109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1442 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1442  DoxX family protein  100 
 
 
152 aa  295  1e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0431  DoxX family protein  54.55 
 
 
136 aa  123  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.143975 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6128  hypothetical protein  58.27 
 
 
144 aa  114  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.134606 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2202  DoxX family protein  48.09 
 
 
144 aa  114  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273877  normal  0.79103 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0849  DoxX family protein  50 
 
 
137 aa  114  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2955  Surfeit locus 4-related  49.61 
 
 
133 aa  114  6e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287316  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4059  DoxX family protein  60.32 
 
 
131 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.528978  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4427  DoxX family protein  58.73 
 
 
131 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4541  DoxX family protein  59.52 
 
 
131 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0910404  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0845  DoxD-like family protein  45.74 
 
 
170 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.811875  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4512  DoxX family protein  54.4 
 
 
132 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.794637 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4310  DoxX family protein  45.31 
 
 
147 aa  106  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5776  DoxX family membrane protein  48.8 
 
 
137 aa  99  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.377997 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1834  DoxX  48.8 
 
 
137 aa  99  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2445  DoxX family protein  48.8 
 
 
137 aa  99  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.104283  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2492  DoxX family protein  46.67 
 
 
137 aa  97.1  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.212338  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1372  DoxX family protein  43.84 
 
 
152 aa  96.7  9e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2360  DoxX family protein  48 
 
 
137 aa  97.1  9e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.462375  normal  0.595687 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2450  DoxX family protein  48 
 
 
137 aa  96.7  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0306678  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5142  DoxX family protein  56.69 
 
 
132 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0698  DoxD-like family protein  49.19 
 
 
138 aa  93.6  8e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.303263  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1201  hypothetical protein  49.19 
 
 
138 aa  93.6  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2315  DoxD-like family protein  49.19 
 
 
138 aa  93.6  8e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0132725  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2972  DoxD-like family protein  49.19 
 
 
138 aa  93.6  8e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.390379  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1040  DoxX family membrane protein  49.19 
 
 
138 aa  93.6  8e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.404409  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1046  DoxX family protein  49.19 
 
 
138 aa  93.6  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291192  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1627  DoxD-like family protein  49.19 
 
 
138 aa  93.6  8e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00417873  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1006  DoxX family protein  49.49 
 
 
138 aa  93.6  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4177  DoxX  46.4 
 
 
140 aa  89.7  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3881  DoxX family protein  41.73 
 
 
144 aa  75.1  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000792478 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6404  DoxX  37.98 
 
 
143 aa  66.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256266  normal  0.0305648 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1056  DoxX family protein  39.8 
 
 
133 aa  65.5  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2953  DoxX  36.44 
 
 
147 aa  63.5  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4107  DoxX family protein  38.89 
 
 
144 aa  62  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  35.59 
 
 
134 aa  61.6  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  34.07 
 
 
148 aa  61.2  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  32.37 
 
 
147 aa  59.7  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2401  hypothetical protein  39.47 
 
 
156 aa  57  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.717688  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0096  DoxX  37.61 
 
 
131 aa  55.5  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1922  DoxX  29.84 
 
 
149 aa  53.9  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.439341  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0059  DoxX family protein  36.8 
 
 
128 aa  53.9  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41597  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  35 
 
 
148 aa  53.5  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03045  DoxX subfamily  40.21 
 
 
87 aa  53.5  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0614  DoxD-like family  42.47 
 
 
281 aa  52.8  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1503  DoxX family protein  32.58 
 
 
130 aa  52.4  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3262  DoxX family protein  38.61 
 
 
143 aa  52  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.83259  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0526  DoxX family protein  34.72 
 
 
154 aa  52  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1344  DoxX family protein  33.33 
 
 
143 aa  52  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.197764  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0022  hypothetical protein  36.97 
 
 
146 aa  51.6  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1744499999999998e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4416  DoxX family protein  33.61 
 
 
157 aa  50.8  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.386618  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1247  DoxX family protein  33.87 
 
 
143 aa  50.8  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000114768  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  33.33 
 
 
144 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  35.4 
 
 
148 aa  50.1  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1443  DoxX  35 
 
 
137 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269044  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  34.81 
 
 
144 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1539  DoxD family protein  41.1 
 
 
281 aa  50.1  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.636212  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0591  DoxX family protein  34.81 
 
 
147 aa  50.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1588  DoxX family protein  31.11 
 
 
239 aa  49.7  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.014966  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3457  DoxX family protein  34.09 
 
 
153 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1627  DoxX  32.03 
 
 
134 aa  48.5  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.109453  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  35.83 
 
 
149 aa  48.9  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4623  DoxX family protein  29.17 
 
 
139 aa  48.9  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000208807  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1187  DoxX family protein  30.15 
 
 
144 aa  48.5  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0206  DoxX family protein  36.84 
 
 
148 aa  48.1  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3521  DoxX family protein  34.09 
 
 
153 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34274  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4019  DoxX  36.59 
 
 
144 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394883  normal  0.482629 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34190  predicted membrane protein  38.38 
 
 
167 aa  47  0.00009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2112  DoxX family protein  35.25 
 
 
171 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.733626 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1388  DoxX family protein  32.62 
 
 
144 aa  46.6  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2661  DoxX family protein  30.65 
 
 
140 aa  47  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.204335  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3090  DoxX family protein  29.85 
 
 
144 aa  47  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.434652  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4592  DoxX family protein  35.25 
 
 
174 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2972  DoxX  52.17 
 
 
118 aa  45.4  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  29.82 
 
 
144 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4226  DoxX family protein  36.89 
 
 
173 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0540  DoxX family protein  30.77 
 
 
154 aa  44.7  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6484  DoxX family protein  31.71 
 
 
175 aa  44.3  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0570836  normal  0.12907 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1425  DoxX family protein  32.14 
 
 
154 aa  44.7  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.305544  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6351  DoxX family protein  28.38 
 
 
141 aa  44.3  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0687  DoxX  29.37 
 
 
134 aa  44.3  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115923  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2934  DoxX family protein  31.5 
 
 
143 aa  44.3  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173243  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0476  DoxX family protein  32.56 
 
 
134 aa  43.9  0.0008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0125441  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1765  DoxX  29.17 
 
 
127 aa  43.1  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0693  DoxX family protein  30.43 
 
 
138 aa  43.5  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2313  DoxX family protein  33.09 
 
 
145 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  hitchhiker  0.000213237 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1594  DoxX  30.63 
 
 
137 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570785  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  28.48 
 
 
149 aa  42.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2122  DoxX family protein  36.61 
 
 
129 aa  42.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0269415 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0829  DoxX family protein  32.23 
 
 
140 aa  42.7  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2947  DoxX family protein  32 
 
 
131 aa  43.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.209298  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3456  DoxX family protein  32.37 
 
 
145 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000181472 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  29.08 
 
 
149 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  29.63 
 
 
151 aa  42.4  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0606  DoxX family protein  38.32 
 
 
143 aa  42  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3092  hypothetical protein  28.67 
 
 
147 aa  41.6  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2799  DoxX family protein  32.26 
 
 
144 aa  41.6  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000957  hypothetical protein  34.07 
 
 
147 aa  41.6  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000422925  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0502  DoxX family membrane protein  31.46 
 
 
146 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2850  DoxX  48.89 
 
 
120 aa  41.2  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3308  DoxX family protein  29.23 
 
 
128 aa  41.2  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>