134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4541 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4541  DoxX family protein  100 
 
 		 131 aa  245  1e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0910404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4427  DoxX family protein  93.89 
 
 		 131 aa  209  1e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4059  DoxX family protein  93.13 
 
 		 131 aa  204  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.528978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5142  DoxX family protein  88.46 
 
 		 132 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4512  DoxX family protein  76.92 
 
 		 132 aa  160  8.000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.794637 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6128  hypothetical protein  72.66 
 
 		 144 aa  155  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.134606 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0431  DoxX family protein  62.9 
 
 		 136 aa  134  4e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.143975 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4310  DoxX family protein  53.97 
 
 		 147 aa  119  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2955  Surfeit locus 4-related  52.27 
 
 		 133 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0849  DoxX family protein  53.91 
 
 		 137 aa  114  6e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2202  DoxX family protein  50.77 
 
 		 144 aa  110  9e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273877  normal  0.79103 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1442  DoxX family protein  59.52 
 
 		 152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0845  DoxD-like family protein  54.13 
 
 		 170 aa  101  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.811875  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1834  DoxX  53.12 
 
 		 137 aa  101  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2445  DoxX family protein  53.12 
 
 		 137 aa  101  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.104283  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2360  DoxX family protein  53.12 
 
 		 137 aa  101  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.462375  normal  0.595687 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2492  DoxX family protein  53.12 
 
 		 137 aa  100  8e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.212338  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1372  DoxX family protein  47.33 
 
 		 152 aa  99.8  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2450  DoxX family protein  52.34 
 
 		 137 aa  99.4  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0306678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5776  DoxX family membrane protein  51.56 
 
 		 137 aa  98.2  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.377997 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4177  DoxX  49.61 
 
 		 140 aa  92.8  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1006  DoxX family protein  53.78 
 
 		 138 aa  93.2  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0698  DoxD-like family protein  52.1 
 
 		 138 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.303263  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1201  hypothetical protein  52.1 
 
 		 138 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2315  DoxD-like family protein  52.1 
 
 		 138 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0132725  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2972  DoxD-like family protein  52.1 
 
 		 138 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.390379  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1040  DoxX family membrane protein  52.1 
 
 		 138 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.404409  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1046  DoxX family protein  52.1 
 
 		 138 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291192  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1627  DoxD-like family protein  52.1 
 
 		 138 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00417873  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03045  DoxX subfamily  54.26 
 
 		 87 aa  72.8  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3881  DoxX family protein  42.59 
 
 		 144 aa  63.5  0.0000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000792478 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6404  DoxX  44.76 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256266  normal  0.0305648 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0022  hypothetical protein  42.27 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1744499999999998e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6484  DoxX family protein  37.5 
 
 		 175 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0570836  normal  0.12907 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3521  DoxX family protein  38.13 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34274  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3092  hypothetical protein  39.17 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3457  DoxX family protein  38.74 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0591  DoxX family protein  42.42 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4019  DoxX  41.67 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394883  normal  0.482629 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  37.84 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  33.33 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  39.45 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  39.45 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1454  DoxX family protein  48.1 
 
 		 136 aa  53.5  0.0000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1096  DoxX family protein  39.81 
 
 		 118 aa  53.9  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000704586  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1118  DoxX family protein  39.81 
 
 		 118 aa  53.9  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000073687  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  40.21 
 
 		 148 aa  53.5  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0059  DoxX family protein  36.92 
 
 		 128 aa  53.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41597  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2953  DoxX  39.18 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  39.45 
 
 		 149 aa  51.6  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1426  hypothetical protein  37.5 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.165574 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0136  hypothetical protein  34.65 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.636829  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34190  predicted membrane protein  36.05 
 
 		 167 aa  51.2  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  40 
 
 		 149 aa  51.2  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1056  DoxX family protein  36.08 
 
 		 133 aa  51.2  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1539  DoxD family protein  38.89 
 
 		 281 aa  51.2  0.000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.636212  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0614  DoxD-like family  38.71 
 
 		 281 aa  50.4  0.000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0190  DoxX  33.86 
 
 		 145 aa  50.1  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000463146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1922  DoxX  33.33 
 
 		 149 aa  50.1  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.439341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2820  DoxX family protein  40 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3375  DoxX  36.94 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  40 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  35.71 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3262  DoxX family protein  40.8 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.83259  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1775  DoxX family protein  28.7 
 
 		 152 aa  47.8  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.019545 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2313  DoxX family protein  39.53 
 
 		 145 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  hitchhiker  0.000213237 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0735  hypothetical protein  43.16 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.7492600000000004e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1627  DoxX  32.82 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.109453  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  37.82 
 
 		 144 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0879  hypothetical protein  43.16 
 
 		 134 aa  47  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0786  hypothetical protein  43.16 
 
 		 134 aa  47  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000245891  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0825  hypothetical protein  43.16 
 
 		 134 aa  47  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116306  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4456  hypothetical protein  43.16 
 
 		 134 aa  47  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0296685  normal  0.654993 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4623  DoxX family protein  38.46 
 
 		 139 aa  47  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000208807  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0990  hypothetical protein  43.16 
 
 		 134 aa  47  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0667403  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0735  DoxX family protein  43.16 
 
 		 134 aa  47  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0648582  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0921  hypothetical protein  43.16 
 
 		 134 aa  47  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.77995e-43 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0722  hypothetical protein  43.16 
 
 		 134 aa  47  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000540501  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0687  DoxX  35.48 
 
 		 134 aa  47  0.00009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115923  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0559  DoxX family protein  39.58 
 
 		 159 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3456  DoxX family protein  38.76 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000181472 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0907  DoxX  46.24 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  36.13 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1755  DoxX family protein  40.2 
 
 		 144 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000356426 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0206  DoxX family protein  40.37 
 
 		 148 aa  44.3  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4226  DoxX family protein  36.36 
 
 		 173 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1915  DoxX family protein  37.98 
 
 		 145 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0302074  hitchhiker  0.0000000000182197 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0606  DoxX family protein  43.88 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4083  DoxX  36.36 
 
 		 173 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4159  DoxX family protein  36.36 
 
 		 173 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.273208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4313  DoxX family protein  36.36 
 
 		 173 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.514901 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2112  DoxX family protein  36.36 
 
 		 171 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.733626 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0502  DoxX family membrane protein  35.79 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1637  DoxX  35.77 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00123238  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  34.95 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0526  DoxX family protein  32.67 
 
 		 154 aa  43.1  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0883  DoxX family protein  36.56 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4592  DoxX family protein  36.36 
 
 		 174 aa  42.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0096  DoxX  32.38 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1588  DoxX family protein  36.84 
 
 		 239 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.014966  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>