34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_02871 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008816  A9601_02871  hypothetical protein  100 
 
 
186 aa  380  1e-105  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.714602  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02881  hypothetical protein  97.31 
 
 
186 aa  373  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0267  hypothetical protein  94.62 
 
 
186 aa  370  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02981  hypothetical protein  86.02 
 
 
186 aa  338  4e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.925648  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02921  hypothetical protein  77.78 
 
 
190 aa  279  1e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03431  hypothetical protein  73.18 
 
 
177 aa  266  2e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1631  hypothetical protein  74.43 
 
 
177 aa  263  1e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24841  hypothetical protein  64.1 
 
 
141 aa  175  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3790  DoxX family protein  38.1 
 
 
181 aa  67.4  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.459957 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3679  DoxX  35.17 
 
 
162 aa  67  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244445  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1058  membrane protein  30.37 
 
 
172 aa  59.7  0.00000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.533713  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07631  hypothetical protein  30.07 
 
 
185 aa  55.1  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0159355 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0131  hypothetical protein  30.07 
 
 
185 aa  55.5  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0957  membrane protein  30.21 
 
 
172 aa  50.4  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.699944  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3850  DoxX family protein  31.75 
 
 
149 aa  49.7  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3120  hypothetical protein  31.75 
 
 
149 aa  49.7  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1503  DoxX family protein  27.34 
 
 
130 aa  49.7  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15211  hypothetical protein  29.9 
 
 
188 aa  49.3  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.869968  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15611  hypothetical protein  27.27 
 
 
183 aa  48.9  0.00005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0237618  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15461  hypothetical protein  28.87 
 
 
183 aa  48.5  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.414315  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1457  hypothetical protein  26.52 
 
 
182 aa  47.8  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0728  hypothetical protein  30.47 
 
 
138 aa  47.4  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1621  DoxX family protein  30.15 
 
 
138 aa  46.2  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000382951  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0829  DoxX family protein  30.6 
 
 
140 aa  45.8  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1889  DoxX family protein  27.43 
 
 
150 aa  45.4  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.306767  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0830  DoxX family protein  28.29 
 
 
149 aa  44.7  0.0009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0059  DoxX family protein  27.46 
 
 
128 aa  43.9  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41597  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1443  DoxX  33.33 
 
 
137 aa  44.3  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269044  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0687  DoxX  29.63 
 
 
134 aa  43.1  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115923  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01610  hypothetical protein  36.08 
 
 
123 aa  43.5  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.186029  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0945  DoxX family protein  28.91 
 
 
136 aa  43.1  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0456  DoxX family protein  29.63 
 
 
153 aa  42.7  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1811  DoxX family protein  32.26 
 
 
366 aa  42.4  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.217697  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1765  DoxX  25.9 
 
 
127 aa  42  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>