40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0824 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0824  DoxX family protein  100 
 
 		 147 aa  292  1e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0639123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2328  DoxX family protein  38.97 
 
 		 137 aa  87.8  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.380358 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3051  DoxX family protein  40.91 
 
 		 136 aa  81.6  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.127697 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01610  hypothetical protein  35.83 
 
 		 123 aa  77.8  0.00000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.186029  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1376  DoxX family protein  44.62 
 
 		 143 aa  78.2  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.813801 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3635  DoxX family protein  34.55 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176177  hitchhiker  0.000433315 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0456  DoxX family protein  40.16 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4101  DoxX family protein  36.11 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6367  DoxX family protein  33.05 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7034  DoxX family protein  33.05 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.182123  normal  0.352709 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1461  DoxX  33.05 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1058  membrane protein  33.33 
 
 		 172 aa  60.5  0.000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.533713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5722  DoxX family protein  32.58 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.486124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1964  DoxX  32.48 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5453  DoxX family protein  33.61 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.403659  normal  0.232116 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0131  hypothetical protein  32.85 
 
 		 185 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0957  membrane protein  31.17 
 
 		 172 aa  48.9  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.699944  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07631  hypothetical protein  32.12 
 
 		 185 aa  48.9  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0159355 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3268  DoxX family protein  28.78 
 
 		 198 aa  48.1  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15611  hypothetical protein  31.58 
 
 		 183 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0237618  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0945  DoxX family protein  34.68 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3090  DoxX family protein  29.6 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.434652  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1187  DoxX family protein  28.8 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0830  DoxX family protein  31.71 
 
 		 149 aa  45.1  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15461  hypothetical protein  31.58 
 
 		 183 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.414315  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  32.85 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1457  hypothetical protein  30.15 
 
 		 182 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0240  hypothetical protein  26.55 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15211  hypothetical protein  31.58 
 
 		 188 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.869968  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3790  DoxX family protein  32.56 
 
 		 181 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.459957 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1456  hypothetical protein  29.84 
 
 		 198 aa  42.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.32928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0934  DoxX  35.77 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1531  DoxX family protein  30.11 
 
 		 197 aa  42  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0104  putative integral membrane protein  30.17 
 
 		 147 aa  41.2  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.489951  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1436  DoxX family protein  25.32 
 
 		 164 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.673301 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0728  hypothetical protein  32.54 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1388  DoxX family protein  29.69 
 
 		 144 aa  40.8  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0384  DoxX family protein  31.46 
 
 		 150 aa  40.4  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.762474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0526  DoxX family protein  29.58 
 
 		 154 aa  40.4  0.009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0667  DoxX family protein  31.11 
 
 		 180 aa  40  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>