More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3593 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_3593  60 kDa inner membrane insertion protein  100 
 
 
318 aa  651    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.694867  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9387  Preprotein translocase subunit YidC-like protein  70.13 
 
 
316 aa  441  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171326  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3114  hypothetical protein  49.84 
 
 
308 aa  317  2e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00051538  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4865  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  49.52 
 
 
314 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00439173  hitchhiker  0.00579415 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4982  60 kDa inner membrane insertion protein  47.6 
 
 
351 aa  275  6e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2158  60 kDa inner membrane insertion protein  42.24 
 
 
315 aa  227  2e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5093  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  42.05 
 
 
385 aa  200  3e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5108  60 kDa inner membrane insertion protein  33.43 
 
 
338 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.3246  unclonable  0.0000000218761 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6484  60 kDa inner membrane insertion protein  34.02 
 
 
366 aa  182  5.0000000000000004e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0489623  normal  0.0985763 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4545  60 kDa inner membrane insertion protein  36.59 
 
 
462 aa  181  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.374078  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7338  60 kDa inner membrane insertion protein  38.17 
 
 
461 aa  181  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.655276  normal  0.710284 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38030  preprotein translocase subunit YidC  34.47 
 
 
365 aa  181  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4697  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.74 
 
 
363 aa  179  4.999999999999999e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.164692  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2731  60 kDa inner membrane insertion protein  35.79 
 
 
334 aa  178  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.450801  normal  0.193827 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3727  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  35.09 
 
 
384 aa  178  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0259418 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7097  60 kDa inner membrane insertion protein  38.01 
 
 
358 aa  176  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.123004  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9053  60 kDa inner membrane insertion protein  34.6 
 
 
328 aa  176  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0282585  normal  0.514683 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4222  60 kDa inner membrane insertion protein  37.63 
 
 
382 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127281  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4510  60 kDa inner membrane insertion protein  35.69 
 
 
337 aa  174  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00390743 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4590  60 kDa inner membrane insertion protein  33.64 
 
 
370 aa  172  5e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000213459  hitchhiker  0.000511998 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31950  preprotein translocase subunit YidC  36.73 
 
 
366 aa  170  3e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2555  60 kDa inner membrane insertion protein  32.69 
 
 
315 aa  169  8e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000456374  normal  0.353956 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3376  60 kDa inner membrane insertion protein  32.29 
 
 
314 aa  166  4e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3934  60 kDa inner membrane insertion protein  33.58 
 
 
324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000149067 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4169  60 kDa inner membrane insertion protein  33.94 
 
 
324 aa  160  4e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.746972  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27010  preprotein translocase subunit YidC  35.74 
 
 
350 aa  158  1e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2751  60 kDa inner membrane insertion protein  33.98 
 
 
266 aa  149  6e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00963122 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5412  60 kDa inner membrane insertion protein  34.73 
 
 
385 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13956  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.66 
 
 
366 aa  145  1e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23450  preprotein translocase subunit YidC  36.7 
 
 
332 aa  144  1e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4861  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  32.26 
 
 
411 aa  145  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0831  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.41 
 
 
376 aa  142  6e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.983915 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39770  preprotein translocase subunit YidC  31.4 
 
 
346 aa  142  7e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00795721  normal  0.66233 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6075  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.33 
 
 
374 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0948503  normal  0.176118 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3047  60 kDa inner membrane insertion protein  31.34 
 
 
275 aa  140  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000560041  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4240  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  31.23 
 
 
390 aa  137  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.148163  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5786  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.25 
 
 
367 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411114  normal  0.0214928 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5410  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.25 
 
 
367 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0005  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.25 
 
 
367 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.118578  normal  0.0820348 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3213  protein translocase subunit yidC  34.8 
 
 
278 aa  130  3e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1439  preprotein translocase subunit  30.19 
 
 
335 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4620  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.89 
 
 
581 aa  122  6e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52450  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.98 
 
 
557 aa  122  7e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0448  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.42 
 
 
544 aa  122  9e-27  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1908  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  31.48 
 
 
287 aa  121  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.339589  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6369  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.1 
 
 
578 aa  119  6e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0133  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.65 
 
 
541 aa  119  7e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0580569  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73410  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.1 
 
