46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1303 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1303  DoxX family protein  100 
 
 		 173 aa  341  2e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.279966 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3375  DoxX  65.77 
 
 		 171 aa  195  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.239229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0991  hypothetical protein  64.19 
 
 		 169 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1906  DoxX family protein  58.6 
 
 		 162 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.646959  normal  0.313164 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2400  DoxX family protein  61.22 
 
 		 162 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3295  DoxX family protein  61.22 
 
 		 162 aa  145  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2006  DoxX family protein  59.87 
 
 		 160 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.439778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2637  DoxX family protein  46.67 
 
 		 153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.920826  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1137  hypothetical protein  41.84 
 
 		 152 aa  105  2e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1839  hypothetical protein  34.54 
 
 		 196 aa  64.7  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.780129  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21600  hypothetical protein  31.89 
 
 		 196 aa  64.3  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3092  hypothetical protein  31.72 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1803  integral membrane protein  29.25 
 
 		 144 aa  60.5  0.00000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000242993  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1556  DoxX family protein  31.71 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.783773  normal  0.0736532 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2375  DoxX family protein  35.83 
 
 		 197 aa  54.3  0.0000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.65179  normal  0.888641 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1456  hypothetical protein  30.22 
 
 		 198 aa  53.5  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.32928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2305  DoxX family protein  35.83 
 
 		 202 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0149049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2495  DoxX family protein  31.12 
 
 		 197 aa  53.1  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.640487  hitchhiker  0.00764206 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3022  DoxX family protein  26.32 
 
 		 153 aa  51.6  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.43506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1799  DoxX family protein  33.33 
 
 		 197 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.534282  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0022  hypothetical protein  34.23 
 
 		 146 aa  50.4  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1744499999999998e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1616  DoxX  34.17 
 
 		 216 aa  49.7  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0809  DoxD family protein  32.03 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.570745  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2748  DoxX family protein  27.53 
 
 		 198 aa  49.3  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.505798 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1832  DoxX family protein  28.02 
 
 		 197 aa  47.8  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.174691  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2316  DoxX  40.59 
 
 		 196 aa  47.4  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  33.11 
 
 		 134 aa  47  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2710  hypothetical protein  35 
 
 		 197 aa  46.6  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1531  DoxX family protein  29.94 
 
 		 197 aa  46.6  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4649  DoxX  28.65 
 
 		 174 aa  45.8  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4189  DoxX family protein  29.5 
 
 		 164 aa  45.4  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3268  DoxX family protein  33.76 
 
 		 198 aa  44.7  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5146  DoxX family protein  33.58 
 
 		 154 aa  43.9  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.535914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1739  DoxX family protein  26.8 
 
 		 196 aa  44.3  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2479  DoxX family protein  35 
 
 		 197 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0540  DoxX family protein  28 
 
 		 154 aa  43.9  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1846  DoxX family protein  34.17 
 
 		 197 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  36.78 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1807  DoxX family protein  34.17 
 
 		 197 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2328  DoxX family protein  26.76 
 
 		 137 aa  42.7  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.380358 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1922  DoxX  30 
 
 		 149 aa  42  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.439341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3790  DoxX family protein  29.29 
 
 		 181 aa  41.2  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.459957 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2820  hypothetical protein  29.8 
 
 		 130 aa  41.2  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.161166  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2679  DoxX  29.38 
 
 		 156 aa  40.8  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.777331 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1890  DoxX family protein  38.61 
 
 		 195 aa  40.8  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0830  DoxX family protein  28.57 
 
 		 149 aa  40.8  0.01  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>