77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0830 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0830  DoxX family protein  100 
 
 		 149 aa  298  1e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0728  hypothetical protein  68.84 
 
 		 138 aa  195  1.0000000000000001e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0945  DoxX family protein  70.77 
 
 		 136 aa  191  4e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1621  DoxX family protein  64.49 
 
 		 138 aa  184  3e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000382951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0829  DoxX family protein  63.64 
 
 		 140 aa  173  8e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1889  DoxX family protein  57.72 
 
 		 150 aa  165  2e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.306767  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4416  DoxX family protein  58.46 
 
 		 157 aa  150  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.386618  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3090  DoxX family protein  47.01 
 
 		 144 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.434652  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1388  DoxX family protein  47.06 
 
 		 144 aa  129  9e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1187  DoxX family protein  46.56 
 
 		 144 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0059  DoxX family protein  47.69 
 
 		 128 aa  124  5e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41597  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2934  DoxX family protein  47.01 
 
 		 143 aa  122  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173243  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2661  DoxX family protein  43.26 
 
 		 140 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.204335  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0096  DoxX  45.53 
 
 		 131 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3308  DoxX family protein  46.21 
 
 		 128 aa  119  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1247  DoxX family protein  41.73 
 
 		 143 aa  116  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000114768  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0476  DoxX family protein  44.78 
 
 		 134 aa  114  3e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0125441  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1765  DoxX  49.59 
 
 		 127 aa  114  3e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1627  DoxX  45.6 
 
 		 134 aa  113  6.9999999999999995e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.109453  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1344  DoxX family protein  41.18 
 
 		 143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.197764  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1056  hypothetical protein  44.26 
 
 		 130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.461065  normal  0.259648 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2799  DoxX family protein  42.75 
 
 		 144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0687  DoxX  44.19 
 
 		 134 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115923  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0915  DoxX  43.7 
 
 		 131 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3963  DoxX family protein  44.35 
 
 		 114 aa  106  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804647  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1503  DoxX family protein  40.98 
 
 		 130 aa  105  3e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1594  DoxX  48.09 
 
 		 137 aa  102  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570785  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2947  DoxX family protein  45.61 
 
 		 131 aa  99.8  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.209298  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1443  DoxX  44.27 
 
 		 137 aa  99.8  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269044  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2974  DoxX  39.84 
 
 		 134 aa  89.4  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00548742  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1661  DoxX  36.36 
 
 		 132 aa  87  7e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.430613  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0183  DoxX family protein  33.87 
 
 		 127 aa  84.3  5e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.313264  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2122  DoxX family protein  36.97 
 
 		 129 aa  79.3  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269415 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0456  DoxX family protein  36.92 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0176  SRC kinase associated phosphoprotein 2  33.94 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.479419  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  33.08 
 
 		 151 aa  53.5  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3051  DoxX family protein  30.71 
 
 		 136 aa  53.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.127697 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3635  DoxX family protein  33.33 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176177  hitchhiker  0.000433315 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  35.38 
 
 		 144 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0022  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  50.4  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1744499999999998e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  34.59 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  29.77 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0693  DoxX family protein  30.33 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  30.99 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  29.84 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01610  hypothetical protein  27.64 
 
 		 123 aa  47.4  0.00007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.186029  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5722  DoxX family protein  34.27 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.486124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  32.67 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1056  DoxX family protein  31.71 
 
 		 133 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0267  hypothetical protein  29.71 
 
 		 186 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02881  hypothetical protein  29.71 
 
 		 186 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4019  DoxX  34.59 
 
 		 144 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394883  normal  0.482629 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0138  DoxX family protein  35 
 
 		 147 aa  44.7  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  32.33 
 
 		 144 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  32.62 
 
 		 149 aa  44.7  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4811  DoxX family protein  42.5 
 
 		 161 aa  44.3  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02871  hypothetical protein  28.29 
 
 		 186 aa  44.7  0.0005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.714602  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  30.83 
 
 		 149 aa  43.9  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1058  membrane protein  30.23 
 
 		 172 aa  43.5  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.533713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24841  hypothetical protein  28.69 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0526  DoxX family protein  28.79 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6367  DoxX family protein  31.85 
 
 		 139 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2328  DoxX family protein  29.08 
 
 		 137 aa  41.6  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.380358 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1461  DoxX  31.85 
 
 		 139 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0849  DoxX family protein  29.23 
 
 		 137 aa  41.2  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1376  DoxX family protein  30.43 
 
 		 143 aa  41.2  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.813801 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7034  DoxX family protein  31.85 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.182123  normal  0.352709 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1389  hypothetical protein  31.82 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0236091 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3319  hypothetical protein  31.82 
 
 		 147 aa  40.8  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02981  hypothetical protein  28.03 
 
 		 186 aa  40.8  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.925648  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07631  hypothetical protein  30.33 
 
 		 185 aa  40.4  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0159355 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1366  DoxX family protein  31.06 
 
 		 147 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00676152 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1303  DoxX family protein  30.39 
 
 		 173 aa  40.4  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.279966 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2997  DoxX family protein  31.06 
 
 		 147 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4497  DoxX family protein  31 
 
 		 129 aa  40.4  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3593  DoxX family protein  30.89 
 
 		 148 aa  40.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306915 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0131  hypothetical protein  30.33 
 
 		 185 aa  40  0.009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>