 
578 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.431479  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2085  60 kDa inner membrane insertion protein  31.23 
 
 
557 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.39067  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3617  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.4 
 
 
577 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.320662 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2597  60 kDa inner membrane insertion protein  31.22 
 
 
553 aa  115  7.999999999999999e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0006  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.37 
 
 
560 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000387778 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1967  YidC translocase/secretase  32.02 
 
 
548 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.537012  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2760  60 kDa inner membrane insertion protein  33.33 
 
 
341 aa  115  8.999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000644122  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5309  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.37 
 
 
560 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.910149  normal  0.0868042 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5213  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.37 
 
 
560 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5444  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.37 
 
 
560 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.79 
 
 
575 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2514  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.86 
 
 
541 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130871  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4485  60 kDa inner membrane insertion protein  30.52 
 
 
551 aa  114  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00386094  hitchhiker  0.00000000260158 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  32.88 
 
 
542 aa  113  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2600  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  31.89 
 
 
567 aa  113  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.417089 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1393  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  31.3 
 
 
532 aa  114  3e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3895  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.18 
 
 
567 aa  114  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.676329  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4201  protein translocase subunit yidC  29.81 
 
 
547 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.017626 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0003  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.49 
 
 
541 aa  113  4.0000000000000004e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0110357  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5947  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  33.48 
 
 
309 aa  113  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_3334  Oxa1 family transporter: 60 KD inner membrane protein OxaA-like protein  33.19 
 
 
271 aa  113  5e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.890029  normal  0.0824042 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2394  protein translocase subunit yidC  32.26 
 
 
536 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000698908  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5743  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.98 
 
 
560 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00528765  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0888  60 kDa inner membrane insertion protein  32.57 
 
 
539 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00675947 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1196  60 kDa inner membrane insertion protein  33.33 
 
 
313 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000975332  decreased coverage  0.000283466 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.25 
 
 
553 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9905  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2521  protein translocase subunit yidC  36.16 
 
 
225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0677656  hitchhiker  0.0000441825 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1254  60 kDa inner membrane insertion protein  27.49 
 
 
628 aa  111  2.0000000000000002e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000727923  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0049  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  27.6 
 
 
337 aa  110  3e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0578  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.52 
 
 
600 aa  110  4.0000000000000004e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.1977  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.29 
 
 
584 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0662479 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3866  60 kDa inner membrane insertion protein  31.23 
 
 
542 aa  109  5e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000155519  unclonable  0.00000398144 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5612  inner membrane protein, 60 kDa  30.65 
 
 
562 aa  109  6e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5134  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.24 
 
 
563 aa  109  6e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3458  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.17 
 
 
554 aa  109  6e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3757  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.17 
 
 
554 aa  109  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2930  hypothetical protein  32.27 
 
 
556 aa  109  7.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3074  hypothetical protein  32.27 
 
 
556 aa  109  8.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4063  60 kDa inner membrane insertion protein  30.83 
 
 
542 aa  107  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000239208  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2388  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.88 
 
 
566 aa  107  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00758023  hitchhiker  0.00000120585 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2882  protein translocase subunit yidC  30.98 
 
 
562 aa  107  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.208936  normal  0.460711 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4385  60 kDa inner membrane insertion protein  31.37 
 
 
559 aa  106  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234218 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3339  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.41 
 
 
595 aa  106  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.978164  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3825  protein translocase subunit yidC  31.54 
 
 
553 aa  106  5e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6520  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.24 
 
 
555 aa  105  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3154  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.24 
 
 
553 aa  105  8e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000638548 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4312  60 kDa inner membrane insertion protein  29.92 
 
 
543 aa  105  8e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.301696  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3215  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.24 
 
 
554 aa  105  8e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15042  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0009  inner membrane protein, 60 kDa  30.43 
 
 
541 aa  105  8e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000942032  hitchhiker  0.000799802 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23580  60 kDa inner membrane insertion protein  30.8 
 
 
217 aa  105  9e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00201404  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3181  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.24 
 
 
553 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.118061 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4242  60 kDa inner membrane insertion protein  28.79 
 
 
571 aa  105  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00149519  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3542  YidC translocase/secretase  27.91 
 
 
569 aa  105  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>