13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3658 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3658  DoxX family protein  100 
 
 		 151 aa  296  5e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3989  DoxX family protein  49.66 
 
 		 144 aa  154  6e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00241422  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2336  DoxX family protein  47.95 
 
 		 144 aa  124  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0793003  normal  0.864327 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3675  DoxX family protein  44.9 
 
 		 145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00136141  normal  0.200959 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1425  DoxX family protein  36.42 
 
 		 154 aa  100  5e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.305544  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2545  DoxX family protein  32.88 
 
 		 140 aa  74.7  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.714949  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2820  hypothetical protein  32.31 
 
 		 130 aa  53.5  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.161166  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1342  DoxX family protein  37.18 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3509  DoxX family protein  25.2 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3841  DoxX family protein  25.56 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2878  DoxX  29.79 
 
 		 132 aa  41.2  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4811  DoxX family protein  31.25 
 
 		 161 aa  40.8  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  30 
 
 		 147 aa  40.4  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>