22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1425 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1425  DoxX family protein  100 
 
 		 154 aa  300  6.000000000000001e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.305544  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3989  DoxX family protein  39.01 
 
 		 144 aa  104  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00241422  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3658  DoxX family protein  36.42 
 
 		 151 aa  84.3  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2336  DoxX family protein  37.96 
 
 		 144 aa  80.1  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0793003  normal  0.864327 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3675  DoxX family protein  38.36 
 
 		 145 aa  80.1  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00136141  normal  0.200959 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2545  DoxX family protein  36.11 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.714949  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4811  DoxX family protein  32.59 
 
 		 161 aa  50.8  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1342  DoxX family protein  35.48 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4623  DoxX family protein  27.14 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000208807  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  28.47 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  28.47 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2953  DoxX  35.71 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1442  DoxX family protein  36.47 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1803  integral membrane protein  31.43 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000242993  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2878  DoxX  34.57 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0540  DoxX family protein  29.29 
 
 		 154 aa  41.6  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02947  DoxD-like membrane protein  33.71 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  31.17 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  33.77 
 
 		 151 aa  41.2  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  36.99 
 
 		 149 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4829  DoxX family protein  26.15 
 
 		 133 aa  41.2  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.37965 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1219  DoxX family protein  29.21 
 
 		 156 aa  40.8  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.901202  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>