54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2679 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2679  DoxX  100 
 
 		 156 aa  310  5.999999999999999e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.777331 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0755  DoxX family protein  53.91 
 
 		 154 aa  124  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.351795 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1605  DoxX  45 
 
 		 175 aa  121  5e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4682  thiosulphate:quinone oxidoreductase (TQO) small subunit(DoxD domain)  49.64 
 
 		 156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.459173  normal  0.864959 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0301  DoxX family protein  46.62 
 
 		 157 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.30143 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1240  DoxX  40 
 
 		 171 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.962981 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2030  DoxX family protein  43.54 
 
 		 189 aa  107  7.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.774237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4788  DoxX  45 
 
 		 154 aa  103  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3128  DoxX family protein  43.41 
 
 		 166 aa  101  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6307  DoxX family protein  56.2 
 
 		 161 aa  100  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188963  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1002  hypothetical protein  40.13 
 
 		 154 aa  99.4  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.527815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2188  DoxX family protein  59.84 
 
 		 155 aa  94  6e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.62019  normal  0.793728 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3068  DoxX family protein  59.84 
 
 		 155 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00512546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3394  hypothetical protein  40.43 
 
 		 141 aa  89.4  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.763235  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0990  DoxX family protein  53.6 
 
 		 128 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1027  DoxX family protein  46.15 
 
 		 155 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.692978 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002082  membrane protein  39.07 
 
 		 151 aa  76.6  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00355  NADH dehydrogenase  39.22 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0584  hypothetical protein  39.39 
 
 		 165 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.399737  normal  0.684343 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1432  DoxX family protein  40.15 
 
 		 175 aa  74.7  0.0000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4649  DoxX  40.48 
 
 		 174 aa  72.8  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0941  DoxX family protein  38.28 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.93269 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2032  hypothetical protein  39.51 
 
 		 167 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5146  DoxX family protein  39.42 
 
 		 154 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.535914  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5936  DoxX family protein  39.71 
 
 		 172 aa  63.5  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0809  DoxD family protein  34.09 
 
 		 154 aa  63.5  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.570745  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2690  DoxX  35.16 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.360255  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3395  DoxD family protein  36.57 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.586532  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1137  hypothetical protein  34.03 
 
 		 152 aa  57.4  0.00000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2361  DoxX family protein  36.8 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.182713  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0722  hypothetical protein  34.67 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0702  hypothetical protein  37.12 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2957  hypothetical protein  40.68 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2495  DoxX family protein  30.19 
 
 		 197 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.640487  hitchhiker  0.00764206 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2305  DoxX family protein  30 
 
 		 202 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0149049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2375  DoxX family protein  30.86 
 
 		 197 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.65179  normal  0.888641 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0022  hypothetical protein  31.91 
 
 		 146 aa  48.1  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1744499999999998e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0727  hypothetical protein  33.33 
 
 		 738 aa  46.6  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0707  hypothetical protein  31.52 
 
 		 738 aa  46.2  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1799  DoxX family protein  28.48 
 
 		 197 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.534282  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1725  DoxX  27.57 
 
 		 187 aa  44.3  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  38.2 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  30.77 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4289  DoxX family protein  31.25 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4399  DoxX family protein  31.25 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7034  DoxX family protein  31.34 
 
 		 139 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.182123  normal  0.352709 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3457  DoxX family protein  35.25 
 
 		 153 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2821  hypothetical protein  37.66 
 
 		 142 aa  42.4  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.149072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0771  DoxX family protein  29.57 
 
 		 188 aa  42  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.135412 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0540  DoxX family protein  32.59 
 
 		 154 aa  41.6  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0190  DoxX  28.08 
 
 		 145 aa  40.8  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000463146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3521  DoxX family protein  34.53 
 
 		 153 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34274  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0526  DoxX family protein  34.48 
 
 		 154 aa  40.4  0.009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2637  DoxX family protein  27.69 
 
 		 153 aa  40.4  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.920826  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>