138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2947 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2947  DoxX family protein  100 
 
 		 131 aa  249  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.209298  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4416  DoxX family protein  61.6 
 
 		 157 aa  145  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.386618  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1503  DoxX family protein  58.2 
 
 		 130 aa  136  1e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1056  hypothetical protein  55.12 
 
 		 130 aa  130  6.999999999999999e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.461065  normal  0.259648 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0059  DoxX family protein  53.97 
 
 		 128 aa  127  4.0000000000000003e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41597  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0096  DoxX  52.38 
 
 		 131 aa  124  5e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2974  DoxX  57.14 
 
 		 134 aa  121  3e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00548742  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1443  DoxX  58.04 
 
 		 137 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269044  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1594  DoxX  59.2 
 
 		 137 aa  118  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570785  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1247  DoxX family protein  46.77 
 
 		 143 aa  117  3.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000114768  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0829  DoxX family protein  43.75 
 
 		 140 aa  114  3e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0728  hypothetical protein  44.88 
 
 		 138 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0687  DoxX  52.34 
 
 		 134 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115923  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0830  DoxX family protein  45.67 
 
 		 149 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1621  DoxX family protein  49.18 
 
 		 138 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000382951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1187  DoxX family protein  45.74 
 
 		 144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2934  DoxX family protein  45.16 
 
 		 143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173243  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1627  DoxX  46.34 
 
 		 134 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.109453  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1344  DoxX family protein  45.16 
 
 		 143 aa  108  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.197764  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3090  DoxX family protein  44.96 
 
 		 144 aa  108  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.434652  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1388  DoxX family protein  49.18 
 
 		 144 aa  108  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2661  DoxX family protein  43.55 
 
 		 140 aa  107  6e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.204335  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2799  DoxX family protein  46.51 
 
 		 144 aa  104  4e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0915  DoxX  46.55 
 
 		 131 aa  101  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3963  DoxX family protein  50.96 
 
 		 114 aa  100  6e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804647  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0945  DoxX family protein  41.94 
 
 		 136 aa  99.8  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1765  DoxX  38.1 
 
 		 127 aa  97.1  8e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1889  DoxX family protein  44.44 
 
 		 150 aa  95.1  3e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.306767  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2122  DoxX family protein  46.55 
 
 		 129 aa  93.6  9e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269415 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1661  DoxX  35.66 
 
 		 132 aa  89.7  1e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.430613  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0183  DoxX family protein  38.71 
 
 		 127 aa  90.1  1e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.313264  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0476  DoxX family protein  38.93 
 
 		 134 aa  89.7  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0125441  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3308  DoxX family protein  35.43 
 
 		 128 aa  79.3  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  39.83 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  34.59 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  34.75 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0176  SRC kinase associated phosphoprotein 2  31.82 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.479419  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0022  hypothetical protein  38.17 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1744499999999998e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4310  DoxX family protein  36.43 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  33.33 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0540  DoxX family protein  33.33 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0221  hypothetical protein  40 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1273  DoxX  36.09 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.346263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2955  Surfeit locus 4-related  30.16 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  36.08 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  35.54 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  34.69 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0456  DoxX family protein  32.58 
 
 		 153 aa  52  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01610  hypothetical protein  32.31 
 
 		 123 aa  51.6  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.186029  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  34.35 
 
 		 144 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  36.36 
 
 		 149 aa  51.2  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  34.69 
 
 		 148 aa  50.8  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4592  DoxX family protein  41.27 
 
 		 174 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0138  DoxX family protein  39.2 
 
 		 147 aa  50.4  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2112  DoxX family protein  42.06 
 
 		 171 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.733626 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1389  hypothetical protein  33.83 
 
 		 146 aa  50.4  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0236091 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0693  DoxX family protein  29.32 
 
 		 138 aa  50.4  0.000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1461  DoxX  34.92 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6367  DoxX family protein  34.92 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2120  DoxX family protein  37.5 
 
 		 296 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.484795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7034  DoxX family protein  34.92 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.182123  normal  0.352709 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3881  DoxX family protein  37.5 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000792478 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3051  DoxX family protein  30 
 
 		 136 aa  48.5  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.127697 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6351  DoxX family protein  35.34 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0526  DoxX family protein  35.16 
 
 		 154 aa  48.5  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1426  hypothetical protein  40.21 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.165574 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0782  DoxX  36.57 
 
 		 149 aa  47.8  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1922  DoxX  33.33 
 
 		 149 aa  47.8  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.439341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1221  DoxX family protein  36.84 
 
 		 147 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.806219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1292  DoxX family protein  36.84 
 
 		 147 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0246117  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3319  hypothetical protein  36.84 
 
 		 147 aa  47.4  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000957  hypothetical protein  37.11 
 
 		 147 aa  47.4  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000422925  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  29.41 
 
 		 144 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3457  DoxX family protein  36.17 
 
 		 153 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3338  DoxX family protein  30.53 
 
 		 133 aa  47.4  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4492  hypothetical protein  38.66 
 
 		 134 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3521  DoxX family protein  36.17 
 
 		 153 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34274  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1222  DoxX family protein  36.84 
 
 		 147 aa  47.4  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0756  hypothetical protein  38.66 
 
 		 134 aa  47  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4480  hypothetical protein  38.66 
 
 		 134 aa  47  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4257  hypothetical protein  38.66 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4095  hypothetical protein  38.66 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.267519  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4106  hypothetical protein  38.66 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4441  hypothetical protein  38.66 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4589  hypothetical protein  38.66 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6128  hypothetical protein  38.54 
 
 		 144 aa  46.2  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.134606 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  29.41 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0849  DoxX family protein  35.38 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4208  DoxX family protein  38.66 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.550603  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4442  hypothetical protein  38.46 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0230  DoxX  33.63 
 
 		 136 aa  46.2  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  unclonable  3.19876e-23 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2014  DoxX family protein  35.16 
 
 		 179 aa  46.2  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3837  SURF4 domain-containing protein  34.09 
 
 		 137 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4083  DoxX  42.86 
 
 		 173 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4159  DoxX family protein  42.86 
 
 		 173 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.273208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1172  DoxX family protein  36.29 
 
 		 155 aa  45.1  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4313  DoxX family protein  42.86 
 
 		 173 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.514901 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5722  DoxX family protein  33.59 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.486124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0104  putative integral membrane protein  30.83 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.489951  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3012  DoxX family protein  30.08 
 
 		 147 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>