45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1605 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1605  DoxX  100 
 
 		 175 aa  355  1.9999999999999998e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1240  DoxX  71.24 
 
 		 171 aa  229  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.962981 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0301  DoxX family protein  55.63 
 
 		 157 aa  165  4e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.30143 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3128  DoxX family protein  48.45 
 
 		 166 aa  159  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6307  DoxX family protein  58.09 
 
 		 161 aa  135  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188963  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0755  DoxX family protein  49.63 
 
 		 154 aa  130  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.351795 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4682  thiosulphate:quinone oxidoreductase (TQO) small subunit(DoxD domain)  55.83 
 
 		 156 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.459173  normal  0.864959 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4788  DoxX  44.08 
 
 		 154 aa  126  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2679  DoxX  45 
 
 		 156 aa  121  6e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.777331 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0990  DoxX family protein  53.9 
 
 		 128 aa  117  9e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1027  DoxX family protein  52.74 
 
 		 155 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.692978 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3068  DoxX family protein  51.06 
 
 		 155 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00512546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2188  DoxX family protein  51.11 
 
 		 155 aa  103  9e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.62019  normal  0.793728 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5936  DoxX family protein  43.88 
 
 		 172 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1002  hypothetical protein  43.08 
 
 		 154 aa  95.9  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.527815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2032  hypothetical protein  40.51 
 
 		 167 aa  94.7  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2030  DoxX family protein  43.18 
 
 		 189 aa  94.7  6e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.774237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3394  hypothetical protein  42.28 
 
 		 141 aa  91.3  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.763235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5146  DoxX family protein  38.12 
 
 		 154 aa  88.2  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.535914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4649  DoxX  37.57 
 
 		 174 aa  75.9  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0809  DoxD family protein  36.92 
 
 		 154 aa  74.3  0.0000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.570745  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1432  DoxX family protein  36.5 
 
 		 175 aa  72.4  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2361  DoxX family protein  35.86 
 
 		 160 aa  72.4  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.182713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0584  hypothetical protein  34.81 
 
 		 165 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.399737  normal  0.684343 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00355  NADH dehydrogenase  34.75 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002082  membrane protein  33.33 
 
 		 151 aa  67.4  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2690  DoxX  39.42 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.360255  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0702  hypothetical protein  33.09 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3395  DoxD family protein  32.14 
 
 		 156 aa  63.9  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.586532  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0722  hypothetical protein  33.09 
 
 		 154 aa  63.9  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2957  hypothetical protein  36.92 
 
 		 155 aa  60.5  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0941  DoxX family protein  31.47 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.93269 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0707  hypothetical protein  34.44 
 
 		 738 aa  55.5  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0727  hypothetical protein  35.56 
 
 		 738 aa  55.5  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2328  DoxX family protein  32.73 
 
 		 137 aa  50.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.380358 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0100  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.63 
 
 		 730 aa  48.5  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0098  DoxD family protein/pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  29.63 
 
 		 752 aa  48.9  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1137  hypothetical protein  26.57 
 
 		 152 aa  44.7  0.0007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1725  DoxX  27.33 
 
 		 187 aa  43.9  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1616  DoxX  38.96 
 
 		 216 aa  43.1  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2821  hypothetical protein  31.65 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.149072  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3122  DoxX family protein  29.86 
 
 		 139 aa  42.4  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461418  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1531  DoxX family protein  28.57 
 
 		 197 aa  42  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  32.61 
 
 		 149 aa  42  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1376  DoxX family protein  32.14 
 
 		 143 aa  40.8  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.813801 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>