52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2048 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2048  DoxX family protein  100 
 
 
139 aa  275  1e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000018933  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1803  integral membrane protein  29.93 
 
 
144 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000242993  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3790  DoxX family protein  32.56 
 
 
181 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.459957 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2112  DoxX family protein  28.57 
 
 
171 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.733626 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4623  DoxX family protein  26.77 
 
 
139 aa  48.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000208807  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  30.08 
 
 
148 aa  47.8  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3092  hypothetical protein  29.23 
 
 
147 aa  47.8  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0347  DoxX  33.59 
 
 
130 aa  47.4  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000430544  normal  0.0908673 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1934  DoxX family protein  31.39 
 
 
155 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.467271  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3837  SURF4 domain-containing protein  31.39 
 
 
137 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1058  membrane protein  30.53 
 
 
172 aa  47  0.00008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.533713  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6086  DoxX family protein  31.01 
 
 
137 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0786046  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5848  DoxX family protein  31.01 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2953  DoxX  29.46 
 
 
147 aa  45.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  28.89 
 
 
134 aa  44.7  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0957  membrane protein  28.35 
 
 
172 aa  44.3  0.0005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.699944  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5400  DoxX family protein  27.21 
 
 
137 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358694  normal  0.0708806 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3035  DoxX family protein  31.88 
 
 
140 aa  44.3  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.156785  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6351  DoxX family protein  27.42 
 
 
141 aa  44.3  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0934  DoxX  33.07 
 
 
140 aa  43.9  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  25.58 
 
 
151 aa  43.9  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4811  DoxX family protein  33.61 
 
 
161 aa  43.5  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4226  DoxX family protein  26.83 
 
 
173 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0191  hypothetical protein  27.64 
 
 
133 aa  42.7  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4592  DoxX family protein  26.83 
 
 
174 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6046  DoxX family protein  27.91 
 
 
137 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.392213 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6484  DoxX family protein  27.2 
 
 
175 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0570836  normal  0.12907 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0529  DoxX  30.47 
 
 
164 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.494405 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  27.42 
 
 
149 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  29.32 
 
 
148 aa  42.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3262  DoxX family protein  27.64 
 
 
143 aa  42.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.83259  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0173  hypothetical protein  27.64 
 
 
133 aa  42  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00275718  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2695  hypothetical protein  32 
 
 
155 aa  41.6  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3775  putative inner membrane protein YphA  32 
 
 
140 aa  41.6  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1125  DoxX family protein  32 
 
 
140 aa  41.6  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  26.4 
 
 
149 aa  41.6  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2696  putative inner membrane protein YphA  32 
 
 
140 aa  41.6  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1134  DoxX family protein  32 
 
 
140 aa  41.6  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2828  hypothetical protein  32 
 
 
140 aa  41.6  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02435  predicted inner membrane protein  32 
 
 
164 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15611  hypothetical protein  28 
 
 
183 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0237618  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  27.07 
 
 
149 aa  41.2  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02399  hypothetical protein  32 
 
 
164 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1436  DoxX family protein  29.63 
 
 
164 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.673301 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2081  DoxX family protein  28.03 
 
 
130 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0953416  normal  0.292835 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1457  hypothetical protein  27.2 
 
 
182 aa  40.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  27.82 
 
 
148 aa  40.4  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3021  DoxX family protein  30 
 
 
133 aa  40  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.867125  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3057  DoxX family protein  29.29 
 
 
149 aa  40  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4159  DoxX family protein  26.02 
 
 
173 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.273208  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3881  DoxX family protein  30.95 
 
 
144 aa  40  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000792478 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4083  DoxX  26.02 
 
 
173 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>