62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1627 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1627  DoxX  100 
 
 
134 aa  262  1e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.109453  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0687  DoxX  55.22 
 
 
134 aa  144  6e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115923  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0059  DoxX family protein  56.59 
 
 
128 aa  141  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41597  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0096  DoxX  53.97 
 
 
131 aa  128  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1503  DoxX family protein  49.62 
 
 
130 aa  128  3e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0829  DoxX family protein  52.76 
 
 
140 aa  127  4.0000000000000003e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1056  hypothetical protein  48.87 
 
 
130 aa  124  6e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.461065  normal  0.259648 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1187  DoxX family protein  44.12 
 
 
144 aa  119  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0728  hypothetical protein  45.11 
 
 
138 aa  118  1.9999999999999998e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3090  DoxX family protein  45.59 
 
 
144 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.434652  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1621  DoxX family protein  48.12 
 
 
138 aa  114  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000382951  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4416  DoxX family protein  50 
 
 
157 aa  114  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.386618  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0830  DoxX family protein  45.6 
 
 
149 aa  113  6.9999999999999995e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2974  DoxX  50.79 
 
 
134 aa  111  3e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00548742  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0476  DoxX family protein  42.64 
 
 
134 aa  111  4.0000000000000004e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0125441  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2661  DoxX family protein  42.54 
 
 
140 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.204335  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1443  DoxX  46.9 
 
 
137 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269044  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1247  DoxX family protein  41.79 
 
 
143 aa  108  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000114768  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0945  DoxX family protein  42.11 
 
 
136 aa  107  5e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2934  DoxX family protein  41.04 
 
 
143 aa  105  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173243  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2799  DoxX family protein  44.19 
 
 
144 aa  105  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1388  DoxX family protein  41.04 
 
 
144 aa  104  4e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1594  DoxX  48.25 
 
 
137 aa  103  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570785  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2947  DoxX family protein  46.55 
 
 
131 aa  103  7e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.209298  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1344  DoxX family protein  40.3 
 
 
143 aa  102  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.197764  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1765  DoxX  41.41 
 
 
127 aa  98.6  2e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0915  DoxX  47.86 
 
 
131 aa  96.3  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3963  DoxX family protein  42.86 
 
 
114 aa  94  7e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804647  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0183  DoxX family protein  36.92 
 
 
127 aa  92.4  2e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.313264  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3308  DoxX family protein  35.94 
 
 
128 aa  88.2  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1889  DoxX family protein  41.35 
 
 
150 aa  88.2  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.306767  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1661  DoxX  38.89 
 
 
132 aa  85.5  2e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.430613  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2122  DoxX family protein  37.82 
 
 
129 aa  75.9  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0269415 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0176  SRC kinase associated phosphoprotein 2  38.81 
 
 
129 aa  71.6  0.000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.479419  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4310  DoxX family protein  32.31 
 
 
147 aa  58.2  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0431  DoxX family protein  31.2 
 
 
136 aa  50.8  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.143975 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1058  membrane protein  28 
 
 
172 aa  48.5  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.533713  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0693  DoxX family protein  31.09 
 
 
138 aa  47  0.00009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0526  DoxX family protein  29.92 
 
 
154 aa  46.2  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2955  Surfeit locus 4-related  29.55 
 
 
133 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287316  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2120  DoxX family protein  31.58 
 
 
296 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.484795  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0428  DoxX family protein  31.67 
 
 
133 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0401173  normal  0.859055 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02921  hypothetical protein  27.34 
 
 
190 aa  43.9  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3457  DoxX family protein  33.01 
 
 
153 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3521  DoxX family protein  33.01 
 
 
153 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34274  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0384  DoxX family protein  29.51 
 
 
150 aa  43.5  0.0009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.762474  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4059  DoxX family protein  35.23 
 
 
131 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.528978  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3338  DoxX family protein  30.25 
 
 
133 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0462  DoxX family protein  30 
 
 
133 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0742916 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2081  DoxX family protein  28.89 
 
 
130 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0953416  normal  0.292835 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4241  DoxX family protein  32.06 
 
 
297 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.46248 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1922  DoxX  28.87 
 
 
149 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.439341  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0957  membrane protein  32.1 
 
 
172 aa  42.4  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.699944  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0022  hypothetical protein  29.46 
 
 
146 aa  42.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1744499999999998e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0499  DoxX family protein  31.15 
 
 
134 aa  41.6  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0660687 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02881  hypothetical protein  27.56 
 
 
186 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02981  hypothetical protein  30 
 
 
186 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.925648  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0104  putative integral membrane protein  26.27 
 
 
147 aa  41.2  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.489951  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0667  DoxX family protein  31.01 
 
 
180 aa  40.8  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5722  DoxX family protein  34 
 
 
137 aa  40.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.486124  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1436  DoxX family protein  28.57 
 
 
164 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.673301 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3593  DoxX family protein  27.64 
 
 
148 aa  40.4  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.306915 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>