More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2971 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_2970  D-alanine--D-alanine ligase  93.91 
 
 		 361 aa  707    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2971  D-alanine--D-alanine ligase  100 
 
 		 361 aa  749    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.157266 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4256  D-alanine--D-alanine ligase  37.64 
 
 		 339 aa  172  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.231762  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0494  D-alanine--D-alanine ligase  30.13 
 
 		 305 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.922593  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3971  D-alanine--D-alanine ligase  29.92 
 
 		 310 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1847  D-alanyl-alanine synthetase A  27.24 
 
 		 328 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00879872  normal  0.0251209 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0511  D-alanine/D-alanine ligase  29.71 
 
 		 305 aa  109  6e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3066  D-alanine--D-alanine ligase  30.08 
 
 		 316 aa  105  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0944  D-alanine--D-alanine ligase  30.04 
 
 		 306 aa  100  3e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000259534  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0667  D-alanine/D-alanine ligase  28.88 
 
 		 313 aa  96.3  7e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.621467  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0415  D-alanine--D-alanine ligase  29.65 
 
 		 627 aa  95.5  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3286  D-alanine--D-alanine ligase  28.77 
 
 		 310 aa  94.7  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1631  D-alanyl-alanine synthetase A  27.42 
 
 		 360 aa  94  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2618  D-alanyl-alanine synthetase A  27.92 
 
 		 323 aa  92  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1370  D-alanyl-alanine synthetase A  27.39 
 
 		 325 aa  92.4  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.675036  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0850  D-alanyl-alanine synthetase A  30 
 
 		 366 aa  92  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.237365 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28460  D-alanine--D-alanine ligase  26.88 
 
 		 317 aa  92  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.289482  hitchhiker  0.00300353 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2077  D-alanine--D-alanine ligase  28.46 
 
 		 308 aa  92  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.335568  hitchhiker  0.00112188 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0298  D-alanyl-alanine synthetase A  28 
 
 		 364 aa  90.9  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0952  D-alanine/D-alanine ligase  27.5 
 
 		 311 aa  90.9  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00328  D-alanylalanine synthetase  28 
 
 		 364 aa  90.5  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3227  D-alanine/D-alanine ligase  28 
 
 		 364 aa  90.5  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0410  D-alanyl-alanine synthetase A  28 
 
 		 364 aa  90.5  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0447  D-alanyl-alanine synthetase A  28 
 
 		 364 aa  90.5  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0453  D-alanyl-alanine synthetase A  28 
 
 		 364 aa  90.5  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0406  D-alanyl-alanine synthetase A  28 
 
 		 364 aa  90.5  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2004  D-alanine--D-alanine ligase  31.63 
 
 		 308 aa  90.5  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3251  D-alanyl-alanine synthetase A  28 
 
 		 364 aa  90.5  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.10036 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4102  D-alanine--D-alanine ligase  28.24 
 
 		 311 aa  89.4  9e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.422713 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14120  D-alanine--D-alanine ligase  29.05 
 
 		 313 aa  89  1e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0183  D-alanine--D-alanine ligase  29.41 
 
 		 337 aa  88.2  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000736036  normal  0.566039 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1480  D-alanyl-alanine synthetase A  26.01 
 
 		 360 aa  87.8  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.351068 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4691  D-alanine--D-alanine ligase  28.47 
 
 		 323 aa  87  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4182  D-alanine--D-alanine ligase  31.91 
 
 		 363 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.512251  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3114  D-alanine/D-alanine ligase  28.45 
 
 		 307 aa  87  5e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.188134  hitchhiker  0.0000000168198 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0169  D-alanine--D-alanine ligase  28.45 
 
 		 337 aa  86.3  7e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0022958  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0136  D-alanine/D-alanine ligase  31.47 
 
 		 302 aa  86.3  8e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5946  D-alanyl-alanine synthetase A  24.58 
 
 		 329 aa  85.9  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.588243  normal  0.0506502 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3919  D-alanyl-alanine synthetase A  31.13 
 
 		 363 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27971  normal  0.219568 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1240  D-alanine--D-alanine ligase  29.11 
 
 		 306 aa  84.3  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07996  D-alanylalanine synthetase  25.93 
 
 		 324 aa  84.3  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.598131  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2589  D-alanine--D-alanine ligase  28.94 
 
 		 308 aa  84.3  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2074  D-alanine--D-alanine ligase  29.5 
 
 		 304 aa  84  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.1873 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2977  D-alanine--D-alanine ligase  26.56 
 
 		 327 aa  83.6  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2887  D-alanine--D-alanine ligase  27.82 
 
 		 300 aa  83.6  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.130361  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1331  D-alanyl-alanine synthetase A  24.93 
 
 		 361 aa  82.8  0.000000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1232  D-alanyl-alanine synthetase A  25.28 
 
 		 366 aa  82.8  0.000000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0514331  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0325  D-alanine--D-alanine ligase  32.99 
 
 		 306 aa  82.8  0.000000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0370314  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0422  D-alanyl-alanine synthetase A  26.91 
 
 		 364 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.947692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0434  D-alanyl-alanine synthetase A  26.91 
 
 		 364 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0552987  normal  0.545444 
 
