30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0521 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0521  DoxX family protein  100 
 
 
133 aa  252  1.0000000000000001e-66  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.609117  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0263  DoxX family protein  62.69 
 
 
132 aa  127  6e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0153873  normal  0.498274 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0526  DoxX family protein  22.73 
 
 
154 aa  52.4  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3555  DoxX family protein  32.26 
 
 
130 aa  47.4  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.453371 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4189  DoxX family protein  31.25 
 
 
164 aa  47  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2820  DoxX family protein  26.77 
 
 
148 aa  46.6  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3527  hypothetical protein  31.45 
 
 
161 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0510711 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3493  hypothetical protein  31.45 
 
 
161 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3423  hypothetical protein  31.45 
 
 
161 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.318649  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3420  putative inner membrane protein YqjF  31.45 
 
 
161 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3589  putative inner membrane protein YqjF  31.45 
 
 
161 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.24023 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4331  DoxX family protein  33.88 
 
 
131 aa  42.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.151422 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3021  DoxX family protein  35.83 
 
 
133 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.867125  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3260  putative inner membrane protein YqjF  30.4 
 
 
130 aa  41.6  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0480  DoxX family protein  30.65 
 
 
131 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.111786  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1115  hypothetical protein  30.65 
 
 
131 aa  42  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.192831  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0544  DoxX family protein  30.65 
 
 
131 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2955  Surfeit locus 4-related  26.36 
 
 
133 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287316  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3574  putative inner membrane protein YqjF  30.4 
 
 
130 aa  41.2  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0693  DoxX family protein  26.32 
 
 
138 aa  41.6  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0136  hypothetical protein  34.33 
 
 
145 aa  41.6  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.636829  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0600  DoxX family protein  30.4 
 
 
130 aa  41.2  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02921  hypothetical protein  30.4 
 
 
130 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0595  DoxX family protein  30.4 
 
 
130 aa  41.2  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3289  putative inner membrane protein YqjF  30.4 
 
 
130 aa  41.2  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02970  predicted quinol oxidase subunit  30.4 
 
 
130 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4416  putative inner membrane protein YqjF  30.4 
 
 
160 aa  40.8  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.260448 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3399  putative inner membrane protein YqjF  30.4 
 
 
160 aa  40.8  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1272  DoxX family protein  28.89 
 
 
160 aa  40.8  0.007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.938699  hitchhiker  0.000000103302 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1056  DoxX family protein  23.28 
 
 
133 aa  40.8  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>