36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6367 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008544  Bcen2424_6367  DoxX family protein  100 
 
 		 139 aa  271  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1461  DoxX  100 
 
 		 139 aa  271  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7034  DoxX family protein  99.28 
 
 		 139 aa  270  7e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.182123  normal  0.352709 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5722  DoxX family protein  67.24 
 
 		 137 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.486124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1964  DoxX  55.38 
 
 		 138 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0240  hypothetical protein  56.1 
 
 		 145 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01610  hypothetical protein  33.05 
 
 		 123 aa  77.8  0.00000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.186029  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3635  DoxX family protein  39.17 
 
 		 131 aa  77.4  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176177  hitchhiker  0.000433315 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2328  DoxX family protein  33.05 
 
 		 137 aa  72  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.380358 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1376  DoxX family protein  32.26 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.813801 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0456  DoxX family protein  31.2 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3051  DoxX family protein  33.33 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.127697 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0824  DoxX family protein  33.05 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0639123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0320  DoxX family protein  32.43 
 
 		 144 aa  51.6  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0728  hypothetical protein  32.82 
 
 		 138 aa  50.4  0.000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1344  DoxX family protein  38.21 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.197764  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0687  DoxX  34.38 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115923  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4101  DoxX family protein  37.3 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1443  DoxX  36.73 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269044  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2661  DoxX family protein  34.92 
 
 		 140 aa  47  0.00009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.204335  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2947  DoxX family protein  34.19 
 
 		 131 aa  46.2  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.209298  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4416  DoxX family protein  37.12 
 
 		 157 aa  46.2  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.386618  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0096  DoxX  35.2 
 
 		 131 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1056  hypothetical protein  32.17 
 
 		 130 aa  43.5  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.461065  normal  0.259648 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1247  DoxX family protein  34.15 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000114768  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2934  DoxX family protein  34.13 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173243  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1594  DoxX  35.87 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570785  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1503  DoxX family protein  32.79 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0830  DoxX family protein  31.85 
 
 		 149 aa  42  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5453  DoxX family protein  28.45 
 
 		 136 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.403659  normal  0.232116 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3308  DoxX family protein  26.4 
 
 		 128 aa  42  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  41.18 
 
 		 134 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4682  thiosulphate:quinone oxidoreductase (TQO) small subunit(DoxD domain)  37.68 
 
 		 156 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.459173  normal  0.864959 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1889  DoxX family protein  38.16 
 
 		 150 aa  41.2  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.306767  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3128  DoxX family protein  30.95 
 
 		 166 aa  40.8  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0945  DoxX family protein  30.47 
 
 		 136 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>