 
-
 
NC_004310  BR1271  D-alanyl-alanine synthetase A  25.28 
 
 		 353 aa  82.4  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2848  D-alanine--D-alanine ligase  28.51 
 
 		 308 aa  82.4  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.67822  normal  0.0145718 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2550  D-alanine--D-alanine ligase  29.85 
 
 		 319 aa  82  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.352521  normal  0.520823 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0416  D-alanyl-alanine synthetase A  26.91 
 
 		 364 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.532787  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5088  D-alanine--D-alanine ligase  29.12 
 
 		 329 aa  81.3  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3126  D-alanine--D-alanine ligase  28.1 
 
 		 327 aa  81.6  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4160  D-alanine/D-alanine ligase  27.6 
 
 		 333 aa  81.6  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.190227  normal  0.261244 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1244  D-alanine/D-alanine ligase  31.3 
 
 		 316 aa  81.3  0.00000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00234913  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1662  D-alanyl-alanine synthetase A  29.54 
 
 		 363 aa  80.5  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1426  D-alanine--D-alanine ligase  27.17 
 
 		 313 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2199  D-alanine--D-alanine ligase  26.03 
 
 		 305 aa  79.7  0.00000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.171774  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0905  D-alanyl-alanine synthetase A  27.98 
 
 		 360 aa  79.7  0.00000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3345  D-alanine/D-alanine ligase  27.63 
 
 		 366 aa  79.7  0.00000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1108  D-alanine--D-alanine ligase  30 
 
 		 308 aa  79.7  0.00000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1367  D-alanine--D-alanine ligase  28.29 
 
 		 367 aa  79.7  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5376  D-alanine/D-alanine ligase  29.66 
 
 		 350 aa  79.7  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0661  D-alanine/D-alanine ligase  26.05 
 
 		 311 aa  79  0.0000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0415  D-alanyl-alanine synthetase A  26.55 
 
 		 364 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.335332  normal  0.0242928 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1644  D-alanine--D-alanine ligase domain-containing protein  26.89 
 
 		 347 aa  79  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0173  D-alanyl-alanine synthetase A  27.55 
 
 		 364 aa  79  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0337  D-alanine/D-alanine ligase  28.18 
 
 		 322 aa  79  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1272  D-alanine--D-alanine ligase  27.97 
 
 		 368 aa  79  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.390278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0476  D-alanyl-alanine synthetase A  26.55 
 
 		 364 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0524  D-alanine--D-alanine ligase  25.94 
 
 		 329 aa  78.2  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.860729 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2342  D-alanyl-alanine synthetase A  24.66 
 
 		 358 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.958781 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1204  D-alanine--D-alanine ligase  27.83 
 
 		 301 aa  78.6  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2406  D-alanine--D-alanine ligase  28.07 
 
 		 301 aa  77.4  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.392221 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1747  D-alanine--D-alanine ligase  30.47 
 
 		 308 aa  77.4  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2665  D-alanyl-alanine synthetase A  27.31 
 
 		 364 aa  77  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3087  D-alanine--D-alanine ligase  26 
 
 		 331 aa  77  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.807087  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2535  D-alanyl-alanine synthetase A  27.31 
 
 		 364 aa  77  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3389  D-alanine--D-alanine ligase  28.02 
 
 		 329 aa  77  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.734796  hitchhiker  0.00462713 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2722  D-alanine--D-alanine ligase  26 
 
 		 331 aa  76.6  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6169  D-alanine--D-alanine ligase  29.26 
 
 		 329 aa  76.3  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0498246 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2101  D-alanyl-alanine synthetase A  25.27 
 
 		 357 aa  76.6  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0423676 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1385  D-alanine--D-alanine ligase  29.29 
 
 		 308 aa  76.6  0.0000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0464  D-alanine--D-alanine ligase  24.8 
 
 		 319 aa  75.9  0.0000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.132669 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0011  D-alanine--D-alanine ligase  23.13 
 
 		 365 aa  75.5  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.133339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3301  D-alanine--D-alanine ligase  29.9 
 
 		 308 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1077  D-alanine--D-alanine ligase  25.91 
 
 		 338 aa  75.9  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0742794  normal  0.822876 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1796  D-alanine--D-alanine ligase  26.11 
 
 		 312 aa  75.9  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1162  D-alanine--D-alanine ligase  27.03 
 
 		 360 aa  75.1  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000524603 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3590  D-alanine--D-alanine ligase  30.09 
 
 		 306 aa  75.1  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.224564  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2419  D-alanine--D-alanine ligase  31.05 
 
 		 308 aa  75.1  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000977775  normal  0.223955 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1149  D-alanine--D-alanine ligase  25.36 
 
 		 306 aa  75.1  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.927057  normal  0.917542 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1004  D-alanyl-alanine synthetase A  24.72 
 
 		 360 aa  74.7  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714352 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0661  D-alanine/D-alanine ligase  27.13 
 
 		 324 aa  74.3  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.435945  normal  0.336706 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2353  D-alanine--D-alanine ligase  29.03 
 
 		 307 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.452645 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1155  D-alanine--D-alanine ligase  28.76 
 
 		 309 aa  74.3  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.112058  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3660  D-alanine--D-alanine ligase  28.33 
 
 		 322 aa  73.9  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.345164 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>