142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1172 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1172  DoxX family protein  100 
 
 		 155 aa  291  3e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3790  DoxX family protein  36.92 
 
 		 181 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.459957 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3679  DoxX  35.86 
 
 		 162 aa  65.9  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  38.57 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  35.42 
 
 		 148 aa  64.7  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  36.99 
 
 		 148 aa  63.9  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4189  DoxX family protein  36.88 
 
 		 164 aa  63.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  38.17 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0667  DoxX family protein  36.17 
 
 		 180 aa  62.8  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  39.26 
 
 		 144 aa  62  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  38.17 
 
 		 144 aa  62  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  35.61 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3466  DoxX family protein  37.8 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  37.4 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  42.75 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1058  membrane protein  33.59 
 
 		 172 aa  57.4  0.00000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.533713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  37.12 
 
 		 147 aa  57  0.00000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0957  membrane protein  40.86 
 
 		 172 aa  56.6  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.699944  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07631  hypothetical protein  30.07 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0159355 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  42.59 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0131  hypothetical protein  29.58 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  35.11 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3850  DoxX family protein  39.42 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1457  hypothetical protein  29.29 
 
 		 182 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15611  hypothetical protein  30 
 
 		 183 aa  53.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0237618  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2748  DoxX family protein  32.14 
 
 		 198 aa  52  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.505798 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4019  DoxX  37.31 
 
 		 144 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394883  normal  0.482629 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4416  DoxX family protein  41.35 
 
 		 157 aa  51.6  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.386618  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15211  hypothetical protein  33.02 
 
 		 188 aa  51.2  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.869968  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1273  DoxX  40.14 
 
 		 150 aa  51.2  0.000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.346263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15461  hypothetical protein  30 
 
 		 183 aa  51.2  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.414315  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2112  DoxX family protein  33.85 
 
 		 171 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.733626 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1456  hypothetical protein  47.06 
 
 		 198 aa  50.1  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.32928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0138  DoxX family protein  42.42 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4829  DoxX family protein  36.22 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.37965 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3635  DoxX family protein  37.7 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176177  hitchhiker  0.000433315 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3092  hypothetical protein  30.83 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2375  DoxX family protein  48.57 
 
 		 197 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.65179  normal  0.888641 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2820  hypothetical protein  33.85 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.161166  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1342  DoxX family protein  34.92 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3022  DoxX family protein  30.99 
 
 		 153 aa  48.5  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.43506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2305  DoxX family protein  51.56 
 
 		 202 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0149049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2495  DoxX family protein  51.56 
 
 		 197 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.640487  hitchhiker  0.00764206 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1739  DoxX family protein  40.22 
 
 		 196 aa  48.9  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1426  hypothetical protein  32.09 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.165574 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4811  DoxX family protein  36.51 
 
 		 161 aa  48.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21600  hypothetical protein  40.66 
 
 		 196 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1915  DoxX family protein  40 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0302074  hitchhiker  0.0000000000182197 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1531  DoxX family protein  47.06 
 
 		 197 aa  48.1  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2754  DoxX family protein  37.31 
 
 		 131 aa  48.1  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0175423  hitchhiker  0.00133286 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1799  DoxX family protein  51.56 
 
 		 197 aa  48.1  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.534282  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02981  hypothetical protein  27.46 
 
 		 186 aa  47.8  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.925648  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0540  DoxX family protein  34.81 
 
 		 154 aa  47.4  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1616  DoxX  51.79 
 
 		 216 aa  47.4  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4592  DoxX family protein  33.59 
 
 		 174 aa  47.4  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0221  hypothetical protein  43.4 
 
 		 148 aa  47.4  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6484  DoxX family protein  32 
 
 		 175 aa  47  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0570836  normal  0.12907 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3233  DoxX family protein  39.52 
 
 		 405 aa  46.6  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0094  DoxX family protein  38.2 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0384  DoxX family protein  41.05 
 
 		 168 aa  47  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000957  hypothetical protein  39.86 
 
 		 147 aa  47  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000422925  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1389  hypothetical protein  42.11 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0236091 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02871  hypothetical protein  27.46 
 
 		 186 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.714602  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01610  hypothetical protein  33.33 
 
 		 123 aa  47  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.186029  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1839  hypothetical protein  41.56 
 
 		 196 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.780129  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1832  DoxX family protein  53.7 
 
 		 197 aa  46.6  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.174691  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2313  DoxX family protein  39.26 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  hitchhiker  0.000213237 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1133  hypothetical protein  39.72 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0161516 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0267  hypothetical protein  27.46 
 
 		 186 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3322  DoxX  37.37 
 
 		 180 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3384  DoxX family protein  37.37 
 
 		 180 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0241193  normal  0.0518004 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3333  DoxX family protein  37.37 
 
 		 180 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.671485  normal  0.176308 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02881  hypothetical protein  27.46 
 
 		 186 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4623  DoxX family protein  28.68 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000208807  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0782  DoxX  40.95 
 
 		 149 aa  45.4  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2953  DoxX  35.29 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3456  DoxX family protein  39.26 
 
 		 145 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000181472 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1631  hypothetical protein  27.74 
 
 		 177 aa  45.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2878  DoxX  32.24 
 
 		 132 aa  45.1  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03431  hypothetical protein  27.74 
 
 		 177 aa  45.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2586  DoxD-like family protein  41.18 
 
 		 232 aa  44.7  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1637  DoxX  43.94 
 
 		 137 aa  44.7  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00123238  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2947  DoxX family protein  35.09 
 
 		 131 aa  44.7  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.209298  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1056  hypothetical protein  33.33 
 
 		 130 aa  44.3  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.461065  normal  0.259648 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1048  DoxX  36.75 
 
 		 178 aa  44.3  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.083791  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1803  integral membrane protein  28.95 
 
 		 144 aa  44.3  0.0006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000242993  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5119  DoxX family protein  38.37 
 
 		 128 aa  44.3  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000103447  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0576  DoxX family protein  37.8 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.468844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1539  DoxD family protein  31.43 
 
 		 281 aa  44.3  0.0006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.636212  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1922  DoxX  35.46 
 
 		 149 aa  44.3  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.439341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0614  DoxD-like family  31.43 
 
 		 281 aa  43.9  0.0007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2120  DoxX family protein  30.6 
 
 		 296 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.484795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02921  hypothetical protein  28.26 
 
 		 190 aa  43.9  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1376  DoxX family protein  33.09 
 
 		 143 aa  43.9  0.0009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.813801 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1556  DoxX family protein  38.46 
 
 		 199 aa  43.9  0.0009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.783773  normal  0.0736532 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1187  DoxX family protein  33.88 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1755  DoxX family protein  38.52 
 
 		 144 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000356426 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1221  DoxX family protein  38.64 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.806219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1292  DoxX family protein  38.64 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0246117  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3090  DoxX family protein  34.71 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.434652  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>