75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4416 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4416  DoxX family protein  100 
 
 		 157 aa  297  5e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.386618  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0830  DoxX family protein  58.46 
 
 		 149 aa  152  2e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1594  DoxX  64.62 
 
 		 137 aa  144  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570785  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1503  DoxX family protein  54.92 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2947  DoxX family protein  61.61 
 
 		 131 aa  134  6.0000000000000005e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.209298  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1056  hypothetical protein  53.28 
 
 		 130 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.461065  normal  0.259648 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1621  DoxX family protein  51.52 
 
 		 138 aa  130  7.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000382951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0829  DoxX family protein  50.76 
 
 		 140 aa  129  1.0000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0059  DoxX family protein  52.07 
 
 		 128 aa  125  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41597  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0096  DoxX  53.28 
 
 		 131 aa  125  3e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1443  DoxX  56.15 
 
 		 137 aa  120  7e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269044  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3090  DoxX family protein  45.93 
 
 		 144 aa  120  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.434652  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2974  DoxX  54.84 
 
 		 134 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00548742  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2799  DoxX family protein  47.01 
 
 		 144 aa  117  4.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0728  hypothetical protein  46.56 
 
 		 138 aa  117  6e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1627  DoxX  50.82 
 
 		 134 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.109453  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1247  DoxX family protein  45.8 
 
 		 143 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000114768  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1187  DoxX family protein  43.7 
 
 		 144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0687  DoxX  52.8 
 
 		 134 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115923  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1889  DoxX family protein  50.85 
 
 		 150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.306767  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2661  DoxX family protein  44.27 
 
 		 140 aa  110  7.000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.204335  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0945  DoxX family protein  46.15 
 
 		 136 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2934  DoxX family protein  43.09 
 
 		 143 aa  107  8.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173243  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1344  DoxX family protein  42.28 
 
 		 143 aa  102  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.197764  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1388  DoxX family protein  48.78 
 
 		 144 aa  101  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0915  DoxX  46.55 
 
 		 131 aa  101  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3963  DoxX family protein  51.89 
 
 		 114 aa  100  7e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804647  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0476  DoxX family protein  42.11 
 
 		 134 aa  97.1  8e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0125441  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0183  DoxX family protein  38.21 
 
 		 127 aa  96.7  1e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.313264  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1765  DoxX  43.9 
 
 		 127 aa  96.3  1e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2122  DoxX family protein  46.96 
 
 		 129 aa  90.9  7e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269415 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1661  DoxX  38.02 
 
 		 132 aa  86.3  1e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.430613  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3308  DoxX family protein  34.59 
 
 		 128 aa  86.3  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0176  SRC kinase associated phosphoprotein 2  34.51 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.479419  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  38.58 
 
 		 134 aa  62  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0456  DoxX family protein  36.36 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4310  DoxX family protein  34.01 
 
 		 147 aa  53.1  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0540  DoxX family protein  31.34 
 
 		 154 aa  50.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1058  membrane protein  34.35 
 
 		 172 aa  48.9  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.533713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0693  DoxX family protein  33.04 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2955  Surfeit locus 4-related  32.31 
 
 		 133 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5722  DoxX family protein  38.85 
 
 		 137 aa  47.8  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.486124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1461  DoxX  37.12 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6367  DoxX family protein  37.12 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7034  DoxX family protein  37.12 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.182123  normal  0.352709 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0849  DoxX family protein  35.2 
 
 		 137 aa  45.1  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  28.1 
 
 		 148 aa  45.1  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3635  DoxX family protein  40.51 
 
 		 131 aa  45.1  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176177  hitchhiker  0.000433315 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6128  hypothetical protein  40.45 
 
 		 144 aa  44.7  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.134606 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1172  DoxX family protein  41.35 
 
 		 155 aa  43.9  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3051  DoxX family protein  31.5 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.127697 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1442  DoxX family protein  31.18 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0022  hypothetical protein  33.59 
 
 		 146 aa  42.4  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1744499999999998e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3593  DoxX family protein  32.81 
 
 		 148 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306915 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1922  DoxX  30.5 
 
 		 149 aa  42.4  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.439341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2492  DoxX family protein  33.83 
 
 		 137 aa  42  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.212338  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2360  DoxX family protein  33.83 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.462375  normal  0.595687 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2120  DoxX family protein  31.16 
 
 		 296 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.484795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1376  DoxX family protein  33.33 
 
 		 143 aa  40.8  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.813801 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0526  DoxX family protein  31.34 
 
 		 154 aa  40.8  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0477659  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07631  hypothetical protein  31.45 
 
 		 185 aa  40.8  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0159355 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0526  DoxX family protein  31.25 
 
 		 154 aa  40.4  0.008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4257  hypothetical protein  39.53 
 
 		 134 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4095  hypothetical protein  39.53 
 
 		 134 aa  40.4  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.267519  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4106  hypothetical protein  39.53 
 
 		 134 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4480  hypothetical protein  39.53 
 
 		 134 aa  40.8  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4589  hypothetical protein  39.53 
 
 		 134 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4441  hypothetical protein  39.53 
 
 		 134 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0756  hypothetical protein  39.53 
 
 		 134 aa  40.8  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0131  hypothetical protein  31.45 
 
 		 185 aa  40.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4208  DoxX family protein  39.53 
 
 		 134 aa  40.4  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.550603  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4442  hypothetical protein  39.53 
 
 		 134 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4492  hypothetical protein  39.53 
 
 		 134 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0431  DoxX family protein  35.34 
 
 		 136 aa  40.4  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.143975 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3079  DoxX family protein  39.53 
 
 		 134 aa  40.4  0.01  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.738781  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>