26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5453 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5453  DoxX family protein  100 
 
 		 136 aa  271  3e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.403659  normal  0.232116 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0456  DoxX family protein  36.43 
 
 		 153 aa  71.2  0.000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1376  DoxX family protein  40.17 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.813801 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3051  DoxX family protein  35.83 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.127697 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3635  DoxX family protein  32.76 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176177  hitchhiker  0.000433315 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01610  hypothetical protein  33.63 
 
 		 123 aa  52.4  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.186029  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2328  DoxX family protein  30.89 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.380358 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0010  DoxX family protein  31.78 
 
 		 143 aa  47.4  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4811  DoxX family protein  39.47 
 
 		 161 aa  46.2  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  36.84 
 
 		 144 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5722  DoxX family protein  33.08 
 
 		 137 aa  44.3  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.486124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  28.57 
 
 		 148 aa  43.9  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0945  DoxX family protein  29.01 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3338  DoxX family protein  32 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  34.74 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  32.5 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0230  DoxX  33.33 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  unclonable  3.19876e-23 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0824  DoxX family protein  39.44 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0639123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1344  DoxX family protein  33.33 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.197764  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1461  DoxX  28.45 
 
 		 139 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  37.63 
 
 		 149 aa  42  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7034  DoxX family protein  28.45 
 
 		 139 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.182123  normal  0.352709 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6367  DoxX family protein  28.45 
 
 		 139 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0320  DoxX family protein  26.05 
 
 		 144 aa  41.2  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1765  DoxX  29.07 
 
 		 127 aa  40.4  0.007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3092  hypothetical protein  34.52 
 
 		 147 aa  40.8  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>