55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0301 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0301  DoxX family protein  100 
 
 		 157 aa  315  2e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.30143 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3128  DoxX family protein  70.75 
 
 		 166 aa  214  2.9999999999999998e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1240  DoxX  54.36 
 
 		 171 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.962981 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1605  DoxX  55.63 
 
 		 175 aa  165  2.9999999999999998e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4682  thiosulphate:quinone oxidoreductase (TQO) small subunit(DoxD domain)  55.7 
 
 		 156 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.459173  normal  0.864959 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0755  DoxX family protein  52.34 
 
 		 154 aa  134  5e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.351795 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4788  DoxX  47.41 
 
 		 154 aa  133  8e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6307  DoxX family protein  58.54 
 
 		 161 aa  128  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188963  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1027  DoxX family protein  56.2 
 
 		 155 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.692978 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0990  DoxX family protein  57.81 
 
 		 128 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3068  DoxX family protein  49.37 
 
 		 155 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00512546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2188  DoxX family protein  50.33 
 
 		 155 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.62019  normal  0.793728 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2679  DoxX  46.62 
 
 		 156 aa  114  6.9999999999999995e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.777331 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3394  hypothetical protein  49.3 
 
 		 141 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.763235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2030  DoxX family protein  51.49 
 
 		 189 aa  98.2  4e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.774237  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5936  DoxX family protein  39.74 
 
 		 172 aa  97.1  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5146  DoxX family protein  41.61 
 
 		 154 aa  96.3  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.535914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2032  hypothetical protein  36.59 
 
 		 167 aa  90.1  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1002  hypothetical protein  35.46 
 
 		 154 aa  88.6  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.527815  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0809  DoxD family protein  37.01 
 
 		 154 aa  80.9  0.000000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.570745  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1432  DoxX family protein  43.18 
 
 		 175 aa  80.5  0.000000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002082  membrane protein  38.13 
 
 		 151 aa  78.2  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0584  hypothetical protein  43.2 
 
 		 165 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.399737  normal  0.684343 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4649  DoxX  43.55 
 
 		 174 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0702  hypothetical protein  34.11 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0722  hypothetical protein  33.33 
 
 		 154 aa  74.3  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00355  NADH dehydrogenase  35.97 
 
 		 151 aa  73.2  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2361  DoxX family protein  36.57 
 
 		 160 aa  72  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.182713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0941  DoxX family protein  30.56 
 
 		 145 aa  68.6  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.93269 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3395  DoxD family protein  35.83 
 
 		 156 aa  65.1  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.586532  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2690  DoxX  36.29 
 
 		 152 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.360255  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2957  hypothetical protein  37.1 
 
 		 155 aa  57.4  0.00000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4399  DoxX family protein  35.82 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4289  DoxX family protein  35.82 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0707  hypothetical protein  29.46 
 
 		 738 aa  52.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0727  hypothetical protein  28.68 
 
 		 738 aa  52  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02374  hypothetical protein  34.64 
 
 		 162 aa  49.7  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.861023  normal  0.0466865 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0098  DoxD family protein/pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  32.17 
 
 		 752 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0100  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.17 
 
 		 730 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1058  membrane protein  32.28 
 
 		 172 aa  48.5  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.533713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1376  DoxX family protein  27.59 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.813801 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1137  hypothetical protein  29.2 
 
 		 152 aa  47  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2328  DoxX family protein  26.24 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.380358 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2305  DoxX family protein  28.45 
 
 		 202 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0149049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2375  DoxX family protein  29.46 
 
 		 197 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.65179  normal  0.888641 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2151  transporter  24.63 
 
 		 132 aa  45.1  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.447191  normal  0.895246 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2821  hypothetical protein  29.27 
 
 		 142 aa  44.7  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.149072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1531  DoxX family protein  28.7 
 
 		 197 aa  43.5  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2495  DoxX family protein  28.83 
 
 		 197 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.640487  hitchhiker  0.00764206 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2748  DoxX family protein  29.73 
 
 		 198 aa  42  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.505798 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15461  hypothetical protein  30.23 
 
 		 183 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.414315  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15611  hypothetical protein  30.23 
 
 		 183 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0237618  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1839  hypothetical protein  33.68 
 
 		 196 aa  40.8  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.780129  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21600  hypothetical protein  33.68 
 
 		 196 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1457  hypothetical protein  29.46 
 
 		 182 aa  40.4  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>