13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0263 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0263  DoxX family protein  100 
 
 		 132 aa  245  1e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0153873  normal  0.498274 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0521  DoxX family protein  62.69 
 
 		 133 aa  133  7.000000000000001e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.609117  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1272  DoxX family protein  32.59 
 
 		 160 aa  52.8  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.938699  hitchhiker  0.000000103302 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  32.5 
 
 		 134 aa  45.1  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4189  DoxX family protein  28.12 
 
 		 164 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3493  hypothetical protein  31.4 
 
 		 161 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3420  putative inner membrane protein YqjF  31.4 
 
 		 161 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3589  putative inner membrane protein YqjF  31.4 
 
 		 161 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.24023 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3527  hypothetical protein  31.4 
 
 		 161 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0510711 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3423  hypothetical protein  31.4 
 
 		 161 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.318649  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4416  DoxX family protein  32.23 
 
 		 157 aa  40.4  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.386618  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3022  DoxX family protein  26.15 
 
 		 153 aa  40.4  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.43506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0096  DoxX  28.23 
 
 		 131 aa  40  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>