46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0584 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0584  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  323  7e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.399737  normal  0.684343 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1432  DoxX family protein  67.59 
 
 		 175 aa  197  6e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4649  DoxX  63.58 
 
 		 174 aa  192  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3394  hypothetical protein  60.8 
 
 		 141 aa  158  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.763235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5936  DoxX family protein  45.51 
 
 		 172 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5146  DoxX family protein  49.62 
 
 		 154 aa  128  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.535914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2032  hypothetical protein  50.81 
 
 		 167 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4682  thiosulphate:quinone oxidoreductase (TQO) small subunit(DoxD domain)  45.61 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.459173  normal  0.864959 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0301  DoxX family protein  43.2 
 
 		 157 aa  77.4  0.00000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.30143 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1240  DoxX  36.71 
 
 		 171 aa  77  0.00000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.962981 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2679  DoxX  39.39 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.777331 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2188  DoxX family protein  47.2 
 
 		 155 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.62019  normal  0.793728 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0755  DoxX family protein  40 
 
 		 154 aa  74.7  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.351795 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2030  DoxX family protein  41.07 
 
 		 189 aa  73.6  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.774237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3128  DoxX family protein  40.6 
 
 		 166 aa  71.2  0.000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3068  DoxX family protein  38.85 
 
 		 155 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00512546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1605  DoxX  34.81 
 
 		 175 aa  69.3  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6307  DoxX family protein  42.98 
 
 		 161 aa  67.8  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188963  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1027  DoxX family protein  42.86 
 
 		 155 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.692978 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4788  DoxX  36.72 
 
 		 154 aa  66.6  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0990  DoxX family protein  42.06 
 
 		 128 aa  64.7  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0809  DoxD family protein  35.66 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.570745  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3395  DoxD family protein  35.07 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.586532  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0098  DoxD family protein/pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  37.5 
 
 		 752 aa  55.5  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0100  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.5 
 
 		 730 aa  55.5  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1137  hypothetical protein  36.79 
 
 		 152 aa  53.5  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00355  NADH dehydrogenase  29.92 
 
 		 151 aa  53.1  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1002  hypothetical protein  34.62 
 
 		 154 aa  53.1  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.527815  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0722  hypothetical protein  31.82 
 
 		 154 aa  51.2  0.000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0702  hypothetical protein  31.82 
 
 		 154 aa  51.2  0.000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4399  DoxX family protein  31.9 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4289  DoxX family protein  31.9 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002082  membrane protein  29.23 
 
 		 151 aa  48.5  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0022  hypothetical protein  32.17 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1744499999999998e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2690  DoxX  34.55 
 
 		 152 aa  45.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.360255  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2361  DoxX family protein  31.62 
 
 		 160 aa  45.4  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.182713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2637  DoxX family protein  28.66 
 
 		 153 aa  45.1  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.920826  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15611  hypothetical protein  38.64 
 
 		 183 aa  43.9  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0237618  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1457  hypothetical protein  37.5 
 
 		 182 aa  43.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15461  hypothetical protein  38.64 
 
 		 183 aa  42.4  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.414315  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1058  membrane protein  31.91 
 
 		 172 aa  41.6  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.533713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0941  DoxX family protein  28.99 
 
 		 145 aa  41.6  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.93269 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0540  DoxX family protein  28.21 
 
 		 154 aa  41.6  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  27.21 
 
 		 148 aa  41.2  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1839  hypothetical protein  30.77 
 
 		 196 aa  41.2  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.780129  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1803  integral membrane protein  25 
 
 		 144 aa  40.8  0.008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000242993  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>