.89 
 
 		 131 aa  47  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.192831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3399  putative inner membrane protein YqjF  30.22 
 
 		 160 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3260  putative inner membrane protein YqjF  30 
 
 		 130 aa  47  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4416  putative inner membrane protein YqjF  30.22 
 
 		 160 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.260448 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0096  DoxX  27.54 
 
 		 131 aa  47  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0480  DoxX family protein  28.89 
 
 		 131 aa  47  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.111786  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2867  DoxX family protein  35.57 
 
 		 378 aa  46.2  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4811  DoxX family protein  32.85 
 
 		 161 aa  46.2  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3574  putative inner membrane protein YqjF  28.78 
 
 		 130 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4019  DoxX  33.33 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394883  normal  0.482629 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2953  DoxX  32.33 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2820  DoxX family protein  33.77 
 
 		 148 aa  45.8  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  30.15 
 
 		 144 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0526  DoxX family protein  31.62 
 
 		 154 aa  45.1  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1056  hypothetical protein  28.99 
 
 		 130 aa  45.1  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.461065  normal  0.259648 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1058  membrane protein  30.66 
 
 		 172 aa  45.1  0.0005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.533713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0849  DoxX family protein  31.88 
 
 		 137 aa  44.7  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0462  DoxX family protein  32.06 
 
 		 133 aa  44.7  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0742916 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  30.88 
 
 		 144 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0022  hypothetical protein  30.77 
 
 		 146 aa  44.3  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1744499999999998e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0934  DoxX  38.67 
 
 		 140 aa  44.3  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3589  putative inner membrane protein YqjF  29.29 
 
 		 161 aa  44.3  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.24023 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1514  DoxX family protein  29.57 
 
 		 167 aa  43.9  0.0009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0337781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0038  DoxX family protein  40 
 
 		 131 aa  43.9  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00373258 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4592  DoxX family protein  29.17 
 
 		 174 aa  43.9  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0701  DoxX family protein  41.1 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0428  DoxX family protein  30.53 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0401173  normal  0.859055 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2151  transporter  34.15 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.447191  normal  0.895246 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0693  DoxX family protein  29.1 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15211  hypothetical protein  30.34 
 
 		 188 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.869968  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1755  DoxX family protein  30.22 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000356426 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2565  DoxX family protein  35.57 
 
 		 147 aa  42  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.66193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1915  DoxX family protein  30.22 
 
 		 145 aa  42.4  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0302074  hitchhiker  0.0000000000182197 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0521  DoxX family protein  28.89 
 
 		 133 aa  41.6  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.609117  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1222  DoxX family protein  34.93 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8175  DoxX family protein  30.08 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700179  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3881  DoxX family protein  38.36 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000792478 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2202  DoxX family protein  28.06 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273877  normal  0.79103 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2081  DoxX family protein  30.07 
 
 		 130 aa  41.6  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0953416  normal  0.292835 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3519  DoxX family protein  33.33 
 
 		 131 aa  41.6  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.237126  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1389  hypothetical protein  36.11 
 
 		 146 aa  41.2  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0236091 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2313  DoxX family protein  30.94 
 
 		 145 aa  41.2  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  hitchhiker  0.000213237 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3456  DoxX family protein  33.09 
 
 		 145 aa  41.2  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000181472 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0206  DoxX family protein  36.3 
 
 		 148 aa  40.8  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4497  DoxX family protein  39.51 
 
 		 129 aa  40.4  0.01  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1221  DoxX family protein  34.25 
 
 		 147 aa  40.4  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.806219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1292  DoxX family protein  34.25 
 
 		 147 aa  40.4  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0246117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0104  putative integral membrane protein  27.21 
 
 		 147 aa  40.4  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.489951  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>