84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0431 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_0431  DoxX family protein  100 
 
 
136 aa  256  6e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.143975 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2955  Surfeit locus 4-related  53.54 
 
 
133 aa  127  6e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287316  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4310  DoxX family protein  51.82 
 
 
147 aa  126  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2202  DoxX family protein  57.85 
 
 
144 aa  124  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273877  normal  0.79103 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6128  hypothetical protein  60 
 
 
144 aa  123  9e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.134606 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4512  DoxX family protein  61.48 
 
 
132 aa  122  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.794637 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4427  DoxX family protein  61.29 
 
 
131 aa  118  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4541  DoxX family protein  62.9 
 
 
131 aa  118  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0910404  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4059  DoxX family protein  62.1 
 
 
131 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.528978  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5142  DoxX family protein  62.4 
 
 
132 aa  114  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0849  DoxX family protein  54.47 
 
 
137 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0845  DoxD-like family protein  58.04 
 
 
170 aa  108  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.811875  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1442  DoxX family protein  54.55 
 
 
152 aa  107  7.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4177  DoxX  52.03 
 
 
140 aa  104  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1834  DoxX  52.34 
 
 
137 aa  103  6e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2445  DoxX family protein  52.34 
 
 
137 aa  103  6e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.104283  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5776  DoxX family membrane protein  52.38 
 
 
137 aa  102  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.377997 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1006  DoxX family protein  57.58 
 
 
138 aa  102  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1040  DoxX family membrane protein  58.04 
 
 
138 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.404409  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2315  DoxD-like family protein  58.04 
 
 
138 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0132725  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2360  DoxX family protein  54.62 
 
 
137 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.462375  normal  0.595687 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2972  DoxD-like family protein  58.04 
 
 
138 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.390379  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1046  DoxX family protein  58.04 
 
 
138 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291192  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1627  DoxD-like family protein  58.04 
 
 
138 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00417873  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1201  hypothetical protein  58.04 
 
 
138 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0698  DoxD-like family protein  58.04 
 
 
138 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.303263  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2450  DoxX family protein  51.56 
 
 
137 aa  101  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0306678  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2492  DoxX family protein  54.62 
 
 
137 aa  101  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.212338  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03045  DoxX subfamily  53.61 
 
 
87 aa  84  7e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1372  DoxX family protein  41.46 
 
 
152 aa  82.4  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  34.92 
 
 
148 aa  55.5  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4623  DoxX family protein  32.31 
 
 
139 aa  52  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000208807  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0614  DoxD-like family  32.54 
 
 
281 aa  51.2  0.000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1627  DoxX  31.2 
 
 
134 aa  50.8  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.109453  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0591  DoxX family protein  35.77 
 
 
147 aa  50.4  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1765  DoxX  31.67 
 
 
127 aa  49.7  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1539  DoxD family protein  32.54 
 
 
281 aa  48.9  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.636212  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2953  DoxX  36.59 
 
 
147 aa  48.9  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4019  DoxX  38.46 
 
 
144 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394883  normal  0.482629 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2411  DoxX-like  35.81 
 
 
154 aa  49.3  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0526  DoxX family protein  29.86 
 
 
154 aa  47.4  0.00007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34190  predicted membrane protein  38.84 
 
 
167 aa  45.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0921  hypothetical protein  39.18 
 
 
134 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.77995e-43 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2257  DoxD-like family protein  39.84 
 
 
144 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.418604  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2401  hypothetical protein  33.04 
 
 
156 aa  45.1  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.717688  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0735  hypothetical protein  39.18 
 
 
134 aa  44.7  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.7492600000000004e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0990  hypothetical protein  39.18 
 
 
134 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0667403  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1187  DoxX family protein  30.65 
 
 
144 aa  44.3  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0786  hypothetical protein  39.18 
 
 
134 aa  44.3  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000245891  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4456  hypothetical protein  39.18 
 
 
134 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0296685  normal  0.654993 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0879  hypothetical protein  39.18 
 
 
134 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0825  hypothetical protein  39.18 
 
 
134 aa  44.3  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116306  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0735  DoxX family protein  39.18 
 
 
134 aa  44.3  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0648582  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3092  hypothetical protein  33.62 
 
 
147 aa  44.3  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0722  hypothetical protein  39.18 
 
 
134 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000540501  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4714  DoxX family protein  27.88 
 
 
148 aa  43.9  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.16997 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  33.33 
 
 
144 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0701  DoxX family protein  32.37 
 
 
128 aa  43.9  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0022  hypothetical protein  34.58 
 
 
146 aa  43.5  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1744499999999998e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5120  DoxX family protein  32.5 
 
 
205 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.996543 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2062  DoxD-like family protein  40.28 
 
 
144 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.697173 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0456  DoxX family protein  31.45 
 
 
153 aa  43.1  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0693  DoxX family protein  28.7 
 
 
138 aa  42.4  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1803  integral membrane protein  31.67 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000242993  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3881  DoxX family protein  36.19 
 
 
144 aa  42.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000792478 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3457  DoxX family protein  33.61 
 
 
153 aa  41.6  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3521  DoxX family protein  33.61 
 
 
153 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34274  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3090  DoxX family protein  28.46 
 
 
144 aa  42  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.434652  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4106  hypothetical protein  40.24 
 
 
134 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4589  hypothetical protein  40.24 
 
 
134 aa  41.2  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0687  DoxX  37.07 
 
 
134 aa  41.6  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115923  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4095  hypothetical protein  40.24 
 
 
134 aa  41.2  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.267519  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4441  hypothetical protein  40.24 
 
 
134 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4257  hypothetical protein  40.24 
 
 
134 aa  41.2  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4442  hypothetical protein  40.24 
 
 
134 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0476  DoxX family protein  30.77 
 
 
134 aa  41.2  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0125441  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4492  hypothetical protein  40.24 
 
 
134 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4208  DoxX family protein  40.24 
 
 
134 aa  41.2  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.550603  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0059  DoxX family protein  31.54 
 
 
128 aa  40.8  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41597  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  32.35 
 
 
134 aa  40.8  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0096  DoxX  30.6 
 
 
131 aa  40.4  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  30.22 
 
 
151 aa  40.4  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1344  DoxX family protein  30.4 
 
 
143 aa  40.4  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.197764  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4416  DoxX family protein  35.34 
 
 
157 aa  40  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.386618  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>