27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1514 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1514  DoxX family protein  100 
 
 
167 aa  333  5e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0337781  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0979  DoxX family protein  47.26 
 
 
159 aa  125  3e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3019  methylamine utilization protein MauE, putative  36.43 
 
 
138 aa  89  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000103678  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0506  methylamine utilization protein MauE, putative  35.21 
 
 
138 aa  86.7  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3921  DoxX family protein  36.92 
 
 
146 aa  84.7  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.191374  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0588  DoxX family protein  33.09 
 
 
145 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000825958 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1657  DoxX family protein  34.58 
 
 
153 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.223819 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0575  DoxX family protein  31.3 
 
 
145 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405751  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3388  DoxX family protein  31.16 
 
 
140 aa  72  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0032  DoxX  38.46 
 
 
151 aa  67  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1453  DoxX family protein  33.64 
 
 
188 aa  61.2  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1352  DoxX family protein  31.13 
 
 
161 aa  60.5  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2522  methylamine utilization protein MauE, putative  36.46 
 
 
140 aa  59.7  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000286743  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2942  hypothetical protein  28.36 
 
 
192 aa  55.5  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161849  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1352  DoxX family protein  32.46 
 
 
154 aa  55.5  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.438565  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2885  DoxX family protein  35.09 
 
 
161 aa  53.1  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0914  DoxX  27.78 
 
 
188 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.491535  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2785  hypothetical protein  29.79 
 
 
97 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0310206  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0549  methylamine utilisation MauE  28.57 
 
 
188 aa  52  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.340856  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0381  DoxX family protein  32.53 
 
 
142 aa  51.2  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0203292  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1059  DoxX family protein  31.53 
 
 
173 aa  48.1  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0275169 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5633  DoxX family protein  24.04 
 
 
228 aa  47  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2872  DoxX family protein  29.36 
 
 
228 aa  46.6  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000635517  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0564  methylamine utilisation MauE  24.41 
 
 
186 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1676  DoxX family protein  33.01 
 
 
167 aa  43.9  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2976  DoxX family protein  24.78 
 
 
171 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13498  hypothetical protein  25 
 
 
364 aa  42  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>