77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1890 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1890  DoxX family protein  100 
 
 		 195 aa  385  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2748  DoxX family protein  85.57 
 
 		 198 aa  335  1.9999999999999998e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.505798 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1832  DoxX family protein  85.19 
 
 		 197 aa  327  9e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.174691  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2305  DoxX family protein  78.24 
 
 		 202 aa  306  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0149049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2375  DoxX family protein  77.72 
 
 		 197 aa  304  6e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.65179  normal  0.888641 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2495  DoxX family protein  77.72 
 
 		 197 aa  303  8.000000000000001e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.640487  hitchhiker  0.00764206 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1531  DoxX family protein  75.26 
 
 		 197 aa  301  3.0000000000000004e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1799  DoxX family protein  74.74 
 
 		 197 aa  296  1e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.534282  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1456  hypothetical protein  78.21 
 
 		 198 aa  290  1e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.32928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2479  DoxX family protein  75.26 
 
 		 197 aa  288  5.0000000000000004e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1807  DoxX family protein  74.74 
 
 		 197 aa  286  1e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1846  DoxX family protein  74.74 
 
 		 197 aa  286  2e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1739  DoxX family protein  77.13 
 
 		 196 aa  283  8e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2316  DoxX  78.01 
 
 		 196 aa  266  2e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2710  hypothetical protein  75.26 
 
 		 197 aa  266  2e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1616  DoxX  61.73 
 
 		 216 aa  246  1e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01645  DoxX  61.22 
 
 		 204 aa  233  1.0000000000000001e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0455186  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21600  hypothetical protein  60.64 
 
 		 196 aa  223  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1839  hypothetical protein  59.57 
 
 		 196 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.780129  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1556  DoxX family protein  60.53 
 
 		 199 aa  209  3e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.783773  normal  0.0736532 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2586  DoxD-like family protein  45.66 
 
 		 232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3092  hypothetical protein  36.7 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1803  integral membrane protein  40 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000242993  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3268  DoxX family protein  35.85 
 
 		 198 aa  62  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0131  hypothetical protein  36.84 
 
 		 185 aa  53.9  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07631  hypothetical protein  36.84 
 
 		 185 aa  54.3  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0159355 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  36.04 
 
 		 149 aa  52  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1303  DoxX family protein  30.61 
 
 		 173 aa  51.2  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.279966 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  33.66 
 
 		 134 aa  50.1  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4189  DoxX family protein  32.24 
 
 		 164 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  38.3 
 
 		 149 aa  49.3  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  29.41 
 
 		 144 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15611  hypothetical protein  36.26 
 
 		 183 aa  48.9  0.00004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0237618  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15461  hypothetical protein  36.26 
 
 		 183 aa  49.3  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.414315  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1457  hypothetical protein  35.16 
 
 		 182 aa  48.5  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  35.63 
 
 		 148 aa  48.1  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0529  DoxX  27.69 
 
 		 164 aa  47.8  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.494405 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  28.82 
 
 		 144 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1376  DoxX family protein  40 
 
 		 143 aa  47.8  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.813801 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  28.65 
 
 		 147 aa  47.8  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6046  DoxX family protein  35.71 
 
 		 137 aa  47.4  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.392213 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15211  hypothetical protein  38.04 
 
 		 188 aa  47.8  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.869968  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0173  hypothetical protein  27.93 
 
 		 133 aa  46.6  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00275718  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5222  DoxX family protein  35.96 
 
 		 144 aa  47  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1058  membrane protein  38.27 
 
 		 172 aa  47  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.533713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3022  DoxX family protein  44.44 
 
 		 153 aa  45.8  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.43506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  28.73 
 
 		 151 aa  45.8  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  37.25 
 
 		 148 aa  46.2  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0191  hypothetical protein  27.93 
 
 		 133 aa  46.2  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1637  DoxX  37.04 
 
 		 137 aa  46.2  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00123238  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4045  DoxX family protein  34.48 
 
 		 135 aa  45.8  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0512358 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  36.27 
 
 		 148 aa  45.4  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3635  DoxX family protein  37.33 
 
 		 131 aa  45.4  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176177  hitchhiker  0.000433315 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1426  hypothetical protein  38.74 
 
 		 149 aa  45.4  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.165574 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  31.3 
 
 		 144 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0566  hypothetical protein  50 
 
 		 145 aa  45.4  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00681752  normal  0.504746 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0941  DoxX family protein  33.33 
 
 		 145 aa  44.7  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.93269 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0957  membrane protein  36.78 
 
 		 172 aa  44.7  0.0008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.699944  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01610  hypothetical protein  30.21 
 
 		 123 aa  43.9  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.186029  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0022  hypothetical protein  26.92 
 
 		 146 aa  44.7  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1744499999999998e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2953  DoxX  33.59 
 
 		 147 aa  43.9  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2173  DoxX family protein  32.05 
 
 		 161 aa  43.5  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.529053  normal  0.821104 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0354  DoxX  30.59 
 
 		 127 aa  43.9  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388731  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3021  DoxX family protein  32.43 
 
 		 133 aa  43.9  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.867125  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3790  DoxX family protein  37.97 
 
 		 181 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.459957 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4226  DoxX family protein  32.65 
 
 		 173 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6351  DoxX family protein  37.08 
 
 		 141 aa  42.7  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4811  DoxX family protein  35.24 
 
 		 161 aa  42.4  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4028  DoxX family protein  30.48 
 
 		 135 aa  42  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3319  hypothetical protein  38.24 
 
 		 147 aa  41.6  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2995  DoxX family protein  35.44 
 
 		 143 aa  41.6  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00203576  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4558  DoxX family protein  33.33 
 
 		 135 aa  41.6  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1389  hypothetical protein  37.62 
 
 		 146 aa  41.6  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0236091 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0809  DoxD family protein  34.62 
 
 		 154 aa  41.6  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.570745  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5848  DoxX family protein  32.14 
 
 		 137 aa  41.2  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7619  DoxX  34.52 
 
 		 137 aa  41.2  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0991  hypothetical protein  37.62 
 
 		 169 aa  41.2  